seq1 = pF1KE9573.tfa, 1422 bp
seq2 = pF1KE9573/gi568815591r_93326359.tfa (gi568815591r:93326359_93586981), 260623 bp

>pF1KE9573 1422
>gi568815591r:93326359_93586981 (Chr7)

(complement)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-205  (107475-107628)   100% ->
206-316  (109314-109424)   100% ->
317-429  (114495-114607)   99% ->
430-521  (118176-118267)   100% ->
522-648  (126035-126161)   100% ->
649-802  (143225-143378)   100% ->
803-863  (148712-148772)   100% ->
864-930  (148856-148922)   100% ->
931-1149  (150812-151030)   100% ->
1150-1191  (152688-152729)   100% ->
1192-1422  (160393-160623)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGTTCACATTTACAAGCCGGTGCTTGGCACTGTTTCTTCTTCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGTTCACATTTACAAGCCGGTGCTTGGCACTGTTTCTTCTTCTAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 T         CACCCAACCCCAATTCTTCCTGCCTTTTCAAATCAAACCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTA...CAGCACCCAACCCCAATTCTTCCTGCCTTTTCAAATCAAACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATCCAACAATAGAGCCCAAGCCATTTCTTTACGTCGTAGGACGAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107515 ATCCAACAATAGAGCCCAAGCCATTTCTTTACGTCGTAGGACGAAAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGATGGATGCACAGTACAAATGCTATGACCGAATGCAGCAGTTACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107565 ATGATGGATGCACAGTACAAATGCTATGACCGAATGCAGCAGTTACCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATACCAAGGAGAAG         GTCCATATTGCAATCGCACCTGGGATG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 107615 ATACCAAGGAGAAGGTA...CAGGTCCATATTGCAATCGCACCTGGGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GATGGCTGTGCTGGGATGACACACCGGCTGGAGTATTGTCCTATCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109341 GATGGCTGTGCTGGGATGACACACCGGCTGGAGTATTGTCCTATCAGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCCCAGATTATTTTCCGGATTTTGATCCATCAG         AAAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 109391 TGCCCAGATTATTTTCCGGATTTTGATCCATCAGGTA...CAGAAAAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TACAAAATACTGTGATGAAAAAGGTGTTTGGTTCAAACATCCTGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 114502 TACAAAATACTGTGATGAAAAAGGTGTTTGGTTTAAACATCCTGAAAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCGAACCTGGTCCAACTATACTATGTGCAATGCTTTCACTCCTGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114552 ATCGAACCTGGTCCAACTATACTATGTGCAATGCTTTCACTCCTGAGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGAAG         AATGCATATGTTCTGTACTATTTGGCTATTGTGGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114602 CTGAAGGTA...CAGAATGCATATGTTCTGTACTATTTGGCTATTGTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCATTCTTTGTCAATTTTCACCCTAGTGATTTCCCTGGGGATTTTCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118211 TCATTCTTTGTCAATTTTCACCCTAGTGATTTCCCTGGGGATTTTCGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTTTCAG         GAGCCTTGGCTGCCAAAGGGTAACCCTGCACAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118261 TTTTCAGGTA...CAGGAGCCTTGGCTGCCAAAGGGTAACCCTGCACAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AACATGTTTCTTACTTACATTCTGAATTCTATGATTATCATCATCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126069 AACATGTTTCTTACTTACATTCTGAATTCTATGATTATCATCATCCACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGTTGAAGTAGTACCCAATGGAGAGCTCGTGCGAAGGGACCCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 126119 GGTTGAAGTAGTACCCAATGGAGAGCTCGTGCGAAGGGACCCGGTA...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    649   GTGAGCTGCAAGATTTTGCATTTTTTCCACCAGTACATGATGGCCTGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143223 AGGTGAGCTGCAAGATTTTGCATTTTTTCCACCAGTACATGATGGCCTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AACTATTTCTGGATGCTCTGTGAAGGGATCTATCTTCATACACTCATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143273 AACTATTTCTGGATGCTCTGTGAAGGGATCTATCTTCATACACTCATTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CGTGGCTGTGTTTACTGAGAAGCAACGCTTGCGGTGGTATTATCTCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143323 CGTGGCTGTGTTTACTGAGAAGCAACGCTTGCGGTGGTATTATCTCTTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCTGGG         GGTTCCCGCTGGTGCCAACCACTATCCATGCTATT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143373 GCTGGGGTA...TAGGGTTCCCGCTGGTGCCAACCACTATCCATGCTATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ACCAGGGCCGTGTACTTCAATGACAA         CTGCTGGCTGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 148747 ACCAGGGCCGTGTACTTCAATGACAAGTA...CAGCTGCTGGCTGAGTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGAAACCCATTTGCTTTACATAATCCATGGACCTGTCATGGCGGCACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148871 GGAAACCCATTTGCTTTACATAATCCATGGACCTGTCATGGCGGCACTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TG         GTCAATTTCTTCTTTTTGCTCAACATTGTCCGGGTGCTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148921 TGGTG...CAGGTCAATTTCTTCTTTTTGCTCAACATTGTCCGGGTGCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GTGACCAAAATGAGGGAAACCCATGAGGCGGAATCCCACATGTACCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150851 GTGACCAAAATGAGGGAAACCCATGAGGCGGAATCCCACATGTACCTGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GGCTGTGAAGGCCACCATGATCCTTGTGCCCCTGCTGGGAATCCAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150901 GGCTGTGAAGGCCACCATGATCCTTGTGCCCCTGCTGGGAATCCAGTTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TCGTCTTTCCCTGGAGACCTTCCAACAAGATGCTTGGGAAGATATATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150951 TCGTCTTTCCCTGGAGACCTTCCAACAAGATGCTTGGGAAGATATATGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TACGTGATGCACTCTCTGATTCATTTCCAG         GGCTTCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 151001 TACGTGATGCACTCTCTGATTCATTTCCAGGTA...TAGGGCTTCTTTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TGCGACCATCTACTGCTTCTGCAACAATGAG         GTCCAAACCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 152699 TGCGACCATCTACTGCTTCTGCAACAATGAGGTA...CAGGTCCAAACCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CCGTGAAGCGCCAATGGGCCCAATTCAAAATTCAGTGGAACCAGCGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160403 CCGTGAAGCGCCAATGGGCCCAATTCAAAATTCAGTGGAACCAGCGTTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GGGAGGCGCCCCTCCAACCGCTCTGCTCGCGCTGCAGCCGCTGCTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160453 GGGAGGCGCCCCTCCAACCGCTCTGCTCGCGCTGCAGCCGCTGCTGCGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GGCTGGCGACATCCCAATTTACATCTGCCATCAGGAGCTGAGGAATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160503 GGCTGGCGACATCCCAATTTACATCTGCCATCAGGAGCTGAGGAATGAAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CAGCCAACAACCAAGGCGAGGAGAGTGCTGAGATCATCCCTTTGAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160553 CAGCCAACAACCAAGGCGAGGAGAGTGCTGAGATCATCCCTTTGAATATC

   1500     .    :    .    :
   1402 ATAGAGCAAGAGTCATCTGCT
        |||||||||||||||||||||
 160603 ATAGAGCAAGAGTCATCTGCT