seq1 = pF1KE9441.tfa, 2721 bp
seq2 = pF1KE9441/gi568815586f_71340081.tfa (gi568815586f:71340081_71684731), 344651 bp

>pF1KE9441 2721
>gi568815586f:71340081_71684731 (Chr12)

1-212  (100001-100212)   100% ->
213-284  (164534-164605)   100% ->
285-356  (184326-184397)   100% ->
357-428  (195035-195106)   100% ->
429-644  (212993-213208)   100% ->
645-716  (216539-216610)   100% ->
717-785  (219506-219574)   100% ->
786-857  (221701-221772)   100% ->
858-929  (226324-226395)   98% ->
930-998  (226552-226620)   100% ->
999-1070  (226761-226832)   100% ->
1071-1136  (231434-231499)   100% ->
1137-1208  (232770-232841)   100% ->
1209-1280  (237845-237916)   100% ->
1281-1406  (238724-238849)   100% ->
1407-1552  (240198-240343)   100% ->
1553-1636  (242376-242459)   100% ->
1637-2721  (243567-244651)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACACCTCCCGGCTCGGTGTGCTCCTGTCCTTGCCTGTGCTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACACCTCCCGGCTCGGTGTGCTCCTGTCCTTGCCTGTGCTGCTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGCGACCGGGGGCAGCTCTCCCAGGTCTGGTGTGTTGCTGAGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGCGACCGGGGGCAGCTCTCCCAGGTCTGGTGTGTTGCTGAGGGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCCCACACACTGTCATTGCGAGCCCGACGGCAGGATGTTGCTCAGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCCCACACACTGTCATTGCGAGCCCGACGGCAGGATGTTGCTCAGGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACTGCTCCGACCTGGGGCTCTCGGAGCTGCCTTCCAACCTCAGCGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACTGCTCCGACCTGGGGCTCTCGGAGCTGCCTTCCAACCTCAGCGTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACCTCCTACCT         AGACCTCAGTATGAACAACATCAGTCAGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACCTCCTACCTGTA...CAGAGACCTCAGTATGAACAACATCAGTCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCTCCCGAATCCCCTGCCCAGTCTCCGCTTCCTGGAGGAGTT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 164563 TGCTCCCGAATCCCCTGCCCAGTCTCCGCTTCCTGGAGGAGTTGTA...C

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    285   ACGTCTTGCGGGAAACGCTCTGACATACATTCCCAAGGGAGCATTCAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184324 AGACGTCTTGCGGGAAACGCTCTGACATACATTCCCAAGGGAGCATTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGCCTTTACAGTCTTAAAGTTCT         TATGCTGCAGAATAATC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 184374 TGGCCTTTACAGTCTTAAAGTTCTGTA...CAGTATGCTGCAGAATAATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCTAAGACACGTACCCACAGAAGCTCTGCAGAATTTGCGAAGCCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195052 AGCTAAGACACGTACCCACAGAAGCTCTGCAGAATTTGCGAAGCCTTCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCCCT         GCGTCTGGATGCTAACCACATCAGCTATGTGCCCCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195102 TCCCTGTA...CAGGCGTCTGGATGCTAACCACATCAGCTATGTGCCCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAGCTGTTTCAGTGGCCTGCATTCCCTGAGGCACCTGTGGCTGGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213029 AAGCTGTTTCAGTGGCCTGCATTCCCTGAGGCACCTGTGGCTGGATGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGCGTTAACAGAAATCCCCGTCCAGGCTTTTAGAAGTTTATCGGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213079 ATGCGTTAACAGAAATCCCCGTCCAGGCTTTTAGAAGTTTATCGGCATTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAAGCCATGACCTTGGCCCTGAACAAAATACACCACATACCAGACTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213129 CAAGCCATGACCTTGGCCCTGAACAAAATACACCACATACCAGACTATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTTTGGAAACCTCTCCAGCTTGGTAGTTCT         ACATCTCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 213179 CTTTGGAAACCTCTCCAGCTTGGTAGTTCTGTA...CAGACATCTCCATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACAATAGAATCCACTCCCTGGGAAAGAAATGCTTTGATGGGCTCCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216550 ACAATAGAATCCACTCCCTGGGAAAGAAATGCTTTGATGGGCTCCACAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTAGAGACTTT         AGATTTAAATTACAATAACCTTGATGAATT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 216600 CTAGAGACTTTGTG...CAGAGATTTAAATTACAATAACCTTGATGAATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCCCACTGCAATTAGGACACTCTCCAACCTTAAAGAACT         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 219536 CCCCACTGCAATTAGGACACTCTCCAACCTTAAAGAACTGTA...TAGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GATTTCATAGCAACAATATCAGGTCGATACCTGAGAAAGCATTTGTAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221703 GATTTCATAGCAACAATATCAGGTCGATACCTGAGAAAGCATTTGTAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AACCCTTCTCTTATTACAAT         ACATTTCTATGACAATCCCAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 221753 AACCCTTCTCTTATTACAATGTA...TAGACATTTCTATGACAATCCCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CCAATTTGTTGGGAGATCTGCTTTTCAACATTTACCTGAACTAAGAACAC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226345 CCAGTTTGTTGGGAGATCTGCTTTTCAACATTTACCTGAACTAAGAACAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 T         GACTCTGAATGGTGCCTCACAAATAACTGAATTTCCTGAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226395 TGTA...TAGGACTCTGAATGGTGCCTCACAAATAACTGAATTTCCTGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TTAACTGGAACTGCAAACCTGGAGAGTCT         GACTTTAACTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 226592 TTAACTGGAACTGCAAACCTGGAGAGTCTGTA...CAGGACTTTAACTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 AGCACAGATCTCATCTCTTCCTCAAACCGTCTGCAATCAGTTACCTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226773 AGCACAGATCTCATCTCTTCCTCAAACCGTCTGCAATCAGTTACCTAATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TCCAAGTGCT         AGATCTGTCTTACAACCTATTAGAAGATTTA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 226823 TCCAAGTGCTGTG...CAGAGATCTGTCTTACAACCTATTAGAAGATTTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 CCCAGTTTTTCAGTCTGCCAAAAGCTTCAGAAAAT         TGACCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 231465 CCCAGTTTTTCAGTCTGCCAAAAGCTTCAGAAAATGTA...CAGTGACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 AAGACATAATGAAATCTACGAAATTAAAGTTGACACTTTCCAGCAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232776 AAGACATAATGAAATCTACGAAATTAAAGTTGACACTTTCCAGCAGTTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TTAGCCTCCGATCGCT         GAATTTGGCTTGGAACAAAATTGCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 232826 TTAGCCTCCGATCGCTGTG...TAGGAATTTGGCTTGGAACAAAATTGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 ATTATTCACCCCAATGCATTTTCCACTTTGCCATCCCTAATAAAGCT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 237870 ATTATTCACCCCAATGCATTTTCCACTTTGCCATCCCTAATAAAGCTGTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1281       GGACCTATCGTCCAACCTCCTGTCGTCTTTTCCTATAACTGGGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237920 ...CAGGGACCTATCGTCCAACCTCCTGTCGTCTTTTCCTATAACTGGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 TACATGGTTTAACTCACTTAAAATTAACAGGAAATCATGCCTTACAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 238768 TACATGGTTTAACTCACTTAAAATTAACAGGAAATCATGCCTTACAGAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 TTGATATCATCTGAAAACTTTCCAGAACTCAA         GGTTATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 238818 TTGATATCATCTGAAAACTTTCCAGAACTCAAGTG...AAGGGTTATAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 AATGCCTTATGCTTACCAGTGCTGTGCATTTGGAGTGTGTGAGAATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240207 AATGCCTTATGCTTACCAGTGCTGTGCATTTGGAGTGTGTGAGAATGCCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 ATAAGATTTCTAATCAATGGAATAAAGGTGACAACAGCAGTATGGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240257 ATAAGATTTCTAATCAATGGAATAAAGGTGACAACAGCAGTATGGACGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 CTTCATAAGAAAGATGCTGGAATGTTTCAGGCTCAAG         ATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 240307 CTTCATAAGAAAGATGCTGGAATGTTTCAGGCTCAAGGTA...CAGATGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 ACGTGACCTTGAAGATTTCCTGCTTGACTTTGAGGAAGACCTGAAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 242380 ACGTGACCTTGAAGATTTCCTGCTTGACTTTGAGGAAGACCTGAAAGCCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 TTCATTCAGTGCAGTGTTCACCTTCCCCAG         GCCCCTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 242430 TTCATTCAGTGCAGTGTTCACCTTCCCCAGGTG...TAGGCCCCTTCAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 CCCTGTGAACACCTGCTTGATGGCTGGCTGATCAGAATTGGAGTGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243578 CCCTGTGAACACCTGCTTGATGGCTGGCTGATCAGAATTGGAGTGTGGAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 CATAGCAGTTCTGGCACTTACTTGTAATGCTTTGGTGACTTCAACAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243628 CATAGCAGTTCTGGCACTTACTTGTAATGCTTTGGTGACTTCAACAGTTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 TCAGATCCCCTCTGTACATTTCCCCCATTAAACTGTTAATTGGGGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243678 TCAGATCCCCTCTGTACATTTCCCCCATTAAACTGTTAATTGGGGTCATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 GCAGCAGTGAACATGCTCACGGGAGTCTCCAGTGCCGTGCTGGCTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243728 GCAGCAGTGAACATGCTCACGGGAGTCTCCAGTGCCGTGCTGGCTGGTGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 GGATGCGTTCACTTTTGGCAGCTTTGCACGACATGGTGCCTGGTGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243778 GGATGCGTTCACTTTTGGCAGCTTTGCACGACATGGTGCCTGGTGGGAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 ATGGGGTTGGTTGCCATGTCATTGGTTTTTTGTCCATTTTTGCTTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243828 ATGGGGTTGGTTGCCATGTCATTGGTTTTTTGTCCATTTTTGCTTCAGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 TCATCTGTTTTCCTGCTTACTCTGGCAGCCCTGGAGCGTGGGTTCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 243878 TCATCTGTTTTCCTGCTTACTCTGGCAGCCCTGGAGCGTGGGTTCTCTGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 GAAATATTCTGCAAAATTTGAAACGAAAGCTCCATTTTCTAGCCTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243928 GAAATATTCTGCAAAATTTGAAACGAAAGCTCCATTTTCTAGCCTGAAAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 TAATCATTTTGCTCTGTGCCCTGCTGGCCTTGACCATGGCCGCAGTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243978 TAATCATTTTGCTCTGTGCCCTGCTGGCCTTGACCATGGCCGCAGTTCCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 CTGCTGGGTGGCAGCAAGTATGGCGCCTCCCCTCTCTGCCTGCCTTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244028 CTGCTGGGTGGCAGCAAGTATGGCGCCTCCCCTCTCTGCCTGCCTTTGCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 TTTTGGGGAGCCCAGCACCATGGGCTACATGGTCGCTCTCATCTTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244078 TTTTGGGGAGCCCAGCACCATGGGCTACATGGTCGCTCTCATCTTGCTCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 ATTCCCTTTGCTTCCTCATGATGACCATTGCCTACACCAAGCTCTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244128 ATTCCCTTTGCTTCCTCATGATGACCATTGCCTACACCAAGCTCTACTGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 AATTTGGACAAGGGAGACCTGGAGAATATTTGGGACTGCTCTATGGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244178 AATTTGGACAAGGGAGACCTGGAGAATATTTGGGACTGCTCTATGGTAAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 ACACATTGCCCTGTTGCTCTTCACCAACTGCATCCTAAACTGCCCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244228 ACACATTGCCCTGTTGCTCTTCACCAACTGCATCCTAAACTGCCCTGTGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 CTTTCTTGTCCTTCTCCTCTTTAATAAACCTTACATTTATCAGTCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244278 CTTTCTTGTCCTTCTCCTCTTTAATAAACCTTACATTTATCAGTCCTGAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 GTAATTAAGTTTATCCTTCTGGTGGTAGTCCCACTTCCTGCATGTCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244328 GTAATTAAGTTTATCCTTCTGGTGGTAGTCCCACTTCCTGCATGTCTCAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 TCCCCTTCTCTACATCTTGTTCAATCCTCACTTTAAGGAGGATCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244378 TCCCCTTCTCTACATCTTGTTCAATCCTCACTTTAAGGAGGATCTGGTGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 GCCTGAGAAAGCAAACCTACGTCTGGACAAGATCAAAACACCCAAGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244428 GCCTGAGAAAGCAAACCTACGTCTGGACAAGATCAAAACACCCAAGCTTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 ATGTCAATTAACTCTGATGATGTCGAAAAACAGTCCTGTGACTCAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244478 ATGTCAATTAACTCTGATGATGTCGAAAAACAGTCCTGTGACTCAACTCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 AGCCTTGGTAACCTTTACCAGCTCCAGCATCACTTATGACCTGCCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244528 AGCCTTGGTAACCTTTACCAGCTCCAGCATCACTTATGACCTGCCTCCCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 GTTCCGTGCCATCACCAGCTTATCCAGTGACTGAGAGCTGCCATCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244578 GTTCCGTGCCATCACCAGCTTATCCAGTGACTGAGAGCTGCCATCTTTCC

   2850     .    :    .    :
   2698 TCTGTGGCATTTGTCCCATGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||
 244628 TCTGTGGCATTTGTCCCATGTCTC