seq1 = pF1KE9222.tfa, 3135 bp
seq2 = pF1KE9222/gi568815587r_113699243.tfa (gi568815587r:113699243_113975501), 276259 bp

>pF1KE9222 3135
>gi568815587r:113699243_113975501 (Chr11)

(complement)

1-57  (100001-100057)   100% ->
58-135  (121167-121244)   100% ->
136-268  (122869-123001)   100% ->
269-374  (133734-133839)   100% ->
375-534  (134745-134904)   100% ->
535-621  (141167-141253)   100% ->
622-759  (141945-142082)   100% ->
760-833  (143509-143582)   100% ->
834-910  (144559-144635)   100% ->
911-1059  (146157-146305)   100% ->
1060-1187  (148142-148269)   100% ->
1188-1283  (151802-151897)   100% ->
1284-1463  (157665-157844)   100% ->
1464-1672  (160120-160328)   100% ->
1673-1743  (161547-161617)   100% ->
1744-1972  (162998-163226)   100% ->
1973-2164  (166248-166439)   100% ->
2165-2304  (167065-167204)   99% ->
2305-2483  (170456-170634)   100% ->
2484-2562  (170751-170829)   100% ->
2563-2642  (171625-171704)   100% ->
2643-2766  (172221-172344)   100% ->
2767-2962  (173824-174019)   100% ->
2963-3135  (176087-176259)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGCGGAGCTGCAGCAGGACGACGCGGCCGGCGCGGCAGACGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTGCGGAGCTGCAGCAGGACGACGCGGCCGGCGCGGCAGACGGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCTCG         AGCTGCCAAATGCTGTTAAATCAACTGAGAGAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCTCGGTG...TAGAGCTGCCAAATGCTGTTAAATCAACTGAGAGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCACAGGCATTCAGGACCCTTCCTTTCTCCATGAAGCTCTGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 121201 TCACAGGCATTCAGGACCCTTCCTTTCTCCATGAAGCTCTGAAGGTT...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    136    GCCAGTAATGGTGACATTACTCAGGCAGTCAGCCTTCTCACTGATGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122866 TAGGCCAGTAATGGTGACATTACTCAGGCAGTCAGCCTTCTCACTGATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAGAGTTAAGGAGCCCAGTCAAGACACTGTTGCTACAGAACCATCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122916 GAGAGTTAAGGAGCCCAGTCAAGACACTGTTGCTACAGAACCATCTGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TAGAGGGGAGTGCTGCCAACAAGGAAGTATTAGCAA         AAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 122966 TAGAGGGGAGTGCTGCCAACAAGGAAGTATTAGCAAGTA...CAGAAGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATAGACCTTACTCATGATAACAAAGATGATCTTCAGGCTGCCATTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133739 ATAGACCTTACTCATGATAACAAAGATGATCTTCAGGCTGCCATTGCTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAGTCTACTGGAGTCTCCCAAAATTCAAGCTGATGGAAGAGATCTTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133789 GAGTCTACTGGAGTCTCCCAAAATTCAAGCTGATGGAAGAGATCTTAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 G         GATGCATGAAGCAACCTCTGCAGAAACTAAACGCTCAAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133839 GGTT...TAGGATGCATGAAGCAACCTCTGCAGAAACTAAACGCTCAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AGAAAACGCTGTGAAGTCTGGGGAGAAAACCCCAATCCCAATGACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134785 AGAAAACGCTGTGAAGTCTGGGGAGAAAACCCCAATCCCAATGACTGGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAGAGTTGATGGTTGGCCAGTTGGGCTGAAAAATGTTGGCAATACATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134835 GAGAGTTGATGGTTGGCCAGTTGGGCTGAAAAATGTTGGCAATACATGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGTTTAGTGCTGTTATTCAG         TCTCTCTTTCAATTGCCTGAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 134885 GGTTTAGTGCTGTTATTCAGGTA...CAGTCTCTCTTTCAATTGCCTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTTCGAAGACTTGTTCTCAGTTATAGTCTGCCACAAAATGTACTTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141188 TTTCGAAGACTTGTTCTCAGTTATAGTCTGCCACAAAATGTACTTGAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TTGTCGAAGTCATACA         GAAAAGAGAAATATCATGTTTATGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 141238 TTGTCGAAGTCATACAGTA...CAGGAAAAGAGAAATATCATGTTTATGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AAGAGCTTCAGTATTTGTTTGCTCTAATGATGGGATCAAATAGAAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141970 AAGAGCTTCAGTATTTGTTTGCTCTAATGATGGGATCAAATAGAAAATTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GTAGACCCGTCTGCAGCCCTGGATCTATTAAAGGGAGCATTCCGATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142020 GTAGACCCGTCTGCAGCCCTGGATCTATTAAAGGGAGCATTCCGATCATC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGAGGAACAGCAG         CAAGATGTGAGTGAATTCACACACAAGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 142070 TGAGGAACAGCAGGTA...TAGCAAGATGTGAGTGAATTCACACACAAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCCTGGATTGGCTAGAGGACGCATTCCAGCTAGCTGTTAATGTTAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 143537 TCCTGGATTGGCTAGAGGACGCATTCCAGCTAGCTGTTAATGTTAAGTG.

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    834      CAGTCCCAGGAACAAATCTGAAAATCCAATGGTGCAGCTGTTCTA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143587 ..CAGCAGTCCCAGGAACAAATCTGAAAATCCAATGGTGCAGCTGTTCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TGGTACTTTCCTGACTGAAGGGGTTCGTGAAG         GAAAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 144604 TGGTACTTTCCTGACTGAAGGGGTTCGTGAAGGTA...TAGGAAAACCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TTTGTAACAATGAGACCTTCGGCCAGTATCCTCTTCAGGTAAACGGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146166 TTTGTAACAATGAGACCTTCGGCCAGTATCCTCTTCAGGTAAACGGTTAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CGCAACTTAGACGAGTGTTTGGAAGGGGCCATGGTGGAGGGTGATGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146216 CGCAACTTAGACGAGTGTTTGGAAGGGGCCATGGTGGAGGGTGATGTTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GCTTCTTCCCTCCGATCACTCGGTGAAGTATGGACAAGAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 146266 GCTTCTTCCCTCCGATCACTCGGTGAAGTATGGACAAGAGGTA...TAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GTTGGTTTACAAAGCTACCTCCAGTGTTGACCTTTGAACTCTCAAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148143 GTTGGTTTACAAAGCTACCTCCAGTGTTGACCTTTGAACTCTCAAGATTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GAGTTTAATCAGTCCCTTGGGCAGCCAGAGAAAATTCACAATAAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148193 GAGTTTAATCAGTCCCTTGGGCAGCCAGAGAAAATTCACAATAAGCTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 ATTTCCTCAGATTATTTATATGGACAG         GTACATGTACAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 148243 ATTTCCTCAGATTATTTATATGGACAGGTG...TAGGTACATGTACAGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 GCAAGGAGCTTATTCGAAATAAGAGAGAGTGTATTCGAAAGTTGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151816 GCAAGGAGCTTATTCGAAATAAGAGAGAGTGTATTCGAAAGTTGAAGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GAAATAAAAATTCTGCAGCAAAAATTGGAAAG         GTATGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 151866 GAAATAAAAATTCTGCAGCAAAAATTGGAAAGGTG...TAGGTATGTGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 ATATGGCTCAGGCCCAGCTCGGTTCCCGCTCCCGGACATGCTGAAATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157674 ATATGGCTCAGGCCCAGCTCGGTTCCCGCTCCCGGACATGCTGAAATATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TTATTGAATTTGCTAGTACAAAACCTGCCTCAGAAAGCTGTCCACCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157724 TTATTGAATTTGCTAGTACAAAACCTGCCTCAGAAAGCTGTCCACCTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 AGTGACACACATATGACATTACCACTTTCTTCAGTGCACTGCTCGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157774 AGTGACACACATATGACATTACCACTTTCTTCAGTGCACTGCTCGGTTTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TGACCAGACATCCAAGGAAAG         TACAAGTACAGAAAGCTCTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 157824 TGACCAGACATCCAAGGAAAGGTA...CAGTACAAGTACAGAAAGCTCTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CTCAGGATGTTGAAAGTACCTTTTCTTCTCCTGAAGATTCTTTACCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160140 CTCAGGATGTTGAAAGTACCTTTTCTTCTCCTGAAGATTCTTTACCCAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 TCTAAACCACTGACATCTTCTCGGTCTTCCATGGAAATGCCTTCACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160190 TCTAAACCACTGACATCTTCTCGGTCTTCCATGGAAATGCCTTCACAGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 AGCTCCACGAACAGTCACAGATGAGGAGATAAATTTTGTTAAGACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160240 AGCTCCACGAACAGTCACAGATGAGGAGATAAATTTTGTTAAGACCTGTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TTCAGAGATGGAGGAGTGAGATTGAACAAGATATACAAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 160290 TTCAGAGATGGAGGAGTGAGATTGAACAAGATATACAAGGTT...CAGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 TTAAAGACTTGTATTGCAAGTACTACTCAGACTATTGAACAGATGTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161549 TTAAAGACTTGTATTGCAAGTACTACTCAGACTATTGAACAGATGTACTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 CGATCCTCTCCTTCGTCAG         GTGCCTTATCGCTTGCATGCAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 161599 CGATCCTCTCCTTCGTCAGGTA...CAGGTGCCTTATCGCTTGCATGCAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 TTCTTGTTCATGAAGGACAAGCAAATGCTGGACACTATTGGGCCTATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163020 TTCTTGTTCATGAAGGACAAGCAAATGCTGGACACTATTGGGCCTATATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 TATAATCAACCCCGACAGAGCTGGCTCAAGTACAATGACATCTCTGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163070 TATAATCAACCCCGACAGAGCTGGCTCAAGTACAATGACATCTCTGTTAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 TGAATCTTCCTGGGAAGAAGTTGAAAGAGATTCCTATGGAGGCCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163120 TGAATCTTCCTGGGAAGAAGTTGAAAGAGATTCCTATGGAGGCCTGAGAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 ATGTTAGTGCTTACTGTCTGATGTACATTAATGACAAACTACCCTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163170 ATGTTAGTGCTTACTGTCTGATGTACATTAATGACAAACTACCCTACTTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 AATGCAG         AGGCAGCCCCAACTGAATCAGATCAAATGTCAGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163220 AATGCAGGTA...CAGAGGCAGCCCCAACTGAATCAGATCAAATGTCAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 AGTGGAAGCCCTATCTGTGGAACTCAAGCATTACATTCAGGAGGATAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166282 AGTGGAAGCCCTATCTGTGGAACTCAAGCATTACATTCAGGAGGATAACT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 GGCGGTTTGAGCAGGAAGTAGAGGAGTGGGAAGAAGAGCAGTCTTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166332 GGCGGTTTGAGCAGGAAGTAGAGGAGTGGGAAGAAGAGCAGTCTTGCAAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 ATCCCTCAAATGGAGTCCTCCACCAACTCCTCATCACAGGACTACTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166382 ATCCCTCAAATGGAGTCCTCCACCAACTCCTCATCACAGGACTACTCTAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 ATCACAAG         AGCCTTCAGTAGCCTCTTCTCATGGGGTTCGCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 166432 ATCACAAGGTA...CAGAGCCTTCAGTAGCCTCTTCTCATGGGGTTCGCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 GCTTGTCATCTGAGCATGCTGTGATTGTAAAGGAGCAAACTGCCCAGGCT
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167098 GCTTGTCGTCTGAGCATGCTGTGATTGTAAAGGAGCAAACTGCCCAGGCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 ATTGCAAACACAGCCCGTGCCTATGAGAAGAGCGGTGTAGAAGCGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167148 ATTGCAAACACAGCCCGTGCCTATGAGAAGAGCGGTGTAGAAGCGGCACT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GAGTGAG         GCATTCCATGAAGAATACTCCAGGCTCTATCAGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167198 GAGTGAGGTG...TAGGCATTCCATGAAGAATACTCCAGGCTCTATCAGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 TTGCCAAAGAGACCCCCACCTCTCACAGTGATCCTCGACTTCAGCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170490 TTGCCAAAGAGACCCCCACCTCTCACAGTGATCCTCGACTTCAGCATGTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 CTTGTCTACTTTTTCCAAAATGAAGCACCCAAAAGGGTAGTAGAACGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170540 CTTGTCTACTTTTTCCAAAATGAAGCACCCAAAAGGGTAGTAGAACGAAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 CCTTCTGGAACAGTTTGCAGATAAAAATCTTAGCTATGATGAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 170590 CCTTCTGGAACAGTTTGCAGATAAAAATCTTAGCTATGATGAAAGGTG..

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484     ATCAATCAGCATTATGAAGGTGGCTCAAGCGAAACTGAAGGAAATT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170640 .CAGATCAATCAGCATTATGAAGGTGGCTCAAGCGAAACTGAAGGAAATT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 GGTCCAGATGACATGAATATGGAAGAGTACAAG         AAGTGGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 170797 GGTCCAGATGACATGAATATGGAAGAGTACAAGGTA...CAGAAGTGGCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571 TGAAGATTATAGTTTGTTCCGAAAAGTGTCTGTGTATCTCCTAACAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171633 TGAAGATTATAGTTTGTTCCGAAAAGTGTCTGTGTATCTCCTAACAGGCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 TAGAACTCTATCAAAAAGGAAA         GTACCAAGAGGCACTTTCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 171683 TAGAACTCTATCAAAAAGGAAAGTA...AAGGTACCAAGAGGCACTTTCC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2662 TACCTGGTATATGCCTACCAGAGCAATGCTGCCCTGCTGATGAAGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172240 TACCTGGTATATGCCTACCAGAGCAATGCTGCCCTGCTGATGAAGGGGCC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2712 CCGCCGGGGGGTCAAAGAATCCGTGATTGCTTTATACCGAAGAAAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172290 CCGCCGGGGGGTCAAAGAATCCGTGATTGCTTTATACCGAAGAAAATGCC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 TTCTG         GAGCTGAATGCCAAAGCAGCTTCTCTTTTTGAAACA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172340 TTCTGGTT...TAGGAGCTGAATGCCAAAGCAGCTTCTCTTTTTGAAACA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2803 AATGATGATCACTCCGTAACTGAGGGCATTAATGTGATGAATGAACTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173860 AATGATGATCACTCCGTAACTGAGGGCATTAATGTGATGAATGAACTGAT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2853 CATCCCCTGCATTCACCTTATCATTAATAATGACATTTCCAAGGATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173910 CATCCCCTGCATTCACCTTATCATTAATAATGACATTTCCAAGGATGATC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2903 TGGATGCCATTGAGGTCATGAGAAACCATTGGTGCTCTTACCTTGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173960 TGGATGCCATTGAGGTCATGAGAAACCATTGGTGCTCTTACCTTGGGCAA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 GATATTGCAG         AAAATCTGCAGCTGTGCCTAGGGGAGTTTCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 174010 GATATTGCAGGTA...CAGAAAATCTGCAGCTGTGCCTAGGGGAGTTTCT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2994 ACCCAGACTTCTAGATCCTTCTGCAGAAATCATCGTCTTGAAAGAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176118 ACCCAGACTTCTAGATCCTTCTGCAGAAATCATCGTCTTGAAAGAGCCTC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 CAACTATTCGACCCAATTCTCCCTATGACCTATGTAGCCGATTTGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176168 CAACTATTCGACCCAATTCTCCCTATGACCTATGTAGCCGATTTGCAGCT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 GTCATGGAGTCAATTCAGGGAGTTTCAACTGTGACAGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176218 GTCATGGAGTCAATTCAGGGAGTTTCAACTGTGACAGTGAAA