seq1 = pF1KE9519.tfa, 1074 bp
seq2 = pF1KE9519/gi568815584f_24210665.tfa (gi568815584f:24210665_24411738), 201074 bp

>pF1KE9519 1074
>gi568815584f:24210665_24411738 (Chr14)

1-1074  (100001-101074)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGTCTGCTACCGTCCCCCAGGGAACGAGACACTGCTGAGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGTCTGCTACCGTCCCCCAGGGAACGAGACACTGCTGAGCTGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACTTCGCGGGCCACAGGCACAGCCTTCCTGCTGCTGGCGGCGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACTTCGCGGGCCACAGGCACAGCCTTCCTGCTGCTGGCGGCGCTGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCTGCCTGGCAACGGCTTCGTGGTGTGGAGCTTGGCGGGCTGGCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCTGCCTGGCAACGGCTTCGTGGTGTGGAGCTTGGCGGGCTGGCGGCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCACGGGGGCGACCGCTGGCGGCCACGCTTGTGCTGCACCTGGCGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCACGGGGGCGACCGCTGGCGGCCACGCTTGTGCTGCACCTGGCGCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGACGGCGCGGTGCTGCTGCTCACGCCGCTCTTTGTGGCCTTCCTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGACGGCGCGGTGCTGCTGCTCACGCCGCTCTTTGTGGCCTTCCTGACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCAGGCCTGGCCGCTGGGCCAGGCGGGCTGCAAGGCGGTGTACTACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCAGGCCTGGCCGCTGGGCCAGGCGGGCTGCAAGGCGGTGTACTACGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGCGCGCTCAGCATGTACGCCAGCGTGCTGCTCACCGGCCTGCTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGCGCGCTCAGCATGTACGCCAGCGTGCTGCTCACCGGCCTGCTCAGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCAGCGCTGCCTCGCAGTCACCCGCCCCTTCCTGGCGCCTCGGCTGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCAGCGCTGCCTCGCAGTCACCCGCCCCTTCCTGGCGCCTCGGCTGCGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCCGGCCCTGGCCCGCCGCCTGCTGCTGGCGGTCTGGCTGGCCGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCCGGCCCTGGCCCGCCGCCTGCTGCTGGCGGTCTGGCTGGCCGCCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTGCTCGCCGTCCCGGCCGCCGTCTACCGCCACCTGTGGAGGGACCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTGCTCGCCGTCCCGGCCGCCGTCTACCGCCACCTGTGGAGGGACCGCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATGCCAGCTGTGCCACCCGTCGCCGGTCCACGCCGCCGCCCACCTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATGCCAGCTGTGCCACCCGTCGCCGGTCCACGCCGCCGCCCACCTGAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGAGACTCTGACCGCTTTCGTGCTTCCTTTCGGGCTGATGCTCGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGGAGACTCTGACCGCTTTCGTGCTTCCTTTCGGGCTGATGCTCGGCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TACAGCGTGACGCTGGCACGGCTGCGGGGCGCCCGCTGGGGCTCCGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TACAGCGTGACGCTGGCACGGCTGCGGGGCGCCCGCTGGGGCTCCGGGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCACGGGGCGCGGGTGGGCCGGCTGGTGAGCGCCATCGTGCTTGCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCACGGGGCGCGGGTGGGCCGGCTGGTGAGCGCCATCGTGCTTGCCTTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCTTGCTCTGGGCCCCCTACCACGCAGTCAACCTTCTGCAGGCGGTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCTTGCTCTGGGCCCCCTACCACGCAGTCAACCTTCTGCAGGCGGTCGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCGCTGGCTCCACCGGAAGGGGCCTTGGCGAAGCTGGGCGGAGCCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCGCTGGCTCCACCGGAAGGGGCCTTGGCGAAGCTGGGCGGAGCCGGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCGGCGCGAGCGGGAACTACGGCCTTGGCCTTCTTCAGTTCTAGCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCGGCGCGAGCGGGAACTACGGCCTTGGCCTTCTTCAGTTCTAGCGTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCCGGTGCTCTACGTCTTCACCGCTGGAGATCTGCTGCCCCGGGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCCGGTGCTCTACGTCTTCACCGCTGGAGATCTGCTGCCCCGGGCAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCCCGTTTCCTCACGCGGCTCTTCGAAGGCTCTGGGGAGGCCCGAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCCCGTTTCCTCACGCGGCTCTTCGAAGGCTCTGGGGAGGCCCGAGGGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CGGCCGCTCTAGGGAAGGGACCATGGAGCTCCGAACTACCCCTCAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CGGCCGCTCTAGGGAAGGGACCATGGAGCTCCGAACTACCCCTCAGCTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AAGTGGTGGGGCAGGGCCGCGGCAATGGAGACCCGGGGGGTGGGATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AAGTGGTGGGGCAGGGCCGCGGCAATGGAGACCCGGGGGGTGGGATGGAG

   1050     .    :    .    :
   1051 AAGGACGGTCCGGAATGGGACCTT
        ||||||||||||||||||||||||
 101051 AAGGACGGTCCGGAATGGGACCTT