seq1 = pF1KE9571.tfa, 1224 bp
seq2 = pF1KE9571/gi568815590r_37865264.tfa (gi568815590r:37865264_38066469), 201206 bp

>pF1KE9571 1224
>gi568815590r:37865264_38066469 (Chr8)

(complement)

1-1205  (100001-101205)   100% ->
1206-1224  (102231-102249)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCCGTGGCCTCACGAGAACAGCTCTCTTGCCCCATGGCCGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCCGTGGCCTCACGAGAACAGCTCTCTTGCCCCATGGCCGGACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCACCCTGGCGCCCAATACCGCCAACACCAGTGGGCTGCCAGGGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCACCCTGGCGCCCAATACCGCCAACACCAGTGGGCTGCCAGGGGTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTGGGAGGCGGCCCTAGCCGGGGCCCTGCTGGCGCTGGCGGTGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGTGGGAGGCGGCCCTAGCCGGGGCCCTGCTGGCGCTGGCGGTGCTGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCGTGGGAGGCAACCTGCTGGTCATCGTGGCCATCGCCTGGACTCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCGTGGGAGGCAACCTGCTGGTCATCGTGGCCATCGCCTGGACTCCGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACTCCAGACCATGACCAACGTGTTCGTGACTTCGCTGGCCGCAGCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACTCCAGACCATGACCAACGTGTTCGTGACTTCGCTGGCCGCAGCCGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTGATGGGACTCCTGGTGGTGCCGCCGGCGGCCACCTTGGCGCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTGATGGGACTCCTGGTGGTGCCGCCGGCGGCCACCTTGGCGCTGACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCCACTGGCCGTTGGGCGCCACTGGCTGCGAGCTGTGGACCTCGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCCACTGGCCGTTGGGCGCCACTGGCTGCGAGCTGTGGACCTCGGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGTGCTGTGTGTGACCGCCAGCATCGAAACCCTGTGCGCCCTGGCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGTGCTGTGTGTGACCGCCAGCATCGAAACCCTGTGCGCCCTGGCCGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCGCTACCTGGCTGTGACCAACCCGCTGCGTTACGGCGCACTGGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCGCTACCTGGCTGTGACCAACCCGCTGCGTTACGGCGCACTGGTCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGCGCTGCGCCCGGACAGCTGTGGTCCTGGTGTGGGTCGTGTCGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGCGCTGCGCCCGGACAGCTGTGGTCCTGGTGTGGGTCGTGTCGGCCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGTGTCGTTTGCGCCCATCATGAGCCAGTGGTGGCGCGTAGGGGCCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGTGTCGTTTGCGCCCATCATGAGCCAGTGGTGGCGCGTAGGGGCCGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGAGGCGCAGCGCTGCCACTCCAACCCGCGCTGCTGTGCCTTCGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCGAGGCGCAGCGCTGCCACTCCAACCCGCGCTGCTGTGCCTTCGCCTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AACATGCCCTACGTGCTGCTGTCCTCCTCCGTCTCCTTCTACCTTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AACATGCCCTACGTGCTGCTGTCCTCCTCCGTCTCCTTCTACCTTCCTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCTCGTGATGCTCTTCGTCTACGCGCGGGTTTTCGTGGTGGCTACGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCTCGTGATGCTCTTCGTCTACGCGCGGGTTTTCGTGGTGGCTACGCGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCTGCGCTTGCTGCGCGGGGAGCTGGGCCGCTTTCCGCCCGAGGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCTGCGCTTGCTGCGCGGGGAGCTGGGCCGCTTTCCGCCCGAGGAGTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCGCCGGCGCCGTCGCGCTCTCTGGCCCCGGCCCCGGTGGGGACGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCGCCGGCGCCGTCGCGCTCTCTGGCCCCGGCCCCGGTGGGGACGTGCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCCGCCCGAAGGGGTGCCCGCCTGCGGCCGGCGGCCCGCGCGCCTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCCGCCCGAAGGGGTGCCCGCCTGCGGCCGGCGGCCCGCGCGCCTCCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTCTCCGGGAACACCGGGCCCTGTGCACCTTGGGTCTCATCATGGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTCTCCGGGAACACCGGGCCCTGTGCACCTTGGGTCTCATCATGGGCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTCACTCTCTGCTGGTTGCCCTTCTTTCTGGCCAACGTGCTGCGCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCACTCTCTGCTGGTTGCCCTTCTTTCTGGCCAACGTGCTGCGCGCCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGGGGGCCCCTCTCTAGTCCCGGGCCCGGCTTTCCTTGCCCTGAACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGGGGGCCCCTCTCTAGTCCCGGGCCCGGCTTTCCTTGCCCTGAACTGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TAGGTTATGCCAATTCTGCCTTCAACCCGCTCATCTACTGCCGCAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TAGGTTATGCCAATTCTGCCTTCAACCCGCTCATCTACTGCCGCAGCCCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GACTTTCGCAGCGCCTTCCGCCGTCTTCTGTGCCGCTGCGGCCGTCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GACTTTCGCAGCGCCTTCCGCCGTCTTCTGTGCCGCTGCGGCCGTCGCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GCCTCCGGAGCCCTGCGCCGCCGCCCGCCCGGCCCTCTTCCCCTCGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GCCTCCGGAGCCCTGCGCCGCCGCCCGCCCGGCCCTCTTCCCCTCGGGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTCCTGCGGCCCGGAGCAGCCCAGCGCAGCCCAGGCTTTGCCAACGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTCCTGCGGCCCGGAGCAGCCCAGCGCAGCCCAGGCTTTGCCAACGGCTC

   1200     .    :    .    :    .    :
   1201 GACGG         GGCTTCTTGGGGAGTTTCT
        |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101201 GACGGGTA...CAGGGCTTCTTGGGGAGTTTCT