seq1 = pF1KE9451.tfa, 2463 bp
seq2 = pF1KE9451/gi568815579f_6790480.tfa (gi568815579f:6790480_7037649), 247170 bp

>pF1KE9451 2463
>gi568815579f:6790480_7037649 (Chr19)

1-31  (97130-97160)   100% ->
32-94  (100002-100064)   100% ->
95-238  (105919-106062)   99% ->
239-394  (106670-106825)   100% ->
395-514  (106949-107068)   100% ->
515-661  (111396-111542)   100% ->
662-802  (113331-113471)   100% ->
803-949  (113557-113703)   100% ->
950-1038  (115954-116042)   100% ->
1039-1122  (118210-118293)   100% ->
1123-1300  (123174-123351)   100% ->
1301-1420  (125770-125889)   100% ->
1421-1620  (129069-129268)   100% ->
1621-1791  (131234-131404)   99% ->
1792-2027  (135887-136122)   100% ->
2028-2094  (137666-137732)   100% ->
2095-2186  (144508-144599)   98% ->
2187-2355  (146764-146932)   100% ->
2356-2463  (147065-147171)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTGGCTTCAACCTGCTCCTCTTCTGGG         GATGTTGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  97130 ATGCGTGGCTTCAACCTGCTCCTCTTCTGGGGTG...CAGGATGTTGTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TATGCACAGCTGGGAAGGGCACATAAGACCCACACGGAAACCAAACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 TATGCACAGCTGGGAAGGGCACATAAGACCCACACGGAAACCAAACACAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGG         GTAATAACTGTAGAGACAGTACCTTGTGCCCAGCTTAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 AGGGTA...TAGGTAATAACTGTAGAGACAGTACCTTGTGCCCAGCTTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCCACTTGCACCAATACAGTGGACAGTTACTATTGCGCTTGCAAACAAGG
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105957 GCCACCTGCACCAATACAGTGGACAGTTACTATTGCGCTTGCAAACAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTTCCTGTCCAGCAATGGGCAAAATCACTTCAAGGATCCAGGAGTGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106007 CTTCCTGTCCAGCAATGGGCAAAATCACTTCAAGGATCCAGGAGTGCGAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCAAAG         ATATTGATGAATGTTCTCAAAGCCCCCAGCCCTGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106057 GCAAAGGTG...TAGATATTGATGAATGTTCTCAAAGCCCCCAGCCCTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGTCCTAACTCATCCTGCAAAAACCTGTCAGGGAGGTACAAGTGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106705 GGTCCTAACTCATCCTGCAAAAACCTGTCAGGGAGGTACAAGTGCAGCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTTAGATGGTTTCTCTTCTCCCACTGGAAATGACTGGGTCCCAGGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106755 TTTAGATGGTTTCTCTTCTCCCACTGGAAATGACTGGGTCCCAGGAAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGGGCAATTTCTCCTGTACTG         ATATCAATGAGTGCCTCACC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 106805 CGGGCAATTTCTCCTGTACTGGTA...CAGATATCAATGAGTGCCTCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AGCAGCGTCTGCCCTGAGCATTCTGACTGTGTCAACTCCATGGGAAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106969 AGCAGCGTCTGCCCTGAGCATTCTGACTGTGTCAACTCCATGGGAAGCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAGTTGCAGCTGTCAAGTTGGATTCATCTCTAGAAACTCCACCTGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107019 CAGTTGCAGCTGTCAAGTTGGATTCATCTCTAGAAACTCCACCTGTGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515          ACGTGGATGAATGTGCAGATCCAAGAGCTTGCCCAGAGCAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107069 GTA...CAGACGTGGATGAATGTGCAGATCCAAGAGCTTGCCCAGAGCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCAACTTGTAATAACACTGTTGGAAACTACTCTTGTTTCTGCAACCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111437 GCAACTTGTAATAACACTGTTGGAAACTACTCTTGTTTCTGCAACCCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ATTTGAATCCAGCAGTGGCCACTTGAGTTTCCAGGGTCTCAAAGCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111487 ATTTGAATCCAGCAGTGGCCACTTGAGTTTCCAGGGTCTCAAAGCATCGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GTGAAG         ATATTGATGAATGCACTGAAATGTGCCCCATCAAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111537 GTGAAGGTA...CAGATATTGATGAATGCACTGAAATGTGCCCCATCAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCAACATGCACCAACACTCCTGGGAGCTACTTTTGCACCTGCCACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113366 TCAACATGCACCAACACTCCTGGGAGCTACTTTTGCACCTGCCACCCTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTTTGCACCAAGCAATGGACAGTTGAATTTCACAGACCAAGGAGTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113416 CTTTGCACCAAGCAATGGACAGTTGAATTTCACAGACCAAGGAGTGGAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GTAGAG         ATATTGATGAGTGCCGCCAAGATCCATCAACCTGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113466 GTAGAGGTG...CAGATATTGATGAGTGCCGCCAAGATCCATCAACCTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GGTCCTAATTCTATCTGCACCAATGCCCTGGGCTCCTACAGCTGTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113592 GGTCCTAATTCTATCTGCACCAATGCCCTGGGCTCCTACAGCTGTGGCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CATTGCAGGCTTTCATCCCAATCCAGAAGGCTCCCAGAAAGATGGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113642 CATTGCAGGCTTTCATCCCAATCCAGAAGGCTCCCAGAAAGATGGCAACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TCAGCTGCCAAA         GGGTTCTCTTCAAATGTAAGGAAGATGTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113692 TCAGCTGCCAAAGTA...TAGGGGTTCTCTTCAAATGTAAGGAAGATGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ATACCCGATAATAAGCAGATCCAGCAATGCCAAGAGGGAACCGCAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115983 ATACCCGATAATAAGCAGATCCAGCAATGCCAAGAGGGAACCGCAGTGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 ACCTGCATAT         GTCTCCTTTTGTGCACAAATAAATAACATCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 116033 ACCTGCATATGCA...CAGGTCTCCTTTTGTGCACAAATAAATAACATCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TCAGCGTTCTGGACAAAGTGTGTGAAAATAAAACGACCGTAGTTTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118241 TCAGCGTTCTGGACAAAGTGTGTGAAAATAAAACGACCGTAGTTTCTCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AAG         AATACAACTGAGAGCTTTGTCCCTGTGCTTAAACAAAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118291 AAGGTA...CAGAATACAACTGAGAGCTTTGTCCCTGTGCTTAAACAAAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 ATCCACGTGGACTAAATTCACCAAGGAAGAGACGTCCTCCCTGGCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123212 ATCCACGTGGACTAAATTCACCAAGGAAGAGACGTCCTCCCTGGCCACAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TCTTCCTGGAGAGTGTGGAAAGCATGACACTGGCATCTTTTTGGAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123262 TCTTCCTGGAGAGTGTGGAAAGCATGACACTGGCATCTTTTTGGAAACCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TCAGCAAATATCACTCCGGCTGTTCGGACGGAATACTTAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 123312 TCAGCAAATATCACTCCGGCTGTTCGGACGGAATACTTAGGTA...TAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CATTGAGAGCAAAGTTATCAACAAAGAATGCAGTGAAGAGAATGTGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125771 CATTGAGAGCAAAGTTATCAACAAAGAATGCAGTGAAGAGAATGTGACGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TGGACTTGGTAGCCAAGGGGGATAAGATGAAGATCGGGTGTTCCACAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125821 TGGACTTGGTAGCCAAGGGGGATAAGATGAAGATCGGGTGTTCCACAATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GAGGAATCTGAATCCACAG         AGACCACTGGTGTGGCTTTTGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 125871 GAGGAATCTGAATCCACAGGTA...CAGAGACCACTGGTGTGGCTTTTGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CTCCTTTGTGGGCATGGAATCGGTTTTAAATGAGCGCTTCTTCAAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129091 CTCCTTTGTGGGCATGGAATCGGTTTTAAATGAGCGCTTCTTCAAAGACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 ACCAGGCTCCCTTGACCACCTCTGAGATCAAGCTGAAGATGAATTCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129141 ACCAGGCTCCCTTGACCACCTCTGAGATCAAGCTGAAGATGAATTCTCGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GTCGTTGGGGGCATAATGACTGGAGAGAAGAAAGACGGCTTCTCAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129191 GTCGTTGGGGGCATAATGACTGGAGAGAAGAAAGACGGCTTCTCAGATCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AATCATCTACACTCTGGAGAACATTCAG         CCAAAGCAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 129241 AATCATCTACACTCTGGAGAACATTCAGGTT...TAGCCAAAGCAGAAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TTGAGAGGCCCATCTGTGTTTCCTGGAGCACTGATGTGAAGGGTGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131247 TTGAGAGGCCCATCTGTGTTTCCTGGAGCACTGATGTGAAGGGTGGAAGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TGGACATCCTTTGGCTGTGTGATCCTGGAAGCTTCTGAGACATATACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131297 TGGACATCCTTTGGCTGTGTGATCCTGGAAGCTTCTGAGACATATACCAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CTGCAGCTGTAATCAGATGGCAAATCTTGCCATTATCATGGCGTCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 131347 CTGCAGCTGTAATCAGATGGCAAATCTTGCCGTTATCATGGCGTCTGGGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 AGCTCACG         ATGGGCTGCGCCATCATCGCGGGCTTCCTGCAC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 131397 AGCTCACGGTC...CAGATGGGCTGCGCCATCATCGCGGGCTTCCTGCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TACCTTTTCCTTGCCTGCTTCTTCTGGATGCTGGTGGAGGCTGTGATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135920 TACCTTTTCCTTGCCTGCTTCTTCTGGATGCTGGTGGAGGCTGTGATACT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GTTCTTGATGGTCAGAAACCTGAAGGTGGTGAATTACTTCAGCTCTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135970 GTTCTTGATGGTCAGAAACCTGAAGGTGGTGAATTACTTCAGCTCTCGCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 ACATCAAGATGCTGCACATCTGTGCCTTTGGTTATGGGCTGCCGATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136020 ACATCAAGATGCTGCACATCTGTGCCTTTGGTTATGGGCTGCCGATGCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GTGGTGGTGATCTCTGCCAGTGTGCAGCCACAGGGCTATGGAATGCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136070 GTGGTGGTGATCTCTGCCAGTGTGCAGCCACAGGGCTATGGAATGCATAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TCG         CTGCTGGCTGAATACAGAGACAGGGTTCATCTGGAGTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136120 TCGGTG...CAGCTGCTGGCTGAATACAGAGACAGGGTTCATCTGGAGTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 TCTTGGGGCCAGTTTGCACAGTTATAGTG         ATCAACTCCCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 137704 TCTTGGGGCCAGTTTGCACAGTTATAGTGGTA...CAGATCAACTCCCTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CTCCTGACCTGGACCTTGTGGATACTGAGGCAGAGGCTTTCCAGTGTTAA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 144520 CTCCTGACCTGGACCTTGTGGATCCTGAGGCAGAGGCTTTCCAGTGTTAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 TGCCGAAGTCTCAACGCTAAAAGACACCAG         GTTACTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 144570 TGCCGAAGTCTCAACGCTAAAAGACACCAGGTA...CAGGTTACTGACCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 TCAAGGCCTTTGCCCAGCTCTTCATCCTGGGCTGCTCCTGGGTGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146775 TCAAGGCCTTTGCCCAGCTCTTCATCCTGGGCTGCTCCTGGGTGCTGGGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 ATTTTTCAGATTGGACCTGTGGCAGGTGTCATGGCTTACCTGTTCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146825 ATTTTTCAGATTGGACCTGTGGCAGGTGTCATGGCTTACCTGTTCACCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 CATCAACAGCCTGCAGGGGGCCTTCATCTTCCTCATCCACTGTCTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146875 CATCAACAGCCTGCAGGGGGCCTTCATCTTCCTCATCCACTGTCTGCTCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 ACGGCCAG         GTACGAGAAGAATACAAGAGGTGGATCACTGGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 146925 ACGGCCAGGTG...CAGGTACGAGAAGAATACAAGAGGTGGATCACTGGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 AAGACGAAGCCCAGCTCCCAGTCCCAGACCTCAAGGATCTTGCTGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147098 AAGACGAAGCCCAGCTCCCAGTCCCAGACCTCAAGGATCTTGCTGTCCTC

   2600     .    :    .    :    .
   2439 CATGCCATCCGCTTCCAAGACGGGT
        |||||||||||||||||||||||-|
 147148 CATGCCATCCGCTTCCAAGACGG T