seq1 = pF1KE9511.tfa, 984 bp
seq2 = pF1KE9511/gi568815590f_52839908.tfa (gi568815590f:52839908_53040891), 200984 bp

>pF1KE9511 984
>gi568815590f:52839908_53040891 (Chr8)

1-984  (100001-100984)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAACGCCTCGTTCTCGGAGCCCTGGCCCGCCAACGCATCGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACAACGCCTCGTTCTCGGAGCCCTGGCCCGCCAACGCATCGGGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACCCGGCGCTGAGCTGCTCCAACGCGTCGACTCTGGCGCCGCTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACCCGGCGCTGAGCTGCTCCAACGCGTCGACTCTGGCGCCGCTGCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCGCTGGCGGTGGCTGTACCAGTTGTCTACGCGGTGATCTGCGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCGCTGGCGGTGGCTGTACCAGTTGTCTACGCGGTGATCTGCGCCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTCTGGCGGGCAACTCCGCCGTGCTGTACGTGTTGCTGCGGGCGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTCTGGCGGGCAACTCCGCCGTGCTGTACGTGTTGCTGCGGGCGCCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGAAGACCGTCACCAACCTGTTCATCCTCAACCTGGCCATCGCCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGAAGACCGTCACCAACCTGTTCATCCTCAACCTGGCCATCGCCGACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCTCTTCACGCTGGTGCTGCCCATCAACATCGCCGACTTCCTGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCTCTTCACGCTGGTGCTGCCCATCAACATCGCCGACTTCCTGCTGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGTGGCCCTTCGGGGAGCTCATGTGCAAGCTCATCGTGGCTATCGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGTGGCCCTTCGGGGAGCTCATGTGCAAGCTCATCGTGGCTATCGACCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTACAACACCTTCTCCAGCCTCTACTTCCTCACCGTCATGAGCGCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTACAACACCTTCTCCAGCCTCTACTTCCTCACCGTCATGAGCGCCGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTACCTGGTGGTGTTGGCCACTGCGGAGTCGCGCCGGGTGGCCGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTACCTGGTGGTGTTGGCCACTGCGGAGTCGCGCCGGGTGGCCGGCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACCTACAGCGCCGCGCGCGCGGTGAGCCTGGCCGTGTGGGGGATCGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACCTACAGCGCCGCGCGCGCGGTGAGCCTGGCCGTGTGGGGGATCGTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACTCGTCGTGCTGCCCTTCGCAGTCTTCGCCCGGCTAGACGACGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACTCGTCGTGCTGCCCTTCGCAGTCTTCGCCCGGCTAGACGACGAGCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCGGCGCCAGTGCGTGCTAGTCTTTCCGCAGCCCGAGGCCTTCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCGGCGCCAGTGCGTGCTAGTCTTTCCGCAGCCCGAGGCCTTCTGGTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGCGCGAGCCGCCTCTACACGCTCGTGCTGGGCTTCGCCATCCCCGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGCGCGAGCCGCCTCTACACGCTCGTGCTGGGCTTCGCCATCCCCGTGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACCATCTGTGTCCTCTATACCACCCTGCTGTGCCGGCTGCATGCCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CACCATCTGTGTCCTCTATACCACCCTGCTGTGCCGGCTGCATGCCATGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGCTGGACAGCCACGCCAAGGCCCTGGAGCGCGCCAAGAAGCGGGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGCTGGACAGCCACGCCAAGGCCCTGGAGCGCGCCAAGAAGCGGGTGACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCCTGGTGGTGGCAATCCTGGCGGTGTGCCTCCTCTGCTGGACGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCCTGGTGGTGGCAATCCTGGCGGTGTGCCTCCTCTGCTGGACGCCCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCACCTGAGCACCGTGGTGGCGCTCACCACCGACCTCCCGCAGACGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCACCTGAGCACCGTGGTGGCGCTCACCACCGACCTCCCGCAGACGCCGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGTCATCGCTATCTCCTACTTCATCACCAGCCTGAGCTACGCCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGTCATCGCTATCTCCTACTTCATCACCAGCCTGAGCTACGCCAACAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TGCCTCAACCCCTTCCTCTACGCCTTCCTGGACGCCAGCTTCCGCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TGCCTCAACCCCTTCCTCTACGCCTTCCTGGACGCCAGCTTCCGCAGGAA

    950     .    :    .    :    .    :
    951 CCTCCGCCAGCTGATAACTTGCCGCGCGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCTCCGCCAGCTGATAACTTGCCGCGCGGCAGCC