seq1 = pF1KE9420.tfa, 1011 bp
seq2 = pF1KE9420/gi568815592r_132488676.tfa (gi568815592r:132488676_132689686), 201011 bp

>pF1KE9420 1011
>gi568815592r:132488676_132689686 (Chr6)

(complement)

1-1011  (100001-101011)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGAGCTGTCTTCATCCAAGGTGCTGAAGAGCACCCTGCGGCATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGAGCTGTCTTCATCCAAGGTGCTGAAGAGCACCCTGCGGCATTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACCAGGTGAATGGGTCTTGCCCCAGGACAGTACATACTCTGGGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTACCAGGTGAATGGGTCTTGCCCCAGGACAGTACATACTCTGGGCATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTTGGTCATCTACCTGGCCTGTGCAGCAGGCATGCTGATTATCGTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTTGGTCATCTACCTGGCCTGTGCAGCAGGCATGCTGATTATCGTGCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGAATGTATTTGTGGCATTTGCTGTGTCCTACTTCAAAGCGCTTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGAATGTATTTGTGGCATTTGCTGTGTCCTACTTCAAAGCGCTTCACAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCCACCAACTTCCTGCTGCTCTCCCTGGCCCTGGCTGACATGTTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCCACCAACTTCCTGCTGCTCTCCCTGGCCCTGGCTGACATGTTTCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTCTGCTGGTGCTGCCCCTCAGCACCATTCGCTCAGTGGAGAGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTCTGCTGGTGCTGCCCCTCAGCACCATTCGCTCAGTGGAGAGCTGCTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTCGGGGACTTCCTCTGCCGCCTGCACACCTACCTGGACACCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTCGGGGACTTCCTCTGCCGCCTGCACACCTACCTGGACACCCTCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGCCTCACCTCCATCTTCCATCTCTGTTTCATTTCCATTGACCGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGCCTCACCTCCATCTTCCATCTCTGTTTCATTTCCATTGACCGCCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGCCATCTGTGACCCCCTGCTCTATCCCTCCAAGTTCACAGTGAGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGCCATCTGTGACCCCCTGCTCTATCCCTCCAAGTTCACAGTGAGGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTCTCAGGTACATCCTGGCAGGATGGGGGGTGCCCGCAGCATACACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTCTCAGGTACATCCTGGCAGGATGGGGGGTGCCCGCAGCATACACTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTTATTCCTCTACACAGATGTGGTAGAGACAAGGCTCAGCCAGTGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTTATTCCTCTACACAGATGTGGTAGAGACAAGGCTCAGCCAGTGGCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGAGATGCCTTGTGTGGGCAGTTGCCAGCTGCTGCTCAATAAATTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAGAGATGCCTTGTGTGGGCAGTTGCCAGCTGCTGCTCAATAAATTTTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCTGGTTAAACTTCCCTTTGTTCTTTGTCCCCTGCCTCATTATGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCTGGTTAAACTTCCCTTTGTTCTTTGTCCCCTGCCTCATTATGATCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTTGTATGTGAAGATCTTTGTGGTTGCTACCAGACAGGCTCAGCAGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTTGTATGTGAAGATCTTTGTGGTTGCTACCAGACAGGCTCAGCAGATTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCACATTGAGCAAAAGCCTGGCTGGGGCTGCCAAGCATGAGAGAAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCACATTGAGCAAAAGCCTGGCTGGGGCTGCCAAGCATGAGAGAAAAGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCAAGACCCTGGGCATTGCTGTGGGCATATACCTCTTGTGCTGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCAAGACCCTGGGCATTGCTGTGGGCATATACCTCTTGTGCTGGCTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTTCACCATAGACACGATGGTCGACAGCCTCCTTCACTTTATCACACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTTCACCATAGACACGATGGTCGACAGCCTCCTTCACTTTATCACACCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CACTGGTCTTTGACATCTTTATCTGGTTTGCTTACTTCAACTCAGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CACTGGTCTTTGACATCTTTATCTGGTTTGCTTACTTCAACTCAGCCTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACCCCATCATCTATGTCTTTTCCTACCAGTGGTTTCGGAAGGCACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACCCCATCATCTATGTCTTTTCCTACCAGTGGTTTCGGAAGGCACTGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ACTCACACTGAGCCAGAAGGTCTTCTCACCGCAGACACGCACTGTTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ACTCACACTGAGCCAGAAGGTCTTCTCACCGCAGACACGCACTGTTGATT

   1000     .    :
   1001 TGTACCAAGAA
        |||||||||||
 101001 TGTACCAAGAA