seq1 = pF1KE9453.tfa, 2730 bp
seq2 = pF1KE9453/gi568815592r_46900225.tfa (gi568815592r:46900225_47129061), 228837 bp

>pF1KE9453 2730
>gi568815592r:46900225_47129061 (Chr6)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-127  (101301-101358)   100% ->
128-277  (103059-103208)   100% ->
278-451  (104845-105018)   100% ->
452-552  (107004-107104)   100% ->
553-611  (108273-108331)   100% ->
612-763  (112294-112445)   100% ->
764-927  (114218-114381)   100% ->
928-1116  (116867-117055)   100% ->
1117-2490  (118744-120117)   100% ->
2491-2532  (121768-121809)   100% ->
2533-2592  (123186-123245)   100% ->
2593-2659  (127495-127561)   100% ->
2660-2730  (128767-128837)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGTTGGAGTGCTGTGGCTCATTTCTTTCTTCACCTTCACTGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGTTGGAGTGCTGTGGCTCATTTCTTTCTTCACCTTCACTGACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACGGTGGCTTCCTGGGG         AAAAATGATGGCATCAAAACAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 CCACGGTGGCTTCCTGGGGGTG...CAGAAAAATGATGGCATCAAAACAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAAAGAACTCATTGTGAATAAGAAAAAACATCTAG         GCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101323 AAAAAGAACTCATTGTGAATAAGAAAAAACATCTAGGTG...TAGGCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTCGAAGAATATCAGCTGCTGCTTCAGGTGACCTATAGAGATTCCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103064 GTCGAAGAATATCAGCTGCTGCTTCAGGTGACCTATAGAGATTCCAAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAAAAGAGATTTGAGAAATTTTCTGAAGCTCTTGAAGCCTCCATTATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103114 GAAAAGAGATTTGAGAAATTTTCTGAAGCTCTTGAAGCCTCCATTATTAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGTCACATGGGCTAATTAGAATTATCAGAGCAAAGGCTACCACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 103164 GGTCACATGGGCTAATTAGAATTATCAGAGCAAAGGCTACCACAGGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    278     ACTGCAACAGCCTGAATGGAGTCCTGCAGTGTACCTGTGAAGACAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103214 .CAGACTGCAACAGCCTGAATGGAGTCCTGCAGTGTACCTGTGAAGACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTACACCTGGTTTCCTCCCTCATGCCTTGATCCCCAGAACTGCTACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104891 CTACACCTGGTTTCCTCCCTCATGCCTTGATCCCCAGAACTGCTACCTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACACGGCTGGAGCACTCCCAAGCTGTGAATGTCATCTCAACAACCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104941 ACACGGCTGGAGCACTCCCAAGCTGTGAATGTCATCTCAACAACCTCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGAGTGTCAATTTCTGTGAGAGAACAA         AGATTTGGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 104991 CAGAGTGTCAATTTCTGTGAGAGAACAAGTA...CAGAGATTTGGGGCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTTCAAAATTAATGAAAGGTTTACAAATGACCTTTTGAATTCATCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107017 TTTCAAAATTAATGAAAGGTTTACAAATGACCTTTTGAATTCATCTTCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTATATACTCCAAATATGCAAATGGAATTGAAATTCAA         CTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 107067 CTATATACTCCAAATATGCAAATGGAATTGAAATTCAAGTA...AAGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAAAAAGCATATGAAAGAATTCAAGGTTTTGAGTCGGTTCAGGTCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108276 AAAAAAGCATATGAAAGAATTCAAGGTTTTGAGTCGGTTCAGGTCACCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ATTTCG         AAATGGAAGCATCGTTGCTGGGTATGAAGTTGTTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108326 ATTTCGGTA...CAGAAATGGAAGCATCGTTGCTGGGTATGAAGTTGTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GCTCCAGCAGTGCATCTGAACTGCTGTCAGCCATTGAACATGTTGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112329 GCTCCAGCAGTGCATCTGAACTGCTGTCAGCCATTGAACATGTTGCCGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAGGCTAAGACAGCCCTTCACAAGCTGTTTCCATTAGAAGACGGCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112379 AAGGCTAAGACAGCCCTTCACAAGCTGTTTCCATTAGAAGACGGCTCTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CAGAGTGTTCGGAAAAG         CCCAGTGTAATGACATTGTCTTTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 112429 CAGAGTGTTCGGAAAAGGTA...CAGCCCAGTGTAATGACATTGTCTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GATTTGGGTCCAAGGATGATGAATATACCCTGCCCTGCAGCAGTGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114242 GATTTGGGTCCAAGGATGATGAATATACCCTGCCCTGCAGCAGTGGCTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AGGGGAAACATCACAGCCAAGTGTGAGTCCTCTGGGTGGCAGGTCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114292 AGGGGAAACATCACAGCCAAGTGTGAGTCCTCTGGGTGGCAGGTCATCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGAGACTTGTGTGCTCTCTCTGCTTGAAGAACTGAACAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 114342 GGAGACTTGTGTGCTCTCTCTGCTTGAAGAACTGAACAAGGTG...TAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATTTCAGTATGATTGTAGGCAATGCCACTGAGGCAGCTGTGTCATCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116868 ATTTCAGTATGATTGTAGGCAATGCCACTGAGGCAGCTGTGTCATCCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GTGCAAAATCTTTCTGTCATCATTCGGCAAAACCCATCAACCACAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116918 GTGCAAAATCTTTCTGTCATCATTCGGCAAAACCCATCAACCACAGTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GAATCTGGCTTCGGTGGTGTCGATTCTGAGCAATATTTCATCTCTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116968 GAATCTGGCTTCGGTGGTGTCGATTCTGAGCAATATTTCATCTCTGTCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGGCCAGCCATTTCAGGGTGTCCAATTCAACAATGGAG         GAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 117018 TGGCCAGCCATTTCAGGGTGTCCAATTCAACAATGGAGGTA...CAGGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GTCATCAGTATAGCTGACAATATCCTTAATTCAGCCTCAGTAACCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118747 GTCATCAGTATAGCTGACAATATCCTTAATTCAGCCTCAGTAACCAACTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GACAGTCTTACTGCGGGAAGAAAAGTATGCCAGCTCACGGTTACTAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118797 GACAGTCTTACTGCGGGAAGAAAAGTATGCCAGCTCACGGTTACTAGAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CATTAGAAAACATCAGCACTCTGGTGCCTCCGACAGCTCTTCCTCTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118847 CATTAGAAAACATCAGCACTCTGGTGCCTCCGACAGCTCTTCCTCTGAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TTTTCTCGGAAATTCATTGACTGGAAAGGGATTCCAGTGAACAAAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118897 TTTTCTCGGAAATTCATTGACTGGAAAGGGATTCCAGTGAACAAAAGCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 ACTCAAAAGGGGTTACAGCTATCAGATTAAAATGTGTCCCCAAAATACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118947 ACTCAAAAGGGGTTACAGCTATCAGATTAAAATGTGTCCCCAAAATACAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTATTCCCATCAGAGGCCGTGTGTTAATTGGGTCAGACCAATTCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118997 CTATTCCCATCAGAGGCCGTGTGTTAATTGGGTCAGACCAATTCCAGAGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TCCCTTCCAGAAACTATTATCAGCATGGCCTCGTTGACTCTGGGGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119047 TCCCTTCCAGAAACTATTATCAGCATGGCCTCGTTGACTCTGGGGAACAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TCTACCCGTTTCCAAAAATGGAAATGCTCAGGTCAATGGACCTGTGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119097 TCTACCCGTTTCCAAAAATGGAAATGCTCAGGTCAATGGACCTGTGATAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CCACGGTTATTCAAAACTATTCCATAAATGAAGTTTTCCTATTTTTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119147 CCACGGTTATTCAAAACTATTCCATAAATGAAGTTTTCCTATTTTTTTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 AAGATAGAGTCAAACCTGAGCCAGCCTCATTGTGTGTTTTGGGATTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119197 AAGATAGAGTCAAACCTGAGCCAGCCTCATTGTGTGTTTTGGGATTTCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 TCATTTGCAGTGGAACGATGCAGGCTGCCACCTAGTGAATGAAACTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119247 TCATTTGCAGTGGAACGATGCAGGCTGCCACCTAGTGAATGAAACTCAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 ACATCGTGACGTGCCAATGTACTCACTTGACCTCCTTCTCCATATTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119297 ACATCGTGACGTGCCAATGTACTCACTTGACCTCCTTCTCCATATTGATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 TCACCTTTTGTCCCCTCTACAATCTTCCCCGTTGTAAAATGGATCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119347 TCACCTTTTGTCCCCTCTACAATCTTCCCCGTTGTAAAATGGATCACCTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 TGTGGGACTGGGTATCTCCATTGGAAGTCTCATTTTATGCCTGATCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119397 TGTGGGACTGGGTATCTCCATTGGAAGTCTCATTTTATGCCTGATCATCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 AGGCTTTGTTTTGGAAGCAGATTAAAAAAAGCCAAACCTCTCACACACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119447 AGGCTTTGTTTTGGAAGCAGATTAAAAAAAGCCAAACCTCTCACACACGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 CGTATTTGCATGGTGAACATAGCCCTGTCCCTCTTGATTGCTGATGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119497 CGTATTTGCATGGTGAACATAGCCCTGTCCCTCTTGATTGCTGATGTCTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 GTTTATTGTTGGTGCCACAGTGGACACCACGGTGAACCCTTCTGGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119547 GTTTATTGTTGGTGCCACAGTGGACACCACGGTGAACCCTTCTGGAGTCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 GCACAGCTGCTGTGTTCTTTACACACTTCTTCTACCTCTCTTTGTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119597 GCACAGCTGCTGTGTTCTTTACACACTTCTTCTACCTCTCTTTGTTCTTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 TGGATGCTCATGCTTGGCATCCTGCTGGCTTACCGGATCATCCTCGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119647 TGGATGCTCATGCTTGGCATCCTGCTGGCTTACCGGATCATCCTCGTGTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 CCATCACATGGCCCAGCATTTGATGATGGCTGTTGGATTTTGCCTGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119697 CCATCACATGGCCCAGCATTTGATGATGGCTGTTGGATTTTGCCTGGGTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 ATGGGTGCCCTCTCATTATATCTGTCATTACCATTGCTGTCACGCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119747 ATGGGTGCCCTCTCATTATATCTGTCATTACCATTGCTGTCACGCAACCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 AGCAATACCTACAAAAGGAAAGATGTGTGTTGGCTTAACTGGTCCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119797 AGCAATACCTACAAAAGGAAAGATGTGTGTTGGCTTAACTGGTCCAATGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2220 AAGCAAACCACTCCTGGCTTTTGTTGTCCCTGCACTGGCTATTGTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119847 AAGCAAACCACTCCTGGCTTTTGTTGTCCCTGCACTGGCTATTGTGGCTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2270 TGAACTTCGTTGTGGTGCTGCTAGTTCTCACAAAGCTCTGGAGGCCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119897 TGAACTTCGTTGTGGTGCTGCTAGTTCTCACAAAGCTCTGGAGGCCGACT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2320 GTTGGGGAAAGACTGAGTCGGGATGACAAGGCCACCATCATCCGCGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119947 GTTGGGGAAAGACTGAGTCGGGATGACAAGGCCACCATCATCCGCGTGGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2370 GAAGAGCCTCCTCATTCTGACCCCTCTGCTAGGGCTCACCTGGGGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119997 GAAGAGCCTCCTCATTCTGACCCCTCTGCTAGGGCTCACCTGGGGCTTTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2420 GAATAGGAACAATAGTGGACAGCCAGAATCTGGCTTGGCATGTTATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120047 GAATAGGAACAATAGTGGACAGCCAGAATCTGGCTTGGCATGTTATTTTT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 GCTTTACTCAATGCATTCCAG         GGATTTTTTATCTTATGCTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 120097 GCTTTACTCAATGCATTCCAGGTG...AAGGGATTTTTTATCTTATGCTT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2511 TGGAATACTCTTGGACAGTAAG         CTGCGACAACTTCTGTTCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 121788 TGGAATACTCTTGGACAGTAAGGTA...TAGCTGCGACAACTTCTGTTCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2552 ACAAGTTGTCTGCCTTAAGTTCTTGGAAGCAAACAGAAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 123205 ACAAGTTGTCTGCCTTAAGTTCTTGGAAGCAAACAGAAAAGGTA...CAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2593 CAAAACTCATCAGATTTATCTGCCAAACCCAAATTCTCAAAGCCTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127495 CAAAACTCATCAGATTTATCTGCCAAACCCAAATTCTCAAAGCCTTTCAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2643 CCCACTGCAAAACAAAG         GCCATTATGCATTTTCTCATACTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 127545 CCCACTGCAAAACAAAGGTG...CAGGCCATTATGCATTTTCTCATACTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2684 GAGATTCCTCCGACAACATCATGCTAACTCAGTTTGTCTCAAATGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128791 GAGATTCCTCCGACAACATCATGCTAACTCAGTTTGTCTCAAATGAA