seq1 = pF1KE9418.tfa, 1134 bp
seq2 = pF1KE9418/gi568815592r_29386769.tfa (gi568815592r:29386769_29587902), 201134 bp

>pF1KE9418 1134
>gi568815592r:29386769_29587902 (Chr6)

(complement)

1-1134  (100001-101134)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCTGGGGGAAAATTTGCTGGTTCAGCCAGAGGGCTGGATGGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTCTGGGGGAAAATTTGCTGGTTCAGCCAGAGGGCTGGATGGACAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTTGCTGAGTCACAGATATCTCTCTCATGTAGCCTTTGTCTCCACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTTGCTGAGTCACAGATATCTCTCTCATGTAGCCTTTGTCTCCACAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGACCAGGAGGCACAGAACCCAAACCTGGTATCTCAGCTCTGTGGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGACCAGGAGGCACAGAACCCAAACCTGGTATCTCAGCTCTGTGGCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTCTTCAAAATGAGACGAATGAAACCATACATATGCAGATGAGCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTCTTCAAAATGAGACGAATGAAACCATACATATGCAGATGAGCATGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGTGGGACAGCAGGCCCTGCCCTTGAATATCATTGCCCCCAAGGCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGTGGGACAGCAGGCCCTGCCCTTGAATATCATTGCCCCCAAGGCTGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTCTCCCTCTGTGGGGTCTTATTGAATGGCACTGTCTTCTGGCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTCTCCCTCTGTGGGGTCTTATTGAATGGCACTGTCTTCTGGCTGCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGCTGTGGGGCCACGAATCCCTACATGGTATACATCCTCCACCTGGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGCTGTGGGGCCACGAATCCCTACATGGTATACATCCTCCACCTGGTCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCTGACGTGATCTATCTTTGCTGCTCGGCAGTGGGGTTCTTACAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCTGACGTGATCTATCTTTGCTGCTCGGCAGTGGGGTTCTTACAGGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTCTGCTAACTTATCATGGAGTCGTGTTTTTTATCCCTGATTTCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTCTGCTAACTTATCATGGAGTCGTGTTTTTTATCCCTGATTTCCTGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATATTGTCTCCCTTCTCCTTTGAGGTGTGTCTCTGTCTCCTGGTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATATTGTCTCCCTTCTCCTTTGAGGTGTGTCTCTGTCTCCTGGTGGCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGCACAGAGCGGTGTGTGTGTGTCCTCTTCCCCATCTGGTACAGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGCACAGAGCGGTGTGTGTGTGTCCTCTTCCCCATCTGGTACAGATGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCGCCCAAAATACACATCTAATGTTGTCTGCACCCTCATCTGGGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCGCCCAAAATACACATCTAATGTTGTCTGCACCCTCATCTGGGGCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCTTTTTGCATCAACATAGTAAAATCACTTTTCCTAACTTACTGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCTTTTTGCATCAACATAGTAAAATCACTTTTCCTAACTTACTGGAAACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTAAAGGCATGTGTCATATTTCTAAAGCTTTCTGGGCTCTTCCATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTAAAGGCATGTGTCATATTTCTAAAGCTTTCTGGGCTCTTCCATGCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCTTTCACTTGTGATGTGTGTGTCGAGTCTGACTCTACTCATTAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCTTTCACTTGTGATGTGTGTGTCGAGTCTGACTCTACTCATTAGATTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGTGCTGCTCCCAGCAGCAAAAGGCCACCAGGGTCTATGCGGTGGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGTGCTGCTCCCAGCAGCAAAAGGCCACCAGGGTCTATGCGGTGGTGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATCTCGGCCCCCATGTTCCTACTCTGGGCCCTACCCCTGAGCGTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATCTCGGCCCCCATGTTCCTACTCTGGGCCCTACCCCTGAGCGTGGCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCCTCATAACAGATTTCAAAATGTTTGTCACCACCTCCTATTTAATTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCCTCATAACAGATTTCAAAATGTTTGTCACCACCTCCTATTTAATTTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTGTTCCTCATTATAAACAGCAGCGCCAACCCTATCATTTATTTCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTGTTCCTCATTATAAACAGCAGCGCCAACCCTATCATTTATTTCTTTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGGGAGCCTCAGAAAGAAAAGGCTGAAGGAATCTCTCAGAGTGATTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGGGAGCCTCAGAAAGAAAAGGCTGAAGGAATCTCTCAGAGTGATTCTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AACGGGCGTTAGCAGATAAGCCAGAGGTGGGGAGGAACAAAAAGGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AACGGGCGTTAGCAGATAAGCCAGAGGTGGGGAGGAACAAAAAGGCAGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGCATCGACCCAATGGAGCAACCACACTCTACTCAGCATGTGGAGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGCATCGACCCAATGGAGCAACCACACTCTACTCAGCATGTGGAGAACCT

   1100     .    :    .    :    .    :
   1101 TCTTCCCAGGGAGCACAGGGTCGATGTGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TCTTCCCAGGGAGCACAGGGTCGATGTGGAAACA