seq1 = pF1KE9423.tfa, 2436 bp
seq2 = pF1KE9423/gi568815579r_14643418.tfa (gi568815579r:14643418_14874307), 230890 bp

>pF1KE9423 2436
>gi568815579r:14643418_14874307 (Chr19)

(complement)

1-31  (97552-97582)   100% ->
32-82  (100002-100052)   100% ->
83-199  (100254-100370)   98% ->
200-355  (101811-101966)   100% ->
356-487  (107199-107330)   94% ->
488-634  (107927-108073)   100% ->
635-781  (108504-108650)   100% ->
782-828  (108738-108784)   100% ->
829-906  (108911-108988)   98% ->
907-1084  (109698-109875)   100% ->
1085-1192  (117963-118070)   100% ->
1193-1383  (118464-118654)   100% ->
1384-1557  (119181-119354)   100% ->
1558-1755  (121782-121979)   100% ->
1756-1991  (122637-122872)   99% ->
1992-2058  (127346-127412)   100% ->
2059-2150  (127985-128076)   98% ->
2151-2319  (130524-130692)   100% ->
2320-2436  (130778-130892)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGGCCGCGTCTTTCTCGTCTTTCTCG         CATTCTGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  97552 ATGGGAGGCCGCGTCTTTCTCGTCTTTCTCGGTA...CAGCATTCTGTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTGGCTGACTCTGCCGGGAGCTGAAACCCAGGACTCCAGGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100012 CTGGCTGACTCTGCCGGGAGCTGAAACCCAGGACTCCAGGGGTG...CAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 GCTGTGCCCGGTGGTGCCCTCAGGATTCCTCGTGTGTCAATGCCACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100254 GCTGTGCCCGGTGGTGCCCTCAGGACTCCTCGTGTGTCAATGCCACCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TGTCGCTGCAATCCAGGGTTCAGCTCTTTTTCTGAGATCATCACCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100304 TGTCGCTGCAATCCAGGGTTCAGCTCTTTTTCTGAGATCATCACCACCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CATGGAGACTTGTGATG         ACATCAACGAGTGTGCAACACTGT
        ||||||||||||||| |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100354 CATGGAGACTTGTGACGGTA...CAGACATCAACGAGTGTGCAACACTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CGAAAGTGTCATGCGGAAAATTCTCGGACTGCTGGAACACAGAGGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101835 CGAAAGTGTCATGCGGAAAATTCTCGGACTGCTGGAACACAGAGGGGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TACGACTGCGTGTGCAGCCCAGGATATGAGCCTGTTTCTGGGGCAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101885 TACGACTGCGTGTGCAGCCCAGGATATGAGCCTGTTTCTGGGGCAAAAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ATTCAAGAATGAGAGCGAGAACACGTGTCAAG         ATGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101935 ATTCAAGAATGAGAGCGAGAACACGTGTCAAGGTA...CAGATGTGGACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AATGTCAGCAGAACCCAAGGCTCTGTAAAAGCTACGGCACCTGCGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107208 AATGTCAGCAGAACCCAAGGCTCTGTAAAAGCTACGGCACCTGCGTCAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACCCTTGGCAGCTATACCTGCCAGTGCCTGCCTGGCTTCAAGTTCATACC
        ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||
 107258 ACCCTCGGCAGCTACACGTGCCAGTGCCTGCCTGGCTTCAAGCTCAAACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGAGGATCCGAAGGTCTGCACAG         ATGTGAATGAATGCACCT
        |||||| |||||| |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107308 TGAGGACCCGAAGCTCTGCACAGGTA...CAGATGTGAATGAATGCACCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCGGACAAAACCCATGCCACAGCTCCACCCACTGCCTCAACAACGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107945 CCGGACAAAACCCATGCCACAGCTCCACCCACTGCCTCAACAACGTGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGCTATCAGTGCCGCTGCCGCCCGGGCTGGCAACCGATTCCGGGGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107995 AGCTATCAGTGCCGCTGCCGCCCGGGCTGGCAACCGATTCCGGGGTCCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAATGGCCCAAACAATACCGTCTGTGAAG         ATGTGGACGAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 108045 CAATGGCCCAAACAATACCGTCTGTGAAGGTC...CAGATGTGGACGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GCAGCTCCGGGCAGCATCAGTGTGACAGCTCCACCGTCTGCTTCAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108516 GCAGCTCCGGGCAGCATCAGTGTGACAGCTCCACCGTCTGCTTCAACACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GTGGGTTCATACAGCTGCCGCTGCCGCCCAGGCTGGAAGCCCAGACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108566 GTGGGTTCATACAGCTGCCGCTGCCGCCCAGGCTGGAAGCCCAGACACGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AATCCCGAATAACCAAAAGGACACTGTCTGTGAAG         ATATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 108616 AATCCCGAATAACCAAAAGGACACTGTCTGTGAAGGTA...CAGATATGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CTTTCTCCACCTGGACCCCGCCCCCTGGAGTCCACAGCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 108744 CTTTCTCCACCTGGACCCCGCCCCCTGGAGTCCACAGCCAGGTG...CAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 ACGCTTTCCCGATTATTCGACAAAGTCCAGGACCTGGGCAGAGACTACAA
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108911 ACGCTTTCCCGATTCTTCGACAAAGTCCAGGACCTGGGCAGAGACTACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GCCAGGCTTGGCCAATAACACCATCCAG         AGCATCTTACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 108961 GCCAGGCTTGGCCAATAACACCATCCAGGTA...CAGAGCATCTTACAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CGCTGGATGAGCTGCTGGAGGCCCCTGGGGACCTGGAGACCCTGCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109711 CGCTGGATGAGCTGCTGGAGGCCCCTGGGGACCTGGAGACCCTGCCCCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TTACAGCAGCACTGTGTGGCCAGTCACCTGCTGGATGGCCTAGAGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109761 TTACAGCAGCACTGTGTGGCCAGTCACCTGCTGGATGGCCTAGAGGATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CCTCAGAGGCCTGAGCAAGAACCTTTCCAATGGGCTGTTGAACTTCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109811 CCTCAGAGGCCTGAGCAAGAACCTTTCCAATGGGCTGTTGAACTTCAGTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ATCCTGCAGGCACAG         AATTGTCCCTGGAGGTGCAGAAGCAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 109861 ATCCTGCAGGCACAGGTA...TAGAATTGTCCCTGGAGGTGCAGAAGCAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GTAGACAGGAGTGTCACCTTGAGACAGAATCAGGCAGTGATGCAGCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117989 GTAGACAGGAGTGTCACCTTGAGACAGAATCAGGCAGTGATGCAGCTCGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CTGGAATCAGGCACAGAAATCTGGTGACCCAG         GGATGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 118039 CTGGAATCAGGCACAGAAATCTGGTGACCCAGGTA...CAGGGATGGGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 AGTTGCTGGCTGAGGCCCCTCTGGTCCTGGAACCTGAGAAGCAGATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118473 AGTTGCTGGCTGAGGCCCCTCTGGTCCTGGAACCTGAGAAGCAGATGCTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 CTGCATGAGACACACCAGGGCTTGCTGCAGGACGGCTCCCCCATCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118523 CTGCATGAGACACACCAGGGCTTGCTGCAGGACGGCTCCCCCATCCTGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CTCAGATGTGATCTCTGCCTTTCTGAGCAACAACGACACCCAAAACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118573 CTCAGATGTGATCTCTGCCTTTCTGAGCAACAACGACACCCAAAACCTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GCTCCCCAGTTACCTTCACCTTCTCCCACCGT         TCAGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 118623 GCTCCCCAGTTACCTTCACCTTCTCCCACCGTGTG...CAGTCAGTGATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CCGAGACAGAAGGTGCTCTGTGTCTTCTGGGAGCATGGCCAGAATGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119190 CCGAGACAGAAGGTGCTCTGTGTCTTCTGGGAGCATGGCCAGAATGGATG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TGGTCACTGGGCCACCACAGGCTGCAGCACAATAGGCACCAGAGACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119240 TGGTCACTGGGCCACCACAGGCTGCAGCACAATAGGCACCAGAGACACCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 GCACCATCTGCCGTTGCACCCACCTGAGCAGCTTTGCCGTCCTCATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119290 GCACCATCTGCCGTTGCACCCACCTGAGCAGCTTTGCCGTCCTCATGGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CACTACGATGTGCAG         GAGGAGGATCCCGTGCTGACTGTCAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 119340 CACTACGATGTGCAGGTG...CAGGAGGAGGATCCCGTGCTGACTGTCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CACCTACATGGGGCTGAGCGTCTCTCTGCTGTGCCTCCTCCTGGCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121808 CACCTACATGGGGCTGAGCGTCTCTCTGCTGTGCCTCCTCCTGGCGGCCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TCACTTTTCTCCTGTGTAAAGCCATCCAGAACACCAGCACCTCACTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121858 TCACTTTTCTCCTGTGTAAAGCCATCCAGAACACCAGCACCTCACTGCAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CTGCAGCTCTCGCTCTGCCTCTTCCTGGCCCACCTCCTCTTCCTCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121908 CTGCAGCTCTCGCTCTGCCTCTTCCTGGCCCACCTCCTCTTCCTCGTGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 AATTGATCAAACCGGACACAAG         GTGCTGTGCTCCATCATCG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 121958 AATTGATCAAACCGGACACAAGGTA...CAGGTGCTGTGCTCCATCATCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 CCGGTATCTTGCACTATCTCTACCTGGCCACCTTCACCTGGATGCTGCTG
        |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 122656 CCGGTACCTTGCACTATCTCTACCTGGCCACCTTGACCTGGATGCTGCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GAGGCCCTGTACCTCTTCCTCACTGCACGGAACCTGACGGTGGTCAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122706 GAGGCCCTGTACCTCTTCCTCACTGCACGGAACCTGACGGTGGTCAACTA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CTCAAGCATCAACAGATTCATGAAGAAGCTCATGTTCCCTGTGGGCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122756 CTCAAGCATCAACAGATTCATGAAGAAGCTCATGTTCCCTGTGGGCTACG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 GAGTCCCAGCTGTGACAGTGGCCATTTCTGCAGCCTCCAGGCCTCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122806 GAGTCCCAGCTGTGACAGTGGCCATTTCTGCAGCCTCCAGGCCTCACCTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 TATGGAACACCTTCCCG         CTGCTGGCTCCAACCAGAAAAGGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 122856 TATGGAACACCTTCCCGGTT...CAGCTGCTGGCTCCAACCAGAAAAGGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 ATTTATATGGGGCTTCCTTGGACCTGTCTGCGCCATCTTCTCT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 127370 ATTTATATGGGGCTTCCTTGGACCTGTCTGCGCCATCTTCTCTGTG...A

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2059   GTGAATTTAGTTCTCTTTCTGGTGACTCTCTGGATTTTGAAAAACAGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127983 AGGTGAATTTAGTTCTCTTTCTGGTGACTCTCTGGATTTTGAAAAACAGA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CTCTCCTCCCTCAATAGTGACGTGTCCACCCTCCGGAACACAAG      
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||>>>...
 128033 CTCTCCTCCCTCAATAGTGAAGTGTCCACCCTCCGGAACACAAGGTA...

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151    GATGCTGGCATTTAAAGCGACAGCTCAGCTGTTCATCCTGGGCTGCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130521 CAGGATGCTGGCATTTAAAGCGACAGCTCAGCTGTTCATCCTGGGCTGCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 CGTGGTGTCTGGGCATCTTGCAGGTGGGTCCGGCTGCCCGGGTCATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130571 CGTGGTGTCTGGGCATCTTGCAGGTGGGTCCGGCTGCCCGGGTCATGGCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 TACCTCTTCACCATCATCAACAGCCTGCAGGGTGTCTTCATCTTCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130621 TACCTCTTCACCATCATCAACAGCCTGCAGGGTGTCTTCATCTTCCTGGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GTACTGCCTCCTCAGCCAGCAG         GTCCGGGAGCAATATGGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 130671 GTACTGCCTCCTCAGCCAGCAGGTA...CAGGTCCGGGAGCAATATGGGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 AATGGTCCAAAGGGATCAGGAAATTGAAAACTGAGTCTGAGATGCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130797 AATGGTCCAAAGGGATCAGGAAATTGAAAACTGAGTCTGAGATGCACACA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2389 CTCTCCAGCAGTGCTAAGGCTGACACCTCCAAACCCAGCACGGTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||-
 130847 CTCTCCAGCAGTGCTAAGGCTGACACCTCCAAACCCAGCACGGT AA