seq1 = pF1KE9277.tfa, 612 bp
seq2 = pF1KE9277/gi568815583f_74928319.tfa (gi568815583f:74928319_75149232), 220914 bp

>pF1KE9277 612
>gi568815583f:74928319_75149232 (Chr15)

1-135  (100001-100135)   100% ->
136-231  (115123-115218)   100% ->
232-360  (116068-116196)   99% ->
361-529  (120235-120403)   100% ->
530-612  (120832-120914)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAACCAAAGGCCTCCTGTCCAGCTGCTGCACCCTTGATGGAGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAACCAAAGGCCTCCTGTCCAGCTGCTGCACCCTTGATGGAGAGAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATTCCATGTTCTTGTGGGTGTCACGGGGAGTGTCGCAGCCCTGAAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATTCCATGTTCTTGTGGGTGTCACGGGGAGTGTCGCAGCCCTGAAGTTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCTTCTGGTGTCAAAGCTTTTGGACATTCCTGGG         CTGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100101 CTCTTCTGGTGTCAAAGCTTTTGGACATTCCTGGGGTG...CAGCTGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTAGCAGTGGTCACAACTGAGAGAGCCAAACATTTCTACAGCCCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115129 GTAGCAGTGGTCACAACTGAGAGAGCCAAACATTTCTACAGCCCCCAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATTCCTGTCACCCTCTACAGCGACGCTGATGAATGGGAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 115179 CATTCCTGTCACCCTCTACAGCGACGCTGATGAATGGGAGGTC...CAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTGGAAGAGCCGCTCTGACCCAGTTCTGCACATTGACCTGCGGAGGTGG
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116069 TATGGAAGAGCCGCTCTGACCCAGTTCTGCACATTGACCTGCGGAGGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCAGACCTCCTGCTGGTGGCTCCTCTTGATGCCAACACTCTGGGGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116119 GCAGACCTCCTGCTGGTGGCTCCTCTTGATGCCAACACTCTGGGGAAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCCAGTGGCATCTGTGACAACTTGCTT         ACCTGCGTCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 116169 GGCCAGTGGCATCTGTGACAACTTGCTTGTG...CAGACCTGCGTCATGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGCCTGGGACCGCAGCAAGCCCCTGCTCTTCTGCCCGGCCATGAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120248 GGGCCTGGGACCGCAGCAAGCCCCTGCTCTTCTGCCCGGCCATGAACACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCATGTGGGAGCACCCGATCACAGCGCAGCAGGTAGACCAGCTCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120298 GCCATGTGGGAGCACCCGATCACAGCGCAGCAGGTAGACCAGCTCAAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTTGGCTATGTCGAGATCCCCTGTGTGGCCAAGAAGCTGGTGTGCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120348 CTTTGGCTATGTCGAGATCCCCTGTGTGGCCAAGAAGCTGGTGTGCGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGAAG         GTCTCGGGGCCATGGCTGAAGTGGGGACCATCGTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120398 ATGAAGGTG...CAGGTCTCGGGGCCATGGCTGAAGTGGGGACCATCGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    565 GACAAAGTGAAAGAAGTCCTCTTCCAGCACAGTGGCTTCCAGCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120867 GACAAAGTGAAAGAAGTCCTCTTCCAGCACAGTGGCTTCCAGCAGAGT