seq1 = pF1KE9518.tfa, 966 bp
seq2 = pF1KE9518/gi568815587r_18833819.tfa (gi568815587r:18833819_19034784), 200966 bp

>pF1KE9518 966
>gi568815587r:18833819_19034784 (Chr11)

(complement)

1-966  (100001-100966)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCCAACCATCTCAACCTTGGACACAGAACTGACACCAATCAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCCAACCATCTCAACCTTGGACACAGAACTGACACCAATCAACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACTGAGGAGACTCTTTGCTACAAGCAGACCTTGAGCCTCACGGTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACTGAGGAGACTCTTTGCTACAAGCAGACCTTGAGCCTCACGGTGCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTGCATCGTTTCCCTTGTCGGGCTGACAGGAAACGCGGTTGTGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100101 CGTGCATCGTTTCCCTTGTCGGGCTGACAGGAAACGCAGTTGTGCTCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCCTGGGCTGCCGCATGCGCAGGAACGCCTTCTCCATCTACATCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCCTGGGCTGCCGCATGCGCAGGAACGCCTTCTCCATCTACATCCTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTGGCCGCAGCAGACTTCCTCTTCCTCAGCGGCCGCCTTATATATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTGGCCGCAGCAGACTTCCTCTTCCTCAGCGGCCGCCTTATATATTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTTAAGCTTCATCAGTATCCCCCATACCATCTCTAAAATCCTCTATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTTAAGCTTCATCAGTATCCCCCATACCATCTCTAAAATCCTCTATCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGATGATGTTTTCCTACTTTGCAGGCCTGAGCTTTCTGAGTGCCGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGATGATGTTTTCCTACTTTGCAGGCCTGAGCTTTCTGAGTGCCGTGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACCGAGCGCTGCCTGTCCGTCCTGTGGCCCATCTGGTACCGCTGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACCGAGCGCTGCCTGTCCGTCCTGTGGCCCATCTGGTACCGCTGCCACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCCCACACACCTGTCAGCGGTGGTGTGTGTCCTGCTCTGGGCCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCCCACACACCTGTCAGCGGTGGTGTGTGTCCTGCTCTGGGCCCTGTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGCTGCGGAGCATCCTGGAGTGGATGTTATGTGGCTTCCTGTTCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGCTGCGGAGCATCCTGGAGTGGATGTTATGTGGCTTCCTGTTCAGTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCTGATTCTGCTTGGTGTCAAACATCAGATTTCATCACAGTCGCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGCTGATTCTGCTTGGTGTCAAACATCAGATTTCATCACAGTCGCGTGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGATTTTTTTATGTGTGGTTCTCTGTGGGTCCAGCCTGGTCCTGCTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGATTTTTTTATGTGTGGTTCTCTGTGGGTCCAGCCTGGTCCTGCTGATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGGATTCTCTGTGGATCCCGGAAGATACCGCTGACCAGGCTGTACGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGGATTCTCTGTGGATCCCGGAAGATACCGCTGACCAGGCTGTACGTGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATCCTGCTCACAGTACTGGTCTTCCTCCTCTGTGGCCTGCCCTTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATCCTGCTCACAGTACTGGTCTTCCTCCTCTGTGGCCTGCCCTTTGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTCAGTTTTTCCTATTTTTATGGATCCACGTGGACAGGGAAGTCTTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TTCAGTTTTTCCTATTTTTATGGATCCACGTGGACAGGGAAGTCTTATTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGTCATGTTCATCTAGTTTCTATTTTCCTGTCCGCTCTTAACAGCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TGTCATGTTCATCTAGTTTCTATTTTCCTGTCCGCTCTTAACAGCAGTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAACCCCATCATTTACTTCTTCGTGGGCTCCTTTAGGCAGCGTCAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAACCCCATCATTTACTTCTTCGTGGGCTCCTTTAGGCAGCGTCAAAATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGCAGAACCTGAAGCTGGTTCTCCAGAGGGCTCTGCAGGACGCGTCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGCAGAACCTGAAGCTGGTTCTCCAGAGGGCTCTGCAGGACGCGTCTGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTGGATGAAGGTGGAGGGCAGCTTCCTGAGGAAATCCTGGAGCTGTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTGGATGAAGGTGGAGGGCAGCTTCCTGAGGAAATCCTGGAGCTGTCGGG

    950     .    :    .
    951 AAGCAGATTGGAGCAG
        ||||||||||||||||
 100951 AAGCAGATTGGAGCAG