seq1 = pF1KE9411.tfa, 1068 bp
seq2 = pF1KE9411/gi568815579f_50670601.tfa (gi568815579f:50670601_50871668), 201068 bp

>pF1KE9411 1068
>gi568815579f:50670601_50871668 (Chr19)

1-1068  (100001-101068)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATGGGGTCTCGGAGGGGACCAGAGGCTGCAGTGACAGGCAACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATGGGGTCTCGGAGGGGACCAGAGGCTGCAGTGACAGGCAACCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTCCTGACACGTGATCGCTCTTGTTCCAGGAAGATGAACTCTTCCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTCCTGACACGTGATCGCTCTTGTTCCAGGAAGATGAACTCTTCCGGAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTGTCTGAGGAGGTGGGGTCCCTCCGCCCACTGACTGTGGTTATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTGTCTGAGGAGGTGGGGTCCCTCCGCCCACTGACTGTGGTTATCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGCGTCCATTGTCGTCGGAGTGCTGGGCAATGGGCTGGTGCTGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGCGTCCATTGTCGTCGGAGTGCTGGGCAATGGGCTGGTGCTGTGGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GACTGTCTTCCGTATGGCACGCACGGTCTCCACCGTCTGCTTCTTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GACTGTCTTCCGTATGGCACGCACGGTCTCCACCGTCTGCTTCTTCCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCCCTTGCCGATTTCATGCTCTCACTGTCTCTGCCCATTGCCATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCCCTTGCCGATTTCATGCTCTCACTGTCTCTGCCCATTGCCATGTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TATATTGTCTCCAGGCAGTGGCTCCTCGGAGAGTGGGCCTGCAAACTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TATATTGTCTCCAGGCAGTGGCTCCTCGGAGAGTGGGCCTGCAAACTCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATCACCTTTGTGTTCCTCAGCTACTTTGCCAGTAACTGCCTCCTTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATCACCTTTGTGTTCCTCAGCTACTTTGCCAGTAACTGCCTCCTTGTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCTCTGTGGACCGTTGCATCTCTGTCCTCTACCCCGTCTGGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCTCTGTGGACCGTTGCATCTCTGTCCTCTACCCCGTCTGGGCCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACCACCGCACTGTGCAGCGGGCGAGCTGGCTGGCCTTTGGGGTGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACCACCGCACTGTGCAGCGGGCGAGCTGGCTGGCCTTTGGGGTGTGGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTGGCCGCCGCCTTGTGCTCTGCGCACCTGAAATTCCGGACAACCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTGGCCGCCGCCTTGTGCTCTGCGCACCTGAAATTCCGGACAACCAGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AATGGAATGGCTGTACGCACTGCTACTTGGCGTTCAACTCTGACAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AATGGAATGGCTGTACGCACTGCTACTTGGCGTTCAACTCTGACAATGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACTGCCCAGATTTGGATTGAAGGGGTCGTGGAGGGACACATTATAGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACTGCCCAGATTTGGATTGAAGGGGTCGTGGAGGGACACATTATAGGGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATTGGCCACTTCCTGCTGGGCTTCCTGGGGCCCTTAGCAATCATAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATTGGCCACTTCCTGCTGGGCTTCCTGGGGCCCTTAGCAATCATAGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCTGCGCCCACCTCATCCGGGCCAAGCTCTTGCGGGAGGGCTGGGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCTGCGCCCACCTCATCCGGGCCAAGCTCTTGCGGGAGGGCTGGGTCCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCAACCGGCCCAAGAGGCTGCTGCTGGTGCTGGTGAGCGCTTTCTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCAACCGGCCCAAGAGGCTGCTGCTGGTGCTGGTGAGCGCTTTCTTTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTTCTGGTCCCCGTTTAACGTGGTGCTGTTGGTCCATCTGTGGCGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTTCTGGTCCCCGTTTAACGTGGTGCTGTTGGTCCATCTGTGGCGACGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGATGCTCAAGGAAATCTACCACCCCCGGATGCTGCTCATCCTCCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGATGCTCAAGGAAATCTACCACCCCCGGATGCTGCTCATCCTCCAGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGCTTTGCCTTGGGCTGTGTCAACAGCAGCCTCAACCCCTTCCTCTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGCTTTGCCTTGGGCTGTGTCAACAGCAGCCTCAACCCCTTCCTCTACGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTTCGTTGGCAGAGATTTCCAAGAAAAGTTTTTCCAGTCTTTGACTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTTCGTTGGCAGAGATTTCCAAGAAAAGTTTTTCCAGTCTTTGACTTCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCCTGGCGAGGGCGTTTGGAGAGGAGGAGTTTCTGTCATCCTGTCCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCCTGGCGAGGGCGTTTGGAGAGGAGGAGTTTCTGTCATCCTGTCCCCGT

   1050     .    :    .
   1051 GGCAACGCCCCCCGGGAA
        ||||||||||||||||||
 101051 GGCAACGCCCCCCGGGAA