seq1 = pF1KE8021.tfa, 2223 bp
seq2 = pF1KE8021/gi568815581r_5286209.tfa (gi568815581r:5286209_5519650), 233442 bp

>pF1KE8021 2223
>gi568815581r:5286209_5519650 (Chr17)

(complement)

1-297  (100001-100297)   100% ->
298-467  (102969-103138)   100% ->
468-593  (105517-105642)   100% ->
594-680  (108862-108948)   100% ->
681-857  (110742-110918)   100% ->
858-1044  (114408-114594)   99% ->
1045-1192  (115405-115552)   100% ->
1193-1291  (120001-120099)   100% ->
1292-1382  (124670-124760)   100% ->
1383-1484  (127989-128090)   99% ->
1485-1643  (130691-130849)   100% ->
1644-1769  (131747-131872)   100% ->
1770-1835  (131981-132046)   100% ->
1836-1916  (132185-132265)   100% ->
1917-2043  (132541-132667)   100% ->
2044-2162  (132825-132943)   99% ->
2163-2223  (133382-133442)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCGCCGAGGGACCGGTGGGCGACGGCGAGCTGTGGCAGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCGCCGAGGGACCGGTGGGCGACGGCGAGCTGTGGCAGACCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTTCCTAACCACGTCGTGTTCTTGCGGCTCCGGGAGGGACTGAAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTTCCTAACCACGTCGTGTTCTTGCGGCTCCGGGAGGGACTGAAAAACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAGTCCAACCGAAGCTGAGAAACCAGCTTCTTCGTCGTTGCCTTCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAGTCCAACCGAAGCTGAGAAACCAGCTTCTTCGTCGTTGCCTTCGTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGCCGCCGCAGTTGCTGACGAGAAACGTGGTCTTTGGCCTCGGCGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGCCGCCGCAGTTGCTGACGAGAAACGTGGTCTTTGGCCTCGGCGGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTTTTCCTGTGGGACGGAGAAGACAGCTCCTTCTTAGTCGTTCGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTTTTCCTGTGGGACGGAGAAGACAGCTCCTTCTTAGTCGTTCGCCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGGCCCCAGCGGCGGCGGCGAAGAGCCCGCCCTGTCCCAGTACCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100251 GGGGCCCCAGCGGCGGCGGCGAAGAGCCCGCCCTGTCCCAGTACCAGGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    298       AGATTGCTTTGCATAAATCCACCCCTGTTTGAAATCTATCAAGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ...CAGAGATTGCTTTGCATAAATCCACCCCTGTTTGAAATCTATCAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTTGTTAAGCCCAACACAACATCATGTAGCACTTATAGGAATAAAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103013 CTTGTTAAGCCCAACACAACATCATGTAGCACTTATAGGAATAAAAGGAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTATGGTATTAGAATTACCTAAAAGATGGGGGAAGAATTCTGAATTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103063 TTATGGTATTAGAATTACCTAAAAGATGGGGGAAGAATTCTGAATTTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GGTGGAAAATCAACAGTGAATTGTAG         TACCACTCCAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 103113 GGTGGAAAATCAACAGTGAATTGTAGGTA...TAGTACCACTCCAGTTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGAGAGATTTTTCACCAGTTCCACCTCTCTGACTCTAAAGCATGCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105532 GGAGAGATTTTTCACCAGTTCCACCTCTCTGACTCTAAAGCATGCTGCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GGTATCCAAGTGAAATCCTGGATCCCCACGTAGTGCTGTTAACATCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105582 GGTATCCAAGTGAAATCCTGGATCCCCACGTAGTGCTGTTAACATCAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AACGTAATCAG         AATTTACTCACTACGTGAGCCGCAGACACC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105632 AACGTAATCAGGTA...TAGAATTTACTCACTACGTGAGCCGCAGACACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CACTAACGTGATAATACTTTCAGAAGCCGAAGAGGAAAGTCTAGTACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108892 CACTAACGTGATAATACTTTCAGAAGCCGAAGAGGAAAGTCTAGTACTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATAAAGG         AAGGGCGTATACCGCATCTCTAGGAGAGACAGCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108942 ATAAAGGGTA...CAGAAGGGCGTATACCGCATCTCTAGGAGAGACAGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTTGCATTTGACTTTGGGCCATTGGCAGCAGTCCCAAAGACTCTATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110776 GTTGCATTTGACTTTGGGCCATTGGCAGCAGTCCCAAAGACTCTATTTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ACAAAACGGCAAAGATGAAGTAGTGGCATACCCACTGTACATCTTATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110826 ACAAAACGGCAAAGATGAAGTAGTGGCATACCCACTGTACATCTTATATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AAAATGGAGAGACTTTCCTGACATACATCAGTCTGTTACACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110876 AAAATGGAGAGACTTTCCTGACATACATCAGTCTGTTACACAGGTA...T

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    858   CCCTGGAAATATTGGAAAGCTGTTGGGTCCATTGCCCATGCATCCTGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114406 AGCCCTGGAAATATTGGAAAGCTGTTGGGTCCATTGCCCATGCATCCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGCTGAAGATAACTATGGTTATGATGCGTGTGCTGTACTCTGCTTACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114456 GGCTGAAGATAACTATGGTTATGATGCGTGTGCTGTACTCTGCTTACCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GTGTCCCCAATATCTTAGTGATCGCTACTGAATCAGGAATGCTGTATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114506 GTGTCCCCAATATCTTAGTGATCGCTACTGAATCAGGAATGCTGTATCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TGTGTCGTGCTAGAAGGGGAAGAAGAAGATGACCACACA         TC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| >>>...>>>||
 114556 TGTGTCGTGCTAGAAGGGGAAGAAGAAGATGACCACACGGTA...CAGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGAAAAGTCCTGGGATTCCAGGATTGACCTCATTCCTTCTCTGTATGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115407 AGAAAAGTCCTGGGATTCCAGGATTGACCTCATTCCTTCTCTGTATGTGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TTGAATGTGTTGAGTTGGAGCTTGCTTTGAAACTGGCATCTGGAGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115457 TTGAATGTGTTGAGTTGGAGCTTGCTTTGAAACTGGCATCTGGAGAGGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GACCCTTTTGATTCTGACTTTTCTTGTCCAGTCAAACTTCATAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 115507 GACCCTTTTGATTCTGACTTTTCTTGTCCAGTCAAACTTCATAGAGGTA.

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193      ATCCCAAGTGTCCTTCAAGATATCACTGTACTCATGAAGCTGGTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115557 ..CAGATCCCAAGTGTCCTTCAAGATATCACTGTACTCATGAAGCTGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TACATAGTGTTGGGCTAACTTGGATTCATAAACTTCACAAATTTCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120046 TACATAGTGTTGGGCTAACTTGGATTCATAAACTTCACAAATTTCTTGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TCAG         ATGAAGAAGATAAGGATAGTTTACAGGAACTCTCTAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120096 TCAGGTG...TAGATGAAGAAGATAAGGATAGTTTACAGGAACTCTCTAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 AGAACAGAAATGCTTTGTTGAACACATCCTTTGTACGAAGCCATTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124707 AGAACAGAAATGCTTTGTTGAACACATCCTTTGTACGAAGCCATTGCCCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GCAG         GCAGCCTGCTCCAATTCGAGGATTTTGGATTGTACCT
        ||||>>>...>>>|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 124757 GCAGGTA...CAGGCAGCCAGCTCCAATTCGAGGATTTTGGATTGTACCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GACATTCTGGGACCCACGATGATCTGCATCACCAGTACCTATGAATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128026 GACATTCTGGGACCCACGATGATCTGCATCACCAGTACCTATGAATGCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CATATGGCCGTTATT         AAGTACAGTCCATCCAGCGTCTCCTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 128076 CATATGGCCGTTATTGTA...CAGAAGTACAGTCCATCCAGCGTCTCCTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CCCTGCTTTGTACTCGAGAAGATGTTGAAGTGGCAGAGTCTCCCCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130717 CCCTGCTTTGTACTCGAGAAGATGTTGAAGTGGCAGAGTCTCCCCTCCGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GTTCTGGCTGAAACCCCAGATTCCTTTGAAAAGCATATTAGAAGCATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130767 GTTCTGGCTGAAACCCCAGATTCCTTTGAAAAGCATATTAGAAGCATTTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 GCAACGTAGTGTTGCCAATCCAGCATTTTTGAA         AGCTTCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 130817 GCAACGTAGTGTTGCCAATCCAGCATTTTTGAAGTA...AAGAGCTTCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AAAAGGACATAGCCCCTCCTCCTGAAGAATGCCTTCAGCTCCTCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131755 AAAAGGACATAGCCCCTCCTCCTGAAGAATGCCTTCAGCTCCTCAGCAGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GCCACCCAGGTGTTCAGAGAGCAGTACATTCTCAAACAGGACTTGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131805 GCCACCCAGGTGTTCAGAGAGCAGTACATTCTCAAACAGGACTTGGCAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GGAGGAGATTCAGCGGAG         GGTCAAATTATTATGTGACCAAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 131855 GGAGGAGATTCAGCGGAGGTA...AAGGGTCAAATTATTATGTGACCAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AAAAGAAACAACTAGAAGATCTCAGTTATTGTCGAGAAGAGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 132004 AAAAGAAACAACTAGAAGATCTCAGTTATTGTCGAGAAGAGAGGTA...T

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1836   GAAAAGTCTGCGGGAAATGGCTGAGCGTTTAGCTGACAAATATGAGGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132183 AGGAAAAGTCTGCGGGAAATGGCTGAGCGTTTAGCTGACAAATATGAGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 AGCTAAAGAAAAACAAGAGGATATCATGAACAG         GATGAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 132233 AGCTAAAGAAAAACAAGAGGATATCATGAACAGGTC...AAGGATGAAAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 AACTACTTCACAGTTTTCACTCTGAGCTCCCAGTTCTCTCTGATAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132549 AACTACTTCACAGTTTTCACTCTGAGCTCCCAGTTCTCTCTGATAGTGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 CGAGACATGAAGAAAGAATTACAGCTGATACCTGATCAACTTCGACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132599 CGAGACATGAAGAAAGAATTACAGCTGATACCTGATCAACTTCGACATTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 GGGCAATGCCATCAAACAG         GTTACTATGAAAAAGGATTATC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 132649 GGGCAATGCCATCAAACAGGTA...AAGGTTACTATGAAAAAGGATTATC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 AACAGCAAAAGATGGAGAAGGTGTTGAGTCTTCCAAAACCCACCATTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132847 AACAGCAAAAGATGGAGAAGGTGTTGAGTCTTCCAAAACCCACCATTATT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 CTCAGTGCCTACCAGCGAAAGTGCATTCAGTCCATCCTGAAGGAGGA   
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||>>>
 132897 CTCAGTGCCTACCAGCGAAAGTGCATTCAGTCCATCCTGAAAGAGGAGTA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2163       GGGTGAACACATAAGGGAAATGGTGAAGCAAATCAATGATATCC
        ...>>>||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132947 ...CAGGGGTGAACATATAAGGGAAATGGTGAAGCAAATCAATGATATCC

   2350     .    :    .
   2207 GCAATCATGTAAACTTC
        |||||||||||||||||
 133426 GCAATCATGTAAACTTC