seq1 = pF1KE6794.tfa, 3396 bp
seq2 = pF1KE6794/gi568815575r_139631657.tfa (gi568815575r:139631657_139926825), 295169 bp

>pF1KE6794 3396
>gi568815575r:139631657_139926825 (ChrX)

(complement)

1-36  (94637-94672)   100% ->
37-156  (100003-100122)   100% ->
157-246  (107399-107488)   98% ->
247-327  (109883-109963)   100% ->
328-435  (111841-111948)   99% ->
436-564  (122227-122355)   100% ->
565-668  (124487-124590)   100% ->
669-719  (126716-126766)   100% ->
720-784  (128083-128147)   100% ->
785-866  (128472-128553)   100% ->
867-1017  (129500-129650)   100% ->
1018-1215  (130356-130553)   100% ->
1216-1377  (137338-137499)   100% ->
1378-1529  (138483-138634)   100% ->
1530-1601  (139582-139653)   100% ->
1602-1675  (141527-141600)   100% ->
1676-1779  (143559-143662)   100% ->
1780-1961  (144098-144279)   100% ->
1962-2225  (151873-152136)   100% ->
2226-2400  (158392-158566)   100% ->
2401-2503  (163408-163510)   100% ->
2504-2649  (164720-164865)   99% ->
2650-2709  (168959-169018)   100% ->
2710-2837  (176674-176801)   100% ->
2838-2973  (180969-181104)   100% ->
2974-3039  (183202-183267)   100% ->
3040-3143  (185732-185835)   100% ->
3144-3297  (188757-188910)   100% ->
3298-3396  (195071-195169)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGATGGTCCCATCTCTCCCTCCAGCCTCTGAG         TGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  94637 ATGCAGATGGTCCCATCTCTCCCTCCAGCCTCTGAGGTT...CAGTGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGGAGAAGAGAAACGAGTTGGCACACGCACAGTGTTTGTTGGCAATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100008 TGGAGAAGAGAAACGAGTTGGCACACGCACAGTGTTTGTTGGCAATCATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGTTTCGGAAACAGAAGCTTACATTGCACAAAGATTTTGTGATAATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100058 CAGTTTCGGAAACAGAAGCTTACATTGCACAAAGATTTTGTGATAATAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATAGTCTCATCTAAG         TATACACTTTGGAATTTTCTCCCAAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100108 ATAGTCTCATCTAAGGTA...CAGTATACACTTTGGAATTTTCTCCCAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAATCTGTTTGAACAGTTTAGAAGAATTGCAAATTTTTATTTTCTCATAA
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107425 GAATCTGTTTGAACAGTTTAGAAGAATTGCAAATTTTTATTTTCTCATAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCTTCCTTGTACAG         GTCACAGTAGACACACCAACTAGCCCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 107475 TCTTCCTTGTACAGGTA...TAGGTCACAGTAGACACACCAACTAGCCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTTACCAGTGGACTTCCACTTTTCTTTGTTATAACTGTTACAGCCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109910 GTTACCAGTGGACTTCCACTTTTCTTTGTTATAACTGTTACAGCCATCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCAG         GGATATGAGGATTGGCTGAGACACAGAGCTGACAATG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 109960 GCAGGTA...CAGGGATATGAGGATTGTCTGAGACACAGAGCTGACAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAGTCAACAAAAGCACTGTTTACATTATTGAAAATGCAAAGCGAGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111878 AAGTCAACAAAAGCACTGTTTACATTATTGAAAATGCAAAGCGAGTGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAAGAAAGTGAAAAAATCAAG         GTTGGTGATGTAGTAGAAGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 111928 AAAGAAAGTGAAAAAATCAAGGTA...CAGGTTGGTGATGTAGTAGAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 ACAGGCAGATGAAACCTTTCCCTGTGATCTTATTCTTCTATCATCTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122247 ACAGGCAGATGAAACCTTTCCCTGTGATCTTATTCTTCTATCATCTTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCACTGATGGAACCTGTTATGTCACTACAGCCAGTCTTGATGGGGAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122297 CCACTGATGGAACCTGTTATGTCACTACAGCCAGTCTTGATGGGGAATCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AATTGCAAG         ACACATTATGCAGTACGTGATACCATTGCACT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 122347 AATTGCAAGGTA...TAGACACATTATGCAGTACGTGATACCATTGCACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GTGTACAGCAGAATCCATCGATACCCTCCGAGCAGCAATTGAATGTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124519 GTGTACAGCAGAATCCATCGATACCCTCCGAGCAGCAATTGAATGTGAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGCCTCAACCTGACCTCTACAA         ATTTGTTGGGCGAATCAAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 124569 AGCCTCAACCTGACCTCTACAAGTA...CAGATTTGTTGGGCGAATCAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 ATCTACAGTAATAGTCTTGAGGCTGTTGCCAG         GTCTTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 126735 ATCTACAGTAATAGTCTTGAGGCTGTTGCCAGGTA...TAGGTCTTTGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 ACCTGAAAATCTCTTGCTGAAAGGAGCTACGCTAAAAAATACCGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128092 ACCTGAAAATCTCTTGCTGAAAGGAGCTACGCTAAAAAATACCGAGAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TATATG         GAGTTGCTGTTTACACTGGAATGGAAACCAAAATG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128142 TATATGGTG...TAGGAGTTGCTGTTTACACTGGAATGGAAACCAAAATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GCTTTGAACTACCAAGGGAAATCTCAGAAACGTTCTGCTGTTGAAAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 128507 GCTTTGAACTACCAAGGGAAATCTCAGAAACGTTCTGCTGTTGAAAAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    867       ATCTATTAATGCTTTCCTGATTGTATATTTATTTATCTTACTGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128557 ...CAGATCTATTAATGCTTTCCTGATTGTATATTTATTTATCTTACTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 CCAAAGCTGCAGTATGCACTACTCTAAAGTATGTTTGGCAAAGTACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129544 CCAAAGCTGCAGTATGCACTACTCTAAAGTATGTTTGGCAAAGTACCCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 TACAATGATGAACCTTGGTATAACCAAAAGACTCAGAAAGAGCGAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129594 TACAATGATGAACCTTGGTATAACCAAAAGACTCAGAAAGAGCGAGAGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CTTGAAG         GTTTTAAAAATGTTCACCGACTTCCTATCATTTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129644 CTTGAAGGTA...TAGGTTTTAAAAATGTTCACCGACTTCCTATCATTTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TGGTTCTATTCAACTTTATCATTCCTGTCTCCATGTACGTCACAGTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130390 TGGTTCTATTCAACTTTATCATTCCTGTCTCCATGTACGTCACAGTAGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 ATGCAGAAATTCTTGGGCTCCTTCTTCATCTCATGGGATAAGGACTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130440 ATGCAGAAATTCTTGGGCTCCTTCTTCATCTCATGGGATAAGGACTTTTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TGATGAAGAAATTAATGAAGGAGCCCTGGTTAACACATCAGACCTTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130490 TGATGAAGAAATTAATGAAGGAGCCCTGGTTAACACATCAGACCTTAATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 AAGAACTTGGTCAG         GTGGATTATGTATTTACAGATAAGACT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 130540 AAGAACTTGGTCAGGTT...TAGGTGGATTATGTATTTACAGATAAGACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 GGAACACTCACTGAAAACAGCATGGAATTCATTGAATGCTGCATAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137365 GGAACACTCACTGAAAACAGCATGGAATTCATTGAATGCTGCATAGATGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CCACAAATATAAAGGTGTAACTCAAGAGGTTGATGGATTATCTCAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137415 CCACAAATATAAAGGTGTAACTCAAGAGGTTGATGGATTATCTCAAACTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 ATGGAACTTTAACATATTTTGACAAAGTAGATAAG         AATCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 137465 ATGGAACTTTAACATATTTTGACAAAGTAGATAAGGTG...CAGAATCGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GAAGAGCTGTTTCTACGTGCCTTGTGTTTATGTCATACTGTAGAAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138489 GAAGAGCTGTTTCTACGTGCCTTGTGTTTATGTCATACTGTAGAAATCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 AACAAACGATGCTGTTGATGGAGCTACAGAATCAGCTGAATTAACCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138539 AACAAACGATGCTGTTGATGGAGCTACAGAATCAGCTGAATTAACCTATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TCTCCTCTTCACCAGATGAAATAGCTTTGGTGAAAGGAGCTAAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 138589 TCTCCTCTTCACCAGATGAAATAGCTTTGGTGAAAGGAGCTAAAAGGTA.

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1530      GTACGGGTTCACATTTTTAGGAAATCGAAATGGATATATGAGAGT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138639 ..TAGGTACGGGTTCACATTTTTAGGAAATCGAAATGGATATATGAGAGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 AGAGAACCAAAGAAAAGAAATAGAAGA         ATATGAACTTCTTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 139627 AGAGAACCAAAGAAAAGAAATAGAAGAGTA...AAGATATGAACTTCTTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 ACACCTTAAACTTTGATGCTGTCCGGCGACGTATGAGTGTAATTGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141541 ACACCTTAAACTTTGATGCTGTCCGGCGACGTATGAGTGTAATTGTGAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 ACTCAAGAAG         GAGACATACTTCTCTTTTGTAAAGGAGCAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 141591 ACTCAAGAAGGTA...TAGGAGACATACTTCTCTTTTGTAAAGGAGCAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 CTCGGCAGTTTTTCCCAGAGTGCAAAATCATGAAATTGAGTTAACTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143590 CTCGGCAGTTTTTCCCAGAGTGCAAAATCATGAAATTGAGTTAACTAAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 TCCATGTGGAACGTAATGCAATG         GATGGGTATCGGACACTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 143640 TCCATGTGGAACGTAATGCAATGGTG...TAGGATGGGTATCGGACACTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 TGTGTAGCCTTCAAAGAAATTGCTCCAGATGATTATGAAAGAATTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144116 TGTGTAGCCTTCAAAGAAATTGCTCCAGATGATTATGAAAGAATTAACAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 ACAGCTCATAGAGGCAAAAATGGCCTTACAAGACAGAGAAGAAAAAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144166 ACAGCTCATAGAGGCAAAAATGGCCTTACAAGACAGAGAAGAAAAAATGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 AAAAAGTTTTCGATGATATTGAGACAAACATGAATTTAATTGGAGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144216 AAAAAGTTTTCGATGATATTGAGACAAACATGAATTTAATTGGAGCCACT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 GCAGTTGAAGACAA         GCTACAAGATCAAGCTGCAGAGACCAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 144266 GCAGTTGAAGACAAGTA...CAGGCTACAAGATCAAGCTGCAGAGACCAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 TGAAGCTCTGCATGCAGCAGGCCTGAAAGTCTGGGTGCTCACTGGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151900 TGAAGCTCTGCATGCAGCAGGCCTGAAAGTCTGGGTGCTCACTGGGGACA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 AGATGGAGACAGCTAAATCCACATGCTATGCCTGCCGCCTTTTCCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151950 AGATGGAGACAGCTAAATCCACATGCTATGCCTGCCGCCTTTTCCAGACC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 AACACTGAGCTCTTAGAACTAACCACAAAAACCATTGAAGAAAGTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152000 AACACTGAGCTCTTAGAACTAACCACAAAAACCATTGAAGAAAGTGAAAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 GAAAGAAGATCGATTACATGAATTATTGATAGAATATCGCAAGAAATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152050 GAAAGAAGATCGATTACATGAATTATTGATAGAATATCGCAAGAAATTGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 TGCATGAGTTTCCTAAAAGTACTAGAAGCTTTAAAAA         AGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 152100 TGCATGAGTTTCCTAAAAGTACTAGAAGCTTTAAAAAGTA...CAGAGCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 TGGACAGAACATCAGGAATATGGATTAATCATAGATGGCTCCACATTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158396 TGGACAGAACATCAGGAATATGGATTAATCATAGATGGCTCCACATTGTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 ACTCATACTAAATTCTAGTCAAGACTCTAGTTCAAACAATTACAAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158446 ACTCATACTAAATTCTAGTCAAGACTCTAGTTCAAACAATTACAAAAGCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 TTTTCCTACAAATATGTATGAAGTGTACTGCAGTGCTCTGCTGTCGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158496 TTTTCCTACAAATATGTATGAAGTGTACTGCAGTGCTCTGCTGTCGGATG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 GCACCATTACAGAAAGCCCAG         ATTGTCAGAATGGTGAAGAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 158546 GCACCATTACAGAAAGCCCAGGTA...TAGATTGTCAGAATGGTGAAGAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2421 TTTAAAAGGCAGCCCAATAACTCTGTCGATAGGTGATGGTGCCAATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163428 TTTAAAAGGCAGCCCAATAACTCTGTCGATAGGTGATGGTGCCAATGATG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 TTAGTATGATCTTGGAATCCCATGTGGGAATAG         GTATTAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 163478 TTAGTATGATCTTGGAATCCCATGTGGGAATAGGTA...TAGGTATTAAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2512 GGCAAAGAAGGTCGCCAAGCAGCTAGGAATAGCGATTATTCTGTTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164728 GGCAAAGAAGGTCGCCAAGCAGCTAGGAATAGCGATTATTCTGTTCCAAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 GTTCAAACACTTAAAGAAACTGCTGTTGGCTCATGGACATCTATATTATG
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164778 GTTTAAACACTTAAAGAAACTGCTGTTGGCTCATGGACATCTATATTATG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 TGAGAATAGCACACCTTGTACAGTACTTCTTCTATAAG         AAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 164828 TGAGAATAGCACACCTTGTACAGTACTTCTTCTATAAGGTA...CAGAAC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2653 CTTTGTTTCATTTTGCCACAGTTTTTGTACCAGTTCTTCTGTGGATTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168962 CTTTGTTTCATTTTGCCACAGTTTTTGTACCAGTTCTTCTGTGGATTCTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 ACAACAG         CCACTGTATGATGCTGCTTACCTTACAATGTACA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169012 ACAACAGGTT...TAGCCACTGTATGATGCTGCTTACCTTACAATGTACA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2744 ATATCTGCTTCACATCCTTGCCCATCCTGGCCTATAGTCTACTGGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176708 ATATCTGCTTCACATCCTTGCCCATCCTGGCCTATAGTCTACTGGAACAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2794 CACATCAACATTGACACTCTGACCTCAGATCCCCGATTGTATAT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 176758 CACATCAACATTGACACTCTGACCTCAGATCCCCGATTGTATATGTA...

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2838    GAAAATTTCTGGCAATGCCATGCTACAGTTGGGCCCCTTCTTATATT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180966 TAGGAAAATTTCTGGCAATGCCATGCTACAGTTGGGCCCCTTCTTATATT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2885 GGACATTTCTGGCTGCCTTTGAAGGGACAGTGTTCTTCTTTGGGACTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181016 GGACATTTCTGGCTGCCTTTGAAGGGACAGTGTTCTTCTTTGGGACTTAC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2935 TTTCTTTTTCAGACTGCATCCCTAGAAGAAAATGGAAAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 181066 TTTCTTTTTCAGACTGCATCCCTAGAAGAAAATGGAAAGGTA...CAGGT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2976 ATACGGAAACTGGACTTTTGGAACCATTGTTTTTACAGTCTTAGTATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183204 ATACGGAAACTGGACTTTTGGAACCATTGTTTTTACAGTCTTAGTATTCA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3026 CTGTAACCCTGAAG         CTTGCCTTGGATACCCGATTCTGGACG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 183254 CTGTAACCCTGAAGGTT...CAGCTTGCCTTGGATACCCGATTCTGGACG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3067 TGGATAAATCACTTTGTGATTTGGGGTTCTTTAGCCTTCTATGTATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185759 TGGATAAATCACTTTGTGATTTGGGGTTCTTTAGCCTTCTATGTATTTTT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3117 CTCATTCTTCTGGGGAGGAATTATTTG         GCCTTTTCTCAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 185809 CTCATTCTTCTGGGGAGGAATTATTTGGTA...CAGGCCTTTTCTCAAGC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3158 AACAGAGAATGTATTTTGTATTTGCCCAAATGCTGTCTTCTGTATCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188771 AACAGAGAATGTATTTTGTATTTGCCCAAATGCTGTCTTCTGTATCCACA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3208 TGGTTGGCTATAATTCTTCTAATATTTATCAGCCTGTTCCCTGAGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188821 TGGTTGGCTATAATTCTTCTAATATTTATCAGCCTGTTCCCTGAGATTCT

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3258 TCTGATAGTATTAAAGAATGTAAGAAGAAGAAGTGCCAGG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 188871 TCTGATAGTATTAAAGAATGTAAGAAGAAGAAGTGCCAGGGTA...CAGA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3299 GAAATCTGAGCTGTAGAAGGGCATCTGACTCATTATCCGCCAGACCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195072 GAAATCTGAGCTGTAGAAGGGCATCTGACTCATTATCCGCCAGACCTTCA

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3349 GTCAGACCTCTTCTTTTACGAACATTCTCAGACGAATCTAATGTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195122 GTCAGACCTCTTCTTTTACGAACATTCTCAGACGAATCTAATGTATTG