seq1 = pF1KE9506.tfa, 996 bp
seq2 = pF1KE9506/gi568815580r_60271354.tfa (gi568815580r:60271354_60472349), 200996 bp

>pF1KE9506 996
>gi568815580r:60271354_60472349 (Chr18)

(complement)

1-996  (100001-100996)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGAACTCCACCCACCGTGGGATGCACACTTCTCTGCACCTCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGAACTCCACCCACCGTGGGATGCACACTTCTCTGCACCTCTGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCAGCAGTTACAGACTGCACAGCAATGCCAGTGAGTCCCTTGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCAGCAGTTACAGACTGCACAGCAATGCCAGTGAGTCCCTTGGAAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTACTCTGATGGAGGGTGCTACGAGCAACTTTTTGTCTCTCCTGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTACTCTGATGGAGGGTGCTACGAGCAACTTTTTGTCTCTCCTGAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGTGACTCTGGGTGTCATCAGCTTGTTGGAGAATATCTTAGTGATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGTGACTCTGGGTGTCATCAGCTTGTTGGAGAATATCTTAGTGATTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCAATAGCCAAGAACAAGAATCTGCATTCACCCATGTACTTTTTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCAATAGCCAAGAACAAGAATCTGCATTCACCCATGTACTTTTTCATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAGCTTGGCTGTGGCTGATATGCTGGTGAGCGTTTCAAATGGATCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAGCTTGGCTGTGGCTGATATGCTGGTGAGCGTTTCAAATGGATCAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCATTGTCATCACCCTATTAAACAGTACAGATACGGATGCACAGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCATTGTCATCACCCTATTAAACAGTACAGATACGGATGCACAGAGTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACAGTGAATATTGATAATGTCATTGACTCGGTGATCTGTAGCTCCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACAGTGAATATTGATAATGTCATTGACTCGGTGATCTGTAGCTCCTTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGCATCCATTTGCAGCCTGCTTTCAATTGCAGTGGACAGGTACTTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGCATCCATTTGCAGCCTGCTTTCAATTGCAGTGGACAGGTACTTTACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCTTCTATGCTCTCCAGTACCATAACATTATGACAGTTAAGCGGGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCTTCTATGCTCTCCAGTACCATAACATTATGACAGTTAAGCGGGTTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GATCATCATAAGTTGTATCTGGGCAGCTTGCACGGTTTCAGGCATTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GATCATCATAAGTTGTATCTGGGCAGCTTGCACGGTTTCAGGCATTTTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCATCATTTACTCAGATAGTAGTGCTGTCATCATCTGCCTCATCACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCATCATTTACTCAGATAGTAGTGCTGTCATCATCTGCCTCATCACCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCTTCACCATGCTGGCTCTCATGGCTTCTCTCTATGTCCACATGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCTTCACCATGCTGGCTCTCATGGCTTCTCTCTATGTCCACATGTTCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GATGGCCAGGCTTCACATTAAGAGGATTGCTGTCCTCCCCGGCACTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GATGGCCAGGCTTCACATTAAGAGGATTGCTGTCCTCCCCGGCACTGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCATCCGCCAAGGTGCCAATATGAAGGGAGCGATTACCTTGACCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCATCCGCCAAGGTGCCAATATGAAGGGAGCGATTACCTTGACCATCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATTGGCGTCTTTGTTGTCTGCTGGGCCCCATTCTTCCTCCACTTAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATTGGCGTCTTTGTTGTCTGCTGGGCCCCATTCTTCCTCCACTTAATATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTACATCTCTTGTCCTCAGAATCCATATTGTGTGTGCTTCATGTCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTACATCTCTTGTCCTCAGAATCCATATTGTGTGTGCTTCATGTCTCACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTAACTTGTATCTCATACTGATCATGTGTAATTCAATCATCGATCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTAACTTGTATCTCATACTGATCATGTGTAATTCAATCATCGATCCTCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATTTATGCACTCCGGAGTCAAGAACTGAGGAAAACCTTCAAAGAGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATTTATGCACTCCGGAGTCAAGAACTGAGGAAAACCTTCAAAGAGATCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    951 CTGTTGCTATCCCCTGGGAGGCCTTTGTGACTTGTCTAGCAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTGTTGCTATCCCCTGGGAGGCCTTTGTGACTTGTCTAGCAGATAT