seq1 = pF1KE9448.tfa, 1434 bp
seq2 = pF1KE9448/gi568815588f_86554784.tfa (gi568815588f:86554784_86765748), 210965 bp

>pF1KE9448 1434
>gi568815588f:86554784_86765748 (Chr10)

1-144  (100001-100144)   99% ->
145-290  (101372-101517)   100% ->
291-424  (103249-103382)   100% ->
425-628  (103701-103904)   100% ->
629-800  (104514-104685)   100% ->
801-965  (105112-105276)   100% ->
966-1073  (106498-106605)   100% ->
1074-1254  (107469-107649)   100% ->
1255-1398  (108876-109019)   100% ->
1399-1434  (110930-110965)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCCTCCTTCGGGGCCAAGAGTCCTGCCCAGCCCAACCCAAGAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCCTCCTTCGGGGCCAAGAGTCCCGCCCAGCCCAACCCAAGAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCTGCATGGCCACCCCAGCACCACCCAGCTGGTGGGACAGCTCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCTGCATGGCCACCCCAGCACCACCCAGCTGGTGGGACAGCTCCCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGCATCTCCAGCCTGGGCCGGCTTCCATCCATCAGTCCCACA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100101 GCAGCATCTCCAGCCTGGGCCGGCTTCCATCCATCAGTCCCACAGTA...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145    GCACCTGGGACTTGGGCTGCTGCCTGGGTCCCCCTCCCCACGGTTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101369 CAGGCACCTGGGACTTGGGCTGCTGCCTGGGTCCCCCTCCCCACGGTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTTCCAGACCATGCCCACTATACCCTGGGCACAGTGATCTTGCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101419 TGTTCCAGACCATGCCCACTATACCCTGGGCACAGTGATCTTGCTGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GACTCACGGGGATGCTGGGCAACCTGACGGTCATCTATACCTTCTGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101469 GACTCACGGGGATGCTGGGCAACCTGACGGTCATCTATACCTTCTGCAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    291         GAGCAGAAGCCTCCGGACACCTGCCAACATGTTCATTATCAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101519 TG...CAGGAGCAGAAGCCTCCGGACACCTGCCAACATGTTCATTATCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTCGCGGTCAGCGACTTCCTCATGTCCTTCACCCAGGCCCCTGTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103291 CCTCGCGGTCAGCGACTTCCTCATGTCCTTCACCCAGGCCCCTGTCTTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCACCAGTAGCCTCTATAAGCAGTGGCTCTTTGGGGAGACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103341 TCACCAGTAGCCTCTATAAGCAGTGGCTCTTTGGGGAGACAGGTA...CA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    425  GCTGCGAGTTCTATGCCTTCTGTGGAGCTCTCTTTGGCATTTCCTCCAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103700 GGCTGCGAGTTCTATGCCTTCTGTGGAGCTCTCTTTGGCATTTCCTCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATCACCCTGACGGCCATCGCCCTGGACCGCTACCTGGTAATCACACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103750 GATCACCCTGACGGCCATCGCCCTGGACCGCTACCTGGTAATCACACGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGCTGGCCACCTTTGGTGTGGCGTCCAAGAGGCGTGCGGCATTTGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103800 CGCTGGCCACCTTTGGTGTGGCGTCCAAGAGGCGTGCGGCATTTGTCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGGGCGTTTGGCTCTATGCCCTGGCCTGGAGTCTGCCACCCTTCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103850 CTGGGCGTTTGGCTCTATGCCCTGGCCTGGAGTCTGCCACCCTTCTTCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTGGA         GCGCCTACGTGCCCGAGGGGTTGCTGACATCCTGCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103900 CTGGAGTA...CAGGCGCCTACGTGCCCGAGGGGTTGCTGACATCCTGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCTGGGACTACATGAGCTTCACGCCGGCCGTGCGTGCCTACACCATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104550 CCTGGGACTACATGAGCTTCACGCCGGCCGTGCGTGCCTACACCATGCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTCTGCTGCTTCGTGTTCTTCCTCCCTCTGCTTATCATCATCTACTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104600 CTCTGCTGCTTCGTGTTCTTCCTCCCTCTGCTTATCATCATCTACTGCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CATCTTCATCTTCAGGGCCATCCGGGAGACAGGACG         GGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104650 CATCTTCATCTTCAGGGCCATCCGGGAGACAGGACGGTA...TAGGGCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCCAGACCTTCGGGGCCTGCAAGGGCAATGGCGAGTCCCTGTGGCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105117 TCCAGACCTTCGGGGCCTGCAAGGGCAATGGCGAGTCCCTGTGGCAGCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CAGCGGCTGCAGAGCGAGTGCAAGATGGCCAAGATCATGCTGCTGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105167 CAGCGGCTGCAGAGCGAGTGCAAGATGGCCAAGATCATGCTGCTGGTCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCTCCTCTTCGTGCTCTCCTGGGCTCCCTATTCCGCTGTGGCCCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105217 CCTCCTCTTCGTGCTCTCCTGGGCTCCCTATTCCGCTGTGGCCCTGGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCTTTGCTGG         GTACGCACACGTCCTGACACCCTACATGAGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105267 CCTTTGCTGGGTA...TAGGTACGCACACGTCCTGACACCCTACATGAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TCGGTGCCAGCCGTCATCGCCAAGGCCTCTGCAATCCACAACCCCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106529 TCGGTGCCAGCCGTCATCGCCAAGGCCTCTGCAATCCACAACCCCATCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TTACGCCATCACCCACCCCAAGTACAG         GGTGGCCATTGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 106579 TTACGCCATCACCCACCCCAAGTACAGGTG...CAGGGTGGCCATTGCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGCACCTGCCCTGCCTGGGGGTGCTGCTGGGTGTATCACGCCGGCACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107483 AGCACCTGCCCTGCCTGGGGGTGCTGCTGGGTGTATCACGCCGGCACAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CGCCCCTACCCCAGCTACCGCTCCACCCACCGCTCCACGCTGACCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107533 CGCCCCTACCCCAGCTACCGCTCCACCCACCGCTCCACGCTGACCAGCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CACCTCCAACCTCAGCTGGATCTCCATACGGAGGCGCCAGGAGTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107583 CACCTCCAACCTCAGCTGGATCTCCATACGGAGGCGCCAGGAGTCCCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GCTCGGAGAGTGAGGTG         GGCTGGACACACATGGAGGCAGCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 107633 GCTCGGAGAGTGAGGTGGTA...CAGGGCTGGACACACATGGAGGCAGCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GCTGTGTGGGGAGCTGCCCAGCAAGCAAATGGGCGGTCCCTCTACGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108900 GCTGTGTGGGGAGCTGCCCAGCAAGCAAATGGGCGGTCCCTCTACGGTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGGTCTGGAGGACTTGGAAGCCAAGGCACCCCCCAGACCCCAGGGACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108950 GGGTCTGGAGGACTTGGAAGCCAAGGCACCCCCCAGACCCCAGGGACACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AAGCAGAGACTCCAGGGAAG         ACCAAGGGGCTGATCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 109000 AAGCAGAGACTCCAGGGAAGGTG...CAGACCAAGGGGCTGATCCCCAGC

   1500     .    :    .
   1420 CAGGACCCCAGGATG
        |||||||||||||||
 110951 CAGGACCCCAGGATG