seq1 = pF1KE9574.tfa, 1050 bp
seq2 = pF1KE9574/gi568815579f_47219782.tfa (gi568815579f:47219782_47420827), 201046 bp

>pF1KE9574 1050
>gi568815579f:47219782_47420827 (Chr19)

1-1050  (99998-101046)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACTCCTTCAATTATACCACCCCTGATTATGGGCACTATGATGACAA
        | |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 AGG ACTCCTTCAATTATACCACCCCTGATTATGGGCACTATGATGACAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGATACCCTGGACCTCAACACCCCTGTGGATAAAACTTCTAACACGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100047 GGATACCCTGGACCTCAACACCCCTGTGGATAAAACTTCTAACACGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGTTCCAGACATCCTGGCCTTGGTCATCTTTGCAGTCGTCTTCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100097 GTGTTCCAGACATCCTGGCCTTGGTCATCTTTGCAGTCGTCTTCCTGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGAGTGCTGGGCAATGCCCTGGTGGTCTGGGTGACGGCATTCGAGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100147 GGAGTGCTGGGCAATGCCCTGGTGGTCTGGGTGACGGCATTCGAGGCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGGACCATCAATGCCATCTGGTTCCTCAACTTGGCGGTAGCCGACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100197 GCGGACCATCAATGCCATCTGGTTCCTCAACTTGGCGGTAGCCGACTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTCCTGCCTGGCGCTGCCCATCTTGTTCACGTCCATTGTACAGCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100247 TCTCCTGCCTGGCGCTGCCCATCTTGTTCACGTCCATTGTACAGCATCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CACTGGCCCTTTGGCGGGGCCGCCTGCAGCATCCTGCCCTCCCTCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100297 CACTGGCCCTTTGGCGGGGCCGCCTGCAGCATCCTGCCCTCCCTCATCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTCAACATGTACGCCAGCATCCTGCTCCTGGCCACCATCAGCGCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100347 GCTCAACATGTACGCCAGCATCCTGCTCCTGGCCACCATCAGCGCCGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTTTCTGCTGGTGTTCAAACCCATCTGGTGCCAGAACTTCCGAGGGGCC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100397 GCTTTCTGCTGGTGTTTAAACCCATCTGGTGCCAGAACTTCCGAGGGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCTTGGCCTGGATCGCCTGTGCCGTGGCTTGGGGTTTAGCCCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100447 GGCTTGGCCTGGATCGCCTGTGCCGTGGCTTGGGGTTTAGCCCTGCTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GACCATACCCTCCTTCCTGTACCGGGTGGTCCGGGAGGAGTACTTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100497 GACCATACCCTCCTTCCTGTACCGGGTGGTCCGGGAGGAGTACTTTCCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAAAGGTGTTGTGTGGCGTGGACTACAGCCACGACAAACGGCGGGAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100547 CAAAGGTGTTGTGTGGCGTGGACTACAGCCACGACAAACGGCGGGAGCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCGTGGCCATCGTCCGGCTGGTCCTGGGCTTCCTGTGGCCTCTACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100597 GCCGTGGCCATCGTCCGGCTGGTCCTGGGCTTCCTGTGGCCTCTACTCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTCACGATTTGTTACACTTTCATCCTGCTCCGGACGTGGAGCCGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100647 GCTCACGATTTGTTACACTTTCATCCTGCTCCGGACGTGGAGCCGCAGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCACGCGGTCCACCAAGACACTCAAGGTGGTGGTGGCAGTGGTGGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100697 CCACGCGGTCCACCAAGACACTCAAGGTGGTGGTGGCAGTGGTGGCCAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTTTATCTTCTGGTTGCCCTACCAGGTGACGGGGATAATGATGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100747 TTCTTTATCTTCTGGTTGCCCTACCAGGTGACGGGGATAATGATGTCCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTGGAGCCATCGTCACCCACCTTCCTGCTGCTGAATAAGCTGGACTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100797 CCTGGAGCCATCGTCACCCACCTTCCTGCTGCTGAAGAAGCTGGACTCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTGTGTCTCCTTTGCCTACATCAACTGCTGCATCAACCCCATCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100847 TGTGTGTCTCCTTTGCCTACATCAACTGCTGCATCAACCCCATCATCTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTGGTGGCCGGCCAGGGCTTCCAGGGCCGACTGCGGAAATCCCTCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100897 GTGGTGGCCGGCCAGGGCTTCCAGGGCCGACTGCGGAAATCCCTCCCCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCTCCTCCGGAACGTGTTGACTGAAGAGTCCGTGGTTAGGGAGAGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100947 CCTCCTCCGGAACGTGTTGACTGAAGAGTCCGTGGTTAGGGAGAGCAAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CATTCACGCGCTCCACAGTGGACACTATGGCCCAGAAGACCCAGGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100997 CATTCACGCGCTCCACAGTGGACACTATGGCCCAGAAGACCCAGGCAGTG