seq1 = pF1KE6821.tfa, 1137 bp
seq2 = pF1KE6821/gi568815593r_139376264.tfa (gi568815593r:139376264_139581704), 205441 bp

>pF1KE6821 1137
>gi568815593r:139376264_139581704 (Chr5)

(complement)

1-227  (100001-100227)   100% ->
228-411  (100363-100546)   100% ->
412-520  (100807-100915)   100% ->
521-759  (103197-103435)   100% ->
760-946  (104190-104376)   100% ->
947-1137  (105251-105441)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCCACTCCAGCCTGCATCCATCCATCCCGTGTCCCAGGGGTCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCCACTCCAGCCTGCATCCATCCATCCCGTGTCCCAGGGGTCACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCAGAAGGCAGCCTTGGTTCTGCTGAGTGCCTGCCTGGTGACCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCAGAAGGCAGCCTTGGTTCTGCTGAGTGCCTGCCTGGTGACCCTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGGGCTAGGAGAGCCACCAGAGCACACTCTCCGGTACCTGGTGCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGGGCTAGGAGAGCCACCAGAGCACACTCTCCGGTACCTGGTGCTCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTAGCCTCCCTGCAGCTGGGACTGCTGTTAAACGGGGTCTGCAGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTAGCCTCCCTGCAGCTGGGACTGCTGTTAAACGGGGTCTGCAGCCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGGAGCTGCGCCACATCCACTCCAG         GTACCGGGGCAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100201 TGAGGAGCTGCGCCACATCCACTCCAGGTG...CAGGTACCGGGGCAGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTGGAGGACTGTGCGGGCCTGCCTGGGCTGCCCCCTCCGCCGTGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100377 ACTGGAGGACTGTGCGGGCCTGCCTGGGCTGCCCCCTCCGCCGTGGGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGTTGCTGCTGTCCATCTATTTCTACTACTCCCTCCCAAATGCGGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100427 CTGTTGCTGCTGTCCATCTATTTCTACTACTCCCTCCCAAATGCGGTCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCGCCCTTCACTTGGATGCTTGCCCTCCTGGGCCTCTCGCAGGCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100477 CCCGCCCTTCACTTGGATGCTTGCCCTCCTGGGCCTCTCGCAGGCACTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACATCCTCCTGGGCCTCAAG         GGCCTGGCCCCAGCTGAGATC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100527 ACATCCTCCTGGGCCTCAAGGTA...CAGGGCCTGGCCCCAGCTGAGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCTGCAGTGTGTGAAAAAGGGAATTTCAACGTGGCCCATGGGCTGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100828 TCTGCAGTGTGTGAAAAAGGGAATTTCAACGTGGCCCATGGGCTGGCATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTCATATTACATCGGATATCTGCGGCTGATCCTGCCAG         AGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100878 GTCATATTACATCGGATATCTGCGGCTGATCCTGCCAGGTG...CAGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCAGGCCCGGATTCGAACTTACAATCAGCATTACAACAACCTGCTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103200 TCCAGGCCCGGATTCGAACTTACAATCAGCATTACAACAACCTGCTACGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGTGCAGTGAGCCAGCGGCTGTATATTCTCCTCCCATTGGACTGTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103250 GGTGCAGTGAGCCAGCGGCTGTATATTCTCCTCCCATTGGACTGTGGGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCCTGATAACCTGAGTATGGCTGACCCCAACATTCGCTTCCTGGATAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103300 GCCTGATAACCTGAGTATGGCTGACCCCAACATTCGCTTCCTGGATAAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGCCCCAGCAGACCGGTGACCATGCTGGCATCAAGGATCGGGTTTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103350 TGCCCCAGCAGACCGGTGACCATGCTGGCATCAAGGATCGGGTTTACAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AACAGCATCTATGAGCTTCTGGAGAACGGGCAGCGG         GCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 103400 AACAGCATCTATGAGCTTCTGGAGAACGGGCAGCGGGTA...TAGGCGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CACCTGTGTCCTGGAGTACGCCACCCCCTTGCAGACTTTGTTTGCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104195 CACCTGTGTCCTGGAGTACGCCACCCCCTTGCAGACTTTGTTTGCCATGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CACAATACAGTCAAGCTGGCTTTAGCCGGGAGGATAGGCTTGAGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104245 CACAATACAGTCAAGCTGGCTTTAGCCGGGAGGATAGGCTTGAGCAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AAACTCTTCTGCCGGACACTTGAGGACATCCTGGCAGATGCCCCTGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104295 AAACTCTTCTGCCGGACACTTGAGGACATCCTGGCAGATGCCCCTGAGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TCAGAACAACTGCCGCCTCATTGCCTACCAGG         AACCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104345 TCAGAACAACTGCCGCCTCATTGCCTACCAGGGTG...CAGAACCTGCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ATGACAGCAGCTTCTCGCTGTCCCAGGAGGTTCTCCGGCACCTGCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105260 ATGACAGCAGCTTCTCGCTGTCCCAGGAGGTTCTCCGGCACCTGCGGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAGGAAAAGGAAGAGGTTACTGTGGGCAGCTTGAAGACCTCAGCGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105310 GAGGAAAAGGAAGAGGTTACTGTGGGCAGCTTGAAGACCTCAGCGGTGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CAGTACCTCCACGATGTCCCAAGAGCCTGAGCTCCTCATCAGTGGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105360 CAGTACCTCCACGATGTCCCAAGAGCCTGAGCTCCTCATCAGTGGAATGG

   1150     .    :    .    :    .    :
   1106 AAAAGCCCCTCCCTCTCCGCACGGATTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 105410 AAAAGCCCCTCCCTCTCCGCACGGATTTCTCT