seq1 = pF1KE9510.tfa, 1437 bp
seq2 = pF1KE9510/gi568815587r_46285121.tfa (gi568815587r:46285121_46486557), 201437 bp

>pF1KE9510 1437
>gi568815587r:46285121_46486557 (Chr11)

(complement)

1-1437  (100001-101437)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAACTTCACACCTGTCAATGGCAGCTCGGGCAATCAGTCCGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAACTTCACACCTGTCAATGGCAGCTCGGGCAATCAGTCCGTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGTCACGTCATCATCCCACAATCGCTATGAGACGGTGGAAATGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGTCACGTCATCATCCCACAATCGCTATGAGACGGTGGAAATGGTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATTGCCACAGTGACAGGCTCCCTGAGCCTGGTGACTGTCGTGGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCATTGCCACAGTGACAGGCTCCCTGAGCCTGGTGACTGTCGTGGGCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCCTGGTGATGCTGTCCATCAAGGTCAACAGGCAGCTGCAGACAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCCTGGTGATGCTGTCCATCAAGGTCAACAGGCAGCTGCAGACAGTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACTACTTCCTCTTCAGCCTGGCGTGTGCTGATCTCATCATAGGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACTACTTCCTCTTCAGCCTGGCGTGTGCTGATCTCATCATAGGCGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTCCATGAACCTCTACACCGTGTACATCATCAAGGGCTACTGGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTCCATGAACCTCTACACCGTGTACATCATCAAGGGCTACTGGCCCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCGCCGTGGTCTGCGACCTGTGGCTGGCCCTGGACTACGTGGTGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCGCCGTGGTCTGCGACCTGTGGCTGGCCCTGGACTACGTGGTGAGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCCTCCGTCATGAACCTTCTCATCATCAGCTTTGACCGCTACTTCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCCTCCGTCATGAACCTTCTCATCATCAGCTTTGACCGCTACTTCTGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCACCAAGCCTCTCACCTACCCTGCCCGGCGCACCACCAAGATGGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCACCAAGCCTCTCACCTACCCTGCCCGGCGCACCACCAAGATGGCAGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCATGATTGCTGCTGCCTGGGTACTGTCCTTCGTGCTCTGGGCGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCATGATTGCTGCTGCCTGGGTACTGTCCTTCGTGCTCTGGGCGCCTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATCTTGTTCTGGCAGTTTGTGGTGGGTAAGCGGACGGTGCCCGACAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATCTTGTTCTGGCAGTTTGTGGTGGGTAAGCGGACGGTGCCCGACAACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGTGCTTCATCCAGTTCCTGTCCAACCCAGCAGTGACCTTTGGCACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGTGCTTCATCCAGTTCCTGTCCAACCCAGCAGTGACCTTTGGCACAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTGCTGCCTTCTACCTGCCTGTGGTCATCATGACGGTGCTGTACATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTGCTGCCTTCTACCTGCCTGTGGTCATCATGACGGTGCTGTACATCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATCTCCCTGGCCAGTCGCAGCCGAGTCCACAAGCACCGGCCCGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATCTCCCTGGCCAGTCGCAGCCGAGTCCACAAGCACCGGCCCGAGGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CGAAGGAGAAGAAAGCCAAGACGCTGGCCTTCCTCAAGAGCCCACTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CGAAGGAGAAGAAAGCCAAGACGCTGGCCTTCCTCAAGAGCCCACTAATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGCAGAGCGTCAAGAAGCCCCCGCCCGGGGAGGCCGCCCGGGAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGCAGAGCGTCAAGAAGCCCCCGCCCGGGGAGGCCGCCCGGGAGGAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCGCAATGGCAAGCTGGAGGAGGCCCCCCCGCCAGCGCTGCCACCGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCGCAATGGCAAGCTGGAGGAGGCCCCCCCGCCAGCGCTGCCACCGCCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CGCGCCCCGTGGCTGATAAGGACACTTCCAATGAGTCCAGCTCAGGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CGCGCCCCGTGGCTGATAAGGACACTTCCAATGAGTCCAGCTCAGGCAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCACCCAGAACACCAAGGAACGCCCAGCCACAGAGCTGTCCACCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCACCCAGAACACCAAGGAACGCCCAGCCACAGAGCTGTCCACCACAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGCCACCACGCCCGCCATGCCCGCCCCTCCCCTGCAGCCGCGGGCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGCCACCACGCCCGCCATGCCCGCCCCTCCCCTGCAGCCGCGGGCCCTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACCCAGCCTCCAGATGGTCCAAGATCCAGATTGTGACGAAGCAGACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACCCAGCCTCCAGATGGTCCAAGATCCAGATTGTGACGAAGCAGACAGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AATGAGTGTGTGACAGCCATTGAGATTGTGCCTGCCACGCCGGCTGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AATGAGTGTGTGACAGCCATTGAGATTGTGCCTGCCACGCCGGCTGGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GCGCCCTGCGGCCAACGTGGCCCGCAAGTTCGCCAGCATCGCTCGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GCGCCCTGCGGCCAACGTGGCCCGCAAGTTCGCCAGCATCGCTCGCAACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGGTGCGCAAGAAGCGGCAGATGGCGGCCCGGGAGCGCAAAGTGACACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGGTGCGCAAGAAGCGGCAGATGGCGGCCCGGGAGCGCAAAGTGACACGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACGATCTTTGCCATTCTGCTAGCCTTCATCCTCACCTGGACGCCCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACGATCTTTGCCATTCTGCTAGCCTTCATCCTCACCTGGACGCCCTACAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CGTCATGGTCCTGGTGAACACCTTCTGCCAGAGCTGCATCCCTGACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CGTCATGGTCCTGGTGAACACCTTCTGCCAGAGCTGCATCCCTGACACGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TGTGGTCCATTGGCTACTGGCTCTGCTACGTCAACAGCACCATCAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TGTGGTCCATTGGCTACTGGCTCTGCTACGTCAACAGCACCATCAACCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GCCTGCTATGCTCTGTGCAACGCCACCTTTAAAAAGACCTTCCGGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GCCTGCTATGCTCTGTGCAACGCCACCTTTAAAAAGACCTTCCGGCACCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .
   1401 GCTGCTGTGCCAGTATCGGAACATCGGCACTGCCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GCTGCTGTGCCAGTATCGGAACATCGGCACTGCCAGG