seq1 = pF1KE9531.tfa, 885 bp
seq2 = pF1KE9531/gi568815588f_84145091.tfa (gi568815588f:84145091_84358636), 213546 bp

>pF1KE9531 885
>gi568815588f:84145091_84358636 (Chr10)

1-79  (100001-100079)   97% ->
80-236  (102501-102657)   100% ->
237-370  (103820-103953)   100% ->
371-524  (107767-107920)   99% ->
525-642  (109236-109353)   100% ->
643-756  (112803-112916)   100% ->
757-885  (113418-113546)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAGACCAGTGCCTTGCCCACCGGCTTCGGGGAGCTCGAGGTGCT
        |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAGACCAGTGCCCTGCCCACTGGCTTCGGGGAGCTCGAGGTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGTGGGGATGGTGCTACTGGTGGAAG         CTCTCTCCGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 GGCTGTGGGGATGGTGCTACTGGTGGAAGGTG...CAGCTCTCTCCGGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAGCCTCAATACCCTGACCATCTTCTCTTTCTGCAAGACCCCGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102513 TCAGCCTCAATACCCTGACCATCTTCTCTTTCTGCAAGACCCCGGAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGACTCCCTGCCACCTACTGGTGCTGAGCTTGGCTCTTGCGGACAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102563 CGGACTCCCTGCCACCTACTGGTGCTGAGCTTGGCTCTTGCGGACAGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATCAGCCTGAATGCCCTCGTTGCAGCCACATCCAGCCTTCTCCG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102613 GATCAGCCTGAATGCCCTCGTTGCAGCCACATCCAGCCTTCTCCGGTA..

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    237     TGTCTCCCACAGGCGCTGGCCCTACGGCTCGGACGGCTGCCAGGCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102663 .CAGTGTCTCCCACAGGCGCTGGCCCTACGGCTCGGACGGCTGCCAGGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CACGGCTTCCAGGGCTTTGTGACAGCGTTGGCCAGCATCTGCAGCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103866 CACGGCTTCCAGGGCTTTGTGACAGCGTTGGCCAGCATCTGCAGCAGTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCCATCGCATGGGGGCGTTATCACCACTACTGCACCC         GTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103916 AGCCATCGCATGGGGGCGTTATCACCACTACTGCACCCGTA...CAGGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCCAGCTGGCCTGGAACTCAGCCGTCTCTCTGGTGCTCTTCGTGTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107770 GCCAGCTGGCCTGGAACTCAGCCGTCTCTCTGGTGCTCTTCGTGTGGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCTTCTGCCTTCTGGGCAGCTCTGCCCCTTCTGGGTTGGGGTCACTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 107820 TCTTCTGCCTTCTGGGCAGCTCTGCCCCTTCTGGGTTGGGGTCACTACGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTATGAGCCACTGGGGACATGCTGCACCCTGGACTACTCCAAGGGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107870 CTATGAGCCACTGGGGACATGCTGCACCCTGGACTACTCCAAGGGGGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 G         AAACTTCACCAGCTTCCTCTTCACCATGTCCTTCTTCAAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107920 GGTG...TAGAAACTTCACCAGCTTCCTCTTCACCATGTCCTTCTTCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTCGCCATGCCCCTCTTCATCACGATCACTTCCTACAGTCTCATGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109276 TTCGCCATGCCCCTCTTCATCACGATCACTTCCTACAGTCTCATGGAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAAACTGGGGAAGAGTGGCCATCTCCAG         GTAAACACCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 109326 GAAACTGGGGAAGAGTGGCCATCTCCAGGTA...CAGGTAAACACCACTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGCCAGCAAGGACGCTGCTGCTCGGCTGGGGCCCCTATGCCATCCTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112816 TGCCAGCAAGGACGCTGCTGCTCGGCTGGGGCCCCTATGCCATCCTGTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTATACGCAGTCATCGCAGACGTGACTTCCATCTCCCCCAAACTGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112866 CTATACGCAGTCATCGCAGACGTGACTTCCATCTCCCCCAAACTGCAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 G         GTGCCCGCCCTCATTGCCAAAATGGTGCCCACGATCAATG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112916 GGTA...CAGGTGCCCGCCCTCATTGCCAAAATGGTGCCCACGATCAATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCATCAACTATGCCCTGGGCAATGAGATGGTCTGCAGGGGAATCTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113458 CCATCAACTATGCCCTGGGCAATGAGATGGTCTGCAGGGGAATCTGGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .
    847 TGCCTCTCACCGCAGAAGAGGGAGAAGGACCGAACCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113508 TGCCTCTCACCGCAGAAGAGGGAGAAGGACCGAACCAAG