Result of SIM4 for
pF1KE9436
seq1 = pF1KE9436.tfa, 3051 bp
seq2 = pF1KE9436/gi568815575r_18890867.tfa (gi568815575r:18890867_19168834), 277968 bp
>pF1KE9436 3051
>gi568815575r:18890867_19168834 (ChrX)
(complement)
1-118 (100001-100118) 100% ->
119-154 (128611-128646) 100% ->
155-202 (131199-131246) 100% ->
203-226 (131345-131368) 100% ->
227-262 (132858-132893) 100% ->
263-304 (135181-135222) 100% ->
305-358 (137798-137851) 100% ->
359-414 (140597-140652) 100% ->
415-470 (141561-141616) 100% ->
471-510 (144887-144926) 100% ->
511-548 (145382-145419) 100% ->
549-643 (147637-147731) 100% ->
644-710 (149170-149236) 100% ->
711-1099 (154761-155149) 100% ->
1100-1265 (158057-158222) 100% ->
1266-1422 (159053-159209) 100% ->
1423-1566 (160712-160855) 100% ->
1567-1689 (161478-161600) 100% ->
1690-1735 (162570-162615) 100% ->
1736-1839 (162730-162833) 100% ->
1840-1961 (163956-164077) 100% ->
1962-2230 (165721-165989) 100% ->
2231-2330 (168875-168974) 100% ->
2331-2614 (169556-169839) 100% ->
2615-2716 (172683-172784) 100% ->
2717-2869 (173787-173939) 100% ->
2870-3051 (177787-177968) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGTTTTCTCTGTCAGGCAGTGTGGCCATGTTGGCAGAACTGAAGAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGTTTTCTCTGTCAGGCAGTGTGGCCATGTTGGCAGAACTGAAGAAGT
50 . : . : . : . : . :
51 TTTACTGACGTTCAAGATATTCCTTGTCATCATTTGTCTTCATGTCGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TTTACTGACGTTCAAGATATTCCTTGTCATCATTTGTCTTCATGTCGTTC
100 . : . : . : . : . :
101 TGGTAACATCCCTGGAAG AAGATACTGATAATTCCAGTTTG
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
100101 TGGTAACATCCCTGGAAGGTA...CAGAAGATACTGATAATTCCAGTTTG
150 . : . : . : . : . :
142 TCACCACCACCTG CTAAATTATCTGTTGTCAGTTTTGCCCC
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
128634 TCACCACCACCTGGTA...CAGCTAAATTATCTGTTGTCAGTTTTGCCCC
200 . : . : . : . : . :
183 CTCCTCCAATGGTACTCCAG AGGTTGAAACAACAAGCCTCA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
131227 CTCCTCCAATGGTACTCCAGGCA...AAGAGGTTGAAACAACAAGCCTCA
250 . : . : . : . : . :
224 ATG ATGTTACTTTAAGCTTACTCCCTTCAAACGAAACAG
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
131366 ATGGTA...CAGATGTTACTTTAAGCTTACTCCCTTCAAACGAAACAGGT
300 . : . : . : . : . :
263 AAAAAACTAAAATCACTATAGTAAAAACCTTCAATGCATCAG
>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
132896 A...CAGAAAAAACTAAAATCACTATAGTAAAAACCTTCAATGCATCAGG
350 . : . : . : . : . :
305 GCGTCAAACCCCAGAGAAATATCTGCAATTTGTCATCTATTT
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135224 TA...CAGGCGTCAAACCCCAGAGAAATATCTGCAATTTGTCATCTATTT
400 . : . : . : . : . :
347 GCAATGACTCAG CATTTTTTAGAGGTGAGATCATGTTTCAA
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
137840 GCAATGACTCAGGTT...TAGCATTTTTTAGAGGTGAGATCATGTTTCAA
450 . : . : . : . : . :
388 TATGATAAAGAAAGCACTGTTCCCCAG AATCAACATATAAC
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
140626 TATGATAAAGAAAGCACTGTTCCCCAGGTA...CAGAATCAACATATAAC
500 . : . : . : . : . :
429 GAATGGCACCTTAACTGGAGTCCTGTCTCTAAGTGAATTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
141575 GAATGGCACCTTAACTGGAGTCCTGTCTCTAAGTGAATTAAAGTG...CA
550 . : . : . : . : . :
471 ACGCTCAGAGCTCAACAAAACCCTGCAAACCCTAAGTGAG
>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
144886 GACGCTCAGAGCTCAACAAAACCCTGCAAACCCTAAGTGAGGTA...CAG
600 . : . : . : . : . :
511 ACTTACTTTATAATGTGTGCTACAGCAGAGGCCCAAAG CAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
145382 ACTTACTTTATAATGTGTGCTACAGCAGAGGCCCAAAGGTC...CAGCAC
650 . : . : . : . : . :
552 ATTAAATTGTACATTCACAATAAAACTGAATAATACAATGAATGCATGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147640 ATTAAATTGTACATTCACAATAAAACTGAATAATACAATGAATGCATGTG
700 . : . : . : . : . :
602 CTGTAATAGCTGCTTTGGAAAGAGTAAAGATTCGACCAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
147690 CTGTAATAGCTGCTTTGGAAAGAGTAAAGATTCGACCAATGGGTA...TA
750 . : . : . : . : . :
644 AACACTGCTGCTGTTCTGTCAGGATACCCTGCCCTTCCTCCCCAGAAGA
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149169 GAACACTGCTGCTGTTCTGTCAGGATACCCTGCCCTTCCTCCCCAGAAGA
800 . : . : . : . : . :
693 GTTGGAAAAGCTTCAGTG TGACCTGCAGGATCCCATTGTCT
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
149219 GTTGGAAAAGCTTCAGTGGTA...TAGTGACCTGCAGGATCCCATTGTCT
850 . : . : . : . : . :
734 GTCTTGCTGACCATCCACGTGGCCCACCATTTTCTTCCAGCCAATCCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154784 GTCTTGCTGACCATCCACGTGGCCCACCATTTTCTTCCAGCCAATCCATC
900 . : . : . : . : . :
784 CCAGTGGTGCCTCGGGCCACTGTGCTTTCCCAGGTCCCCAAAGCTACCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154834 CCAGTGGTGCCTCGGGCCACTGTGCTTTCCCAGGTCCCCAAAGCTACCTC
950 . : . : . : . : . :
834 TTTTGCTGAGCCTCCAGATTATTCACCTGTGACCCACAATGTTCCCTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154884 TTTTGCTGAGCCTCCAGATTATTCACCTGTGACCCACAATGTTCCCTCTC
1000 . : . : . : . : . :
884 CAATAGGGGAGATTCAACCCCTTTCACCCCAGCCTTCAGCTCCCATAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154934 CAATAGGGGAGATTCAACCCCTTTCACCCCAGCCTTCAGCTCCCATAGCT
1050 . : . : . : . : . :
934 TCCAGCCCTGCCATTGACATGCCCCCACAGTCTGAAACGATCTCTTCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154984 TCCAGCCCTGCCATTGACATGCCCCCACAGTCTGAAACGATCTCTTCCCC
1100 . : . : . : . : . :
984 TATGCCCCAAACCCATGTCTCCGGCACCCCACCTCCTGTGAAAGCCTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155034 TATGCCCCAAACCCATGTCTCCGGCACCCCACCTCCTGTGAAAGCCTCAT
1150 . : . : . : . : . :
1034 TTTCCTCTCCCACCGTGTCTGCCCCTGCGAATGTCAACACTACCAGCGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155084 TTTCCTCTCCCACCGTGTCTGCCCCTGCGAATGTCAACACTACCAGCGCA
1200 . : . : . : . : . :
1084 CCTCCTGTCCAGACAG ACATCGTCAACACCAGCAGTATTTC
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
155134 CCTCCTGTCCAGACAGGTA...TAGACATCGTCAACACCAGCAGTATTTC
1250 . : . : . : . : . :
1125 TGATCTTGAGAACCAAGTGTTGCAGATGGAGAAGGCTCTGTCCTTGGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158082 TGATCTTGAGAACCAAGTGTTGCAGATGGAGAAGGCTCTGTCCTTGGGCA
1300 . : . : . : . : . :
1175 GCCTGGAGCCTAACCTCGCAGGAGAAATGATCAACCAAGTCAGCAGACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158132 GCCTGGAGCCTAACCTCGCAGGAGAAATGATCAACCAAGTCAGCAGACTC
1350 . : . : . : . : . :
1225 CTTCATTCCCCGCCTGACATGCTGGCCCCTCTGGCTCAAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
158182 CTTCATTCCCCGCCTGACATGCTGGCCCCTCTGGCTCAAAGGTA...CAG
1400 . : . : . : . : . :
1266 ATTGCTGAAAGTAGTGGATGACATTGGCCTACAGCTGAACTTTTCAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159053 ATTGCTGAAAGTAGTGGATGACATTGGCCTACAGCTGAACTTTTCAAACA
1450 . : . : . : . : . :
1316 CGACTATAAGTCTAACCTCCCCTTCTTTGGCTCTGGCTGTGATCAGAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159103 CGACTATAAGTCTAACCTCCCCTTCTTTGGCTCTGGCTGTGATCAGAGTG
1500 . : . : . : . : . :
1366 AATGCCAGTAGTTTCAACACAACTACCTTTGTGGCCCAAGACCCTGCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159153 AATGCCAGTAGTTTCAACACAACTACCTTTGTGGCCCAAGACCCTGCAAA
1550 . : . : . : . : . :
1416 TCTTCAG GTTTCTCTGGAAACCCAAGCTCCTGAGAACAGTA
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
159203 TCTTCAGGTA...CAGGTTTCTCTGGAAACCCAAGCTCCTGAGAACAGTA
1600 . : . : . : . : . :
1457 TTGGCACAATTACTCTTCCTTCATCGCTGATGAATAATTTACCAGCTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
160746 TTGGCACAATTACTCTTCCTTCATCGCTGATGAATAATTTACCAGCTCAT
1650 . : . : . : . : . :
1507 GACATGGAGCTAGCTTCCAGGGTTCAGTTCAATTTTTTTGAAACACCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
160796 GACATGGAGCTAGCTTCCAGGGTTCAGTTCAATTTTTTTGAAACACCTGC
1700 . : . : . : . : . :
1557 TTTGTTTCAG GATCCTTCCCTGGAGAACCTCTCTCTGATCA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
160846 TTTGTTTCAGGTA...CAGGATCCTTCCCTGGAGAACCTCTCTCTGATCA
1750 . : . : . : . : . :
1598 GCTACGTCATATCATCGAGTGTTGCAAACCTGACCGTCAGGAACTTGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161509 GCTACGTCATATCATCGAGTGTTGCAAACCTGACCGTCAGGAACTTGACA
1800 . : . : . : . : . :
1648 AGAAACGTGACAGTCACATTAAAGCACATCAACCCGAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
161559 AGAAACGTGACAGTCACATTAAAGCACATCAACCCGAGCCAGGTG...CA
1850 . : . : . : . : . :
1690 GATGAGTTAACAGTGAGATGTGTATTTTGGGACTTGGGCAGAAATG
>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
162569 GGATGAGTTAACAGTGAGATGTGTATTTTGGGACTTGGGCAGAAATGGTA
1900 . : . : . : . : . :
1736 GTGGCAGAGGAGGCTGGTCAGACAATGGCTGCTCTGTCAAAGAC
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162619 ...CAGGTGGCAGAGGAGGCTGGTCAGACAATGGCTGCTCTGTCAAAGAC
1950 . : . : . : . : . :
1780 AGGAGATTGAATGAAACCATCTGTACCTGTAGCCATCTAACAAGCTTCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162774 AGGAGATTGAATGAAACCATCTGTACCTGTAGCCATCTAACAAGCTTCGG
2000 . : . : . : . : . :
1830 CGTTCTGCTG GACCTATCTAGGACATCTGTGCTGCCTGCTC
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
162824 CGTTCTGCTGGTA...CAGGACCTATCTAGGACATCTGTGCTGCCTGCTC
2050 . : . : . : . : . :
1871 AAATGATGGCTCTGACGTTCATTACATATATTGGTTGTGGGCTTTCATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163987 AAATGATGGCTCTGACGTTCATTACATATATTGGTTGTGGGCTTTCATCA
2100 . : . : . : . : . :
1921 ATTTTTCTGTCAGTGACTCTTGTAACCTACATAGCTTTTGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
164037 ATTTTTCTGTCAGTGACTCTTGTAACCTACATAGCTTTTGAGTG...TAG
2150 . : . : . : . : . :
1962 AAAGATCCGGAGGGATTACCCTTCCAAAATCCTCATCCAGCTGTGTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165721 AAAGATCCGGAGGGATTACCCTTCCAAAATCCTCATCCAGCTGTGTGCTG
2200 . : . : . : . : . :
2012 CTCTGCTTCTGCTGAACCTGGTCTTCCTCCTGGACTCGTGGATTGCTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165771 CTCTGCTTCTGCTGAACCTGGTCTTCCTCCTGGACTCGTGGATTGCTCTG
2250 . : . : . : . : . :
2062 TATAAGATGCAAGGCCTCTGCATCTCAGTGGCTGTATTTCTTCATTATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165821 TATAAGATGCAAGGCCTCTGCATCTCAGTGGCTGTATTTCTTCATTATTT
2300 . : . : . : . : . :
2112 TCTCTTGGTCTCATTCACATGGATGGGCCTAGAAGCATTCCATATGTACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165871 TCTCTTGGTCTCATTCACATGGATGGGCCTAGAAGCATTCCATATGTACC
2350 . : . : . : . : . :
2162 TGGCCCTTGTCAAAGTATTTAATACTTACATCCGAAAATACATCCTTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165921 TGGCCCTTGTCAAAGTATTTAATACTTACATCCGAAAATACATCCTTAAA
2400 . : . : . : . : . :
2212 TTCTGCATTGTCGGTTGGG GGGTACCAGCTGTGGTTGTGAC
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
165971 TTCTGCATTGTCGGTTGGGGTA...CAGGGGTACCAGCTGTGGTTGTGAC
2450 . : . : . : . : . :
2253 CATCATCCTGACTATATCCCCAGATAACTATGGGCTTGGATCCTATGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
168897 CATCATCCTGACTATATCCCCAGATAACTATGGGCTTGGATCCTATGGGA
2500 . : . : . : . : . :
2303 AATTCCCCAATGGTTCACCGGATGACTT CTGCTGGATCAAC
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
168947 AATTCCCCAATGGTTCACCGGATGACTTGTG...CAGCTGCTGGATCAAC
2550 . : . : . : . : . :
2344 AACAATGCAGTATTCTACATTACGGTGGTGGGATATTTCTGTGTGATATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169569 AACAATGCAGTATTCTACATTACGGTGGTGGGATATTTCTGTGTGATATT
2600 . : . : . : . : . :
2394 TTTGCTGAACGTCAGCATGTTCATTGTGGTCCTGGTTCAGCTCTGTCGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169619 TTTGCTGAACGTCAGCATGTTCATTGTGGTCCTGGTTCAGCTCTGTCGAA
2650 . : . : . : . : . :
2444 TTAAAAAGAAGAAGCAACTGGGAGCCCAGCGAAAAACCAGTATTCAAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169669 TTAAAAAGAAGAAGCAACTGGGAGCCCAGCGAAAAACCAGTATTCAAGAC
2700 . : . : . : . : . :
2494 CTCAGGAGTATCGCTGGCCTTACATTTTTACTGGGAATAACTTGGGGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169719 CTCAGGAGTATCGCTGGCCTTACATTTTTACTGGGAATAACTTGGGGCTT
2750 . : . : . : . : . :
2544 TGCCTTCTTTGCCTGGGGACCAGTTAACGTGACCTTCATGTATCTGTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169769 TGCCTTCTTTGCCTGGGGACCAGTTAACGTGACCTTCATGTATCTGTTTG
2800 . : . : . : . : . :
2594 CCATCTTTAATACCTTACAAG GATTTTTCATATTCATCTTT
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
169819 CCATCTTTAATACCTTACAAGGTA...TAGGATTTTTCATATTCATCTTT
2850 . : . : . : . : . :
2635 TACTGTGTGGCCAAAGAAAATGTCAGGAAGCAATGGAGGCGGTATCTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
172703 TACTGTGTGGCCAAAGAAAATGTCAGGAAGCAATGGAGGCGGTATCTTTG
2900 . : . : . : . : . :
2685 TTGTGGAAAGTTACGGCTGGCTGAAAATTCTG ACTGGAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
172753 TTGTGGAAAGTTACGGCTGGCTGAAAATTCTGGTA...TAGACTGGAGTA
2950 . : . : . : . : . :
2726 AAACTGCTACTAATGGTTTAAAGAAGCAGACTGTAAACCAAGGAGTGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173796 AAACTGCTACTAATGGTTTAAAGAAGCAGACTGTAAACCAAGGAGTGTCC
3000 . : . : . : . : . :
2776 AGCTCTTCAAATTCCTTACAGTCAAGCAGTAACTCCACTAACTCCACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173846 AGCTCTTCAAATTCCTTACAGTCAAGCAGTAACTCCACTAACTCCACCAC
3050 . : . : . : . : . :
2826 ACTGCTAGTGAATAATGATTGCTCAGTACACGCAAGCGGGAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
173896 ACTGCTAGTGAATAATGATTGCTCAGTACACGCAAGCGGGAATGGTA...
3100 . : . : . : . : . :
2870 GAAATGCTTCTACAGAGAGGAATGGGGTCTCTTTTAGTGTTCAGAAT
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
177784 CAGGAAATGCTTCTACAGAGAGGAATGGGGTCTCTTTTAGTGTTCAGAAT
3150 . : . : . : . : . :
2917 GGAGATGTGTGCCTTCACGATTTCACTGGAAAACAGCACATGTTTAACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
177834 GGAGATGTGTGCCTTCACGATTTCACTGGAAAACAGCACATGTTTAACGA
3200 . : . : . : . : . :
2967 GAAGGAAGATTCCTGCAATGGGAAAGGCCGTATGGCTCTCAGAAGGACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
177884 GAAGGAAGATTCCTGCAATGGGAAAGGCCGTATGGCTCTCAGAAGGACTT
3250 . : . : . : .
3017 CAAAGCGGGGAAGCTTACACTTTATTGAGCAAATG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
177934 CAAAGCGGGGAAGCTTACACTTTATTGAGCAAATG