seq1 = pF1KE9515.tfa, 1110 bp
seq2 = pF1KE9515/gi568815588r_118494135.tfa (gi568815588r:118494135_118695244), 201110 bp

>pF1KE9515 1110
>gi568815588r:118494135_118695244 (Chr10)

(complement)

1-1110  (100001-101110)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCATCGACCACTCGGGGCCCCAGGGTTTCTGACTTATTTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCATCGACCACTCGGGGCCCCAGGGTTTCTGACTTATTTTCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCCGCCGGCGGTCACAACTCCCGCCAACCAGAGCGCAGAGGCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCCGCCGGCGGTCACAACTCCCGCCAACCAGAGCGCAGAGGCCTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGGCAACGGGTCGGTGGCTGGCGCGGACGCTCCAGCCGTCACGCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGGCAACGGGTCGGTGGCTGGCGCGGACGCTCCAGCCGTCACGCCCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGAGCCTGCAGCTGGTGCATCAGCTGAAGGGGCTGATCGTGCTGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGAGCCTGCAGCTGGTGCATCAGCTGAAGGGGCTGATCGTGCTGCTCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCGTCGTGGTGGTCGTGGGGCTGGTGGGCAACTGCCTGCTGGTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCGTCGTGGTGGTCGTGGGGCTGGTGGGCAACTGCCTGCTGGTGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGATCGCGCGGGTGCGCCGGCTGCACAACGTGACGAACTTCCTCATCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGATCGCGCGGGTGCGCCGGCTGCACAACGTGACGAACTTCCTCATCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACCTGGCCTTGTCCGACGTGCTCATGTGCACCGCCTGCGTGCCGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACCTGGCCTTGTCCGACGTGCTCATGTGCACCGCCTGCGTGCCGCTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGGCCTATGCCTTCGAGCCACGCGGCTGGGTGTTCGGCGGCGGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGGCCTATGCCTTCGAGCCACGCGGCTGGGTGTTCGGCGGCGGCCTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCACCTGGTCTTCTTCCTGCAGCCGGTCACCGTCTATGTGTCGGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCACCTGGTCTTCTTCCTGCAGCCGGTCACCGTCTATGTGTCGGTGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACGCTCACCACCATCGCAGTGGACCGCTACGTCGTGCTGGTGCACCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACGCTCACCACCATCGCAGTGGACCGCTACGTCGTGCTGGTGCACCCGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAGGCGGCGCATCTCGCTGCGCCTCAGCGCCTACGCTGTGCTGGCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAGGCGGCGCATCTCGCTGCGCCTCAGCGCCTACGCTGTGCTGGCCATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGGCGCTGTCCGCGGTGCTGGCGCTGCCCGCCGCCGTGCACACCTATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGGCGCTGTCCGCGGTGCTGGCGCTGCCCGCCGCCGTGCACACCTATCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGGAGCTCAAGCCGCACGACGTGCGCCTCTGCGAGGAGTTCTGGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGGAGCTCAAGCCGCACGACGTGCGCCTCTGCGAGGAGTTCTGGGGCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCAGGAGCGCCAGCGCCAGCTCTACGCCTGGGGGCTGCTGCTGGTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCAGGAGCGCCAGCGCCAGCTCTACGCCTGGGGGCTGCTGCTGGTCACCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACCTGCTCCCTCTGCTGGTCATCCTCCTGTCTTACGTCCGGGTGTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACCTGCTCCCTCTGCTGGTCATCCTCCTGTCTTACGTCCGGGTGTCAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGCTCCGCAACCGCGTGGTGCCGGGCTGCGTGACCCAGAGCCAGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGCTCCGCAACCGCGTGGTGCCGGGCTGCGTGACCCAGAGCCAGGCCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTGGGACCGCGCTCGGCGCCGGCGCACCTTCTGCTTGCTGGTGGTGGTCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 100801 CTGGGACCGCGCTCGGCGCCGGCGCACCTTCTGCTTGCTGGTGGTGATCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGTGGTGTTCGCCGTCTGCTGGCTGCCGCTGCACGTCTTCAACCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGTGGTGTTCGCCGTCTGCTGGCTGCCGCTGCACGTCTTCAACCTGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGGGACCTCGACCCCCACGCCATCGACCCTTACGCCTTTGGGCTGGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGGGACCTCGACCCCCACGCCATCGACCCTTACGCCTTTGGGCTGGTGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCTGCTCTGCCACTGGCTCGCCATGAGTTCGGCCTGCTACAACCCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCTGCTCTGCCACTGGCTCGCCATGAGTTCGGCCTGCTACAACCCCTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCTACGCCTGGCTGCACGACAGCTTCCGCGAGGAGCTGCGCAAACTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCTACGCCTGGCTGCACGACAGCTTCCGCGAGGAGCTGCGCAAACTGTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTCGCTTGGCCCCGCAAGATAGCCCCCCATGGCCAGAATATGACCGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTCGCTTGGCCCCGCAAGATAGCCCCCCATGGCCAGAATATGACCGTCAG

   1100     .    :
   1101 CGTGGTCATC
        ||||||||||
 101101 CGTGGTCATC