seq1 = pF1KE9251.tfa, 1683 bp
seq2 = pF1KE9251/gi568815582r_67728270.tfa (gi568815582r:67728270_67933859), 205590 bp

>pF1KE9251 1683
>gi568815582r:67728270_67933859 (Chr16)

(complement)

1-110  (100001-100110)   100% ->
111-201  (101315-101405)   100% ->
202-289  (101545-101632)   100% ->
290-386  (101752-101848)   100% ->
387-523  (101970-102106)   100% ->
524-552  (102248-102276)   100% ->
553-703  (102494-102644)   100% ->
704-862  (103312-103470)   100% ->
863-1186  (103772-104095)   100% ->
1187-1280  (104344-104437)   100% ->
1281-1457  (105017-105193)   100% ->
1458-1562  (105282-105386)   100% ->
1563-1683  (105470-105590)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGACCACAACCCTGACAGCGACTCCACGCCGCGCACGCTGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGACCACAACCCTGACAGCGACTCCACGCCGCGCACGCTGCTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACGCGTGCTGGATACAGCGGACCCGCGCACCCCGCGGCGACCCCGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACGCGTGCTGGATACAGCGGACCCGCGCACCCCGCGGCGACCCCGGAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCGGGCTGG         AGCCCGGAGAGCCCTGCTTGAAACGGCTTCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCGGGCTGGGTA...CAGAGCCCGGAGAGCCCTGCTTGAAACGGCTTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCAGGAAGTTGAGTGGCCAAACAAGGACGATAGCCAGAGGGCGTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101346 CCCAGGAAGTTGAGTGGCCAAACAAGGACGATAGCCAGAGGGCGTTCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGAGCCAGG         TCTGTTGGCAGATCGGCCCATATTCAGGCCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101396 TGGAGCCAGGGTA...TAGTCTGTTGGCAGATCGGCCCATATTCAGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGGGCACTTGGAGGAACAGACACCTCGGACGCTGCTGAAGAACATCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101576 GTGGGCACTTGGAGGAACAGACACCTCGGACGCTGCTGAAGAACATCCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTAACTG         CCCCAGAATCTTCCATCCTGATGCCTGAGTCGGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101626 CTAACTGGTA...CAGCCCCAGAATCTTCCATCCTGATGCCTGAGTCGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGTGAAGCCAGTGCCAGCACCGCAGGCGGTCCAACCCTCCAGACAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101786 AGTGAAGCCAGTGCCAGCACCGCAGGCGGTCCAACCCTCCAGACAAGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCAGTTGCGGCAG         CCTGGAGCTGCAACTTCCTGAGCTCGAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101836 GCAGTTGCGGCAGGTA...TAGCCTGGAGCTGCAACTTCCTGAGCTCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CCCCCCACAACCCTGGCTCCAGGTCTGCTGGCCCCTGGCAGGAGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101998 CCCCCCACAACCCTGGCTCCAGGTCTGCTGGCCCCTGGCAGGAGGAAACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAGGCTGAGACTGTCAGTGTTTCAGCAGGGAGTGGACCAGGGGCTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102048 GAGGCTGAGACTGTCAGTGTTTCAGCAGGGAGTGGACCAGGGGCTGTCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCTCCCAAG         AGCCTCAAGGGAATGCTGATGCCTCTTCC   
        |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||>>>
 102098 TCTCCCAAGGTG...CAGAGCCTCAAGGGAATGCTGATGCCTCTTCCCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    553       CTCACCAGATCCCTCAACCTGACCTTTGCCACACCTCTTCAGCC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102280 ...CACCTCACCAGATCCCTCAACCTGACCTTTGCCACACCTCTTCAGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ACAGTCAGTGCAGAGGCCTGGCTTGGCCCGCAGACCTCCAGCCCGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102538 ACAGTCAGTGCAGAGGCCTGGCTTGGCCCGCAGACCTCCAGCCCGCCGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTGTAGACGTGGGTGCCTTTTTGCGGGATCTGCGAGATACTTCCCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102588 CTGTAGACGTGGGTGCCTTTTTGCGGGATCTGCGAGATACTTCCCTGGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCTCCAA         ACATTGTGTTGGAGGACACCCAGCCGTTCTCTCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102638 CCTCCAAGTA...CAGACATTGTGTTGGAGGACACCCAGCCGTTCTCTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GCCCATGGTTGGCTCCCCCAACGTGTATCACTCCCTGCCCTGCACGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103346 GCCCATGGTTGGCTCCCCCAACGTGTATCACTCCCTGCCCTGCACGCCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACACTGGGGCTGAAGACGCTGAGCAGGCTGCCGGTCGCAAGACACAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103396 ACACTGGGGCTGAAGACGCTGAGCAGGCTGCCGGTCGCAAGACACAGAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AGTGGGCCTGGGCTGCAGAAGAATA         GCCCTGGGAAACCAGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103446 AGTGGGCCTGGGCTGCAGAAGAATAGTG...CAGGCCCTGGGAAACCAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CCAGTTTCTGGCAGGAGAGGCAGAGGAGGTCAATGCCTTTGCTCTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103788 CCAGTTTCTGGCAGGAGAGGCAGAGGAGGTCAATGCCTTTGCTCTGGGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TCCTGAGCACCAGCAGTGGTGTCTCTGGAGAAGATGAAGTAGAGCCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103838 TCCTGAGCACCAGCAGTGGTGTCTCTGGAGAAGATGAAGTAGAGCCCTTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CACGATGGAGTTGAAGAGGCAGAGAAAAAGATGGAAGAAGAAGGTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103888 CACGATGGAGTTGAAGAGGCAGAGAAAAAGATGGAAGAAGAAGGTGTGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGTGAGTGAAATGGAGGCAACAGGAGCACAAGGACCCAGCAGGGTAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103938 TGTGAGTGAAATGGAGGCAACAGGAGCACAAGGACCCAGCAGGGTAGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGGCTGAGGGACACACAGAGGTGACAGAAGCAGAGGGATCCCAGGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103988 AGGCTGAGGGACACACAGAGGTGACAGAAGCAGAGGGATCCCAGGGGACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCTGAGGCTGACGGGCCAGGAGCATCTTCAGGGGATGAGGATGCCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104038 GCTGAGGCTGACGGGCCAGGAGCATCTTCAGGGGATGAGGATGCCTCTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CAGGGCAG         CAAGTCCAGAGTCGGCCTCCAGCACCCCTGAGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104088 CAGGGCAGGTA...TAGCAAGTCCAGAGTCGGCCTCCAGCACCCCTGAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CTCTCCAGGCCAGGCGACATCATCAGTTTCTTGAGCCAGCCCCAGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104377 CTCTCCAGGCCAGGCGACATCATCAGTTTCTTGAGCCAGCCCCAGCGCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GGTGCTGCAGT         CTTATCTTCAGAGCCTGCAGAGCCTCTGTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 104427 GGTGCTGCAGTGTA...CAGCTTATCTTCAGAGCCTGCAGAGCCTCTGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GGTCAGGCATCCCCCTAGGCCCCGGACCACCGGCCCCAGGCCCCGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105047 GGTCAGGCATCCCCCTAGGCCCCGGACCACCGGCCCCAGGCCCCGGCAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ATCCCCACAAGGCTGGACTGAGCCACTATGTGAAACTCTTTAGCTTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105097 ATCCCCACAAGGCTGGACTGAGCCACTATGTGAAACTCTTTAGCTTCTAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GCCAAGATGCCCATGGAGAGGAAGGCTCTTGAGATGGTGGAGAAGTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105147 GCCAAGATGCCCATGGAGAGGAAGGCTCTTGAGATGGTGGAGAAGTGGTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1458       CCTAGATAAATATTTCCAGCATCTTTGTGATGATCTGGAGGTAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105197 ...CAGCCTAGATAAATATTTCCAGCATCTTTGTGATGATCTGGAGGTAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TTGCTGCTCATGCTGGCCGCAAGACTGTGAAGCCAGAGGACCTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105326 TTGCTGCTCATGCTGGCCGCAAGACTGTGAAGCCAGAGGACCTGGAGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CTGATGCGGCG         GCAGGGCCTGGTCACTGACCAAGTCTCACT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105376 CTGATGCGGCGGTG...CAGGCAGGGCCTGGTCACTGACCAAGTCTCACT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GCACGTGCTAGTGGAGCGGCACCTGCCCCTGGAGTACCGGCAGCTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105500 GCACGTGCTAGTGGAGCGGCACCTGCCCCTGGAGTACCGGCAGCTGCTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TCCCCTGTGCATACAGTGGCAACTCTGTCTTCCCTGCCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105550 TCCCCTGTGCATACAGTGGCAACTCTGTCTTCCCTGCCCAG