seq1 = pF1KE6792.tfa, 2370 bp
seq2 = pF1KE6792/gi568815597r_119793975.tfa (gi568815597r:119793975_119996336), 202362 bp

>pF1KE6792 2370
>gi568815597r:119793975_119996336 (Chr1)

(complement)

1-2370  (100001-102370)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGTCAGTGCAGATCTTCCTCTCCCAATGCCGTTTGCTCCTTCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGTCAGTGCAGATCTTCCTCTCCCAATGCCGTTTGCTCCTTCTACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTTCCGACAATGCTCCTTAAGTCTCTTGGCGAAGATGTAATTTTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTTCCGACAATGCTCCTTAAGTCTCTTGGCGAAGATGTAATTTTTCACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGAAGGGGAGTTTGACTCGTATGAAGTCACCATTCCTGAGAAGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGAAGGGGAGTTTGACTCGTATGAAGTCACCATTCCTGAGAAGCTGAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCCGGGGAGAGGTGCAGGGTGTGGTCAGTCCCGTGTCCTACCTACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCCGGGGAGAGGTGCAGGGTGTGGTCAGTCCCGTGTCCTACCTACTGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTTAAAAGGCAAGAAGCACGTCCTCCATTTGTGGCCCAAGAGACTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTTAAAAGGCAAGAAGCACGTCCTCCATTTGTGGCCCAAGAGACTTCTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCCCCGACATCTGCGCGTTTTCTCCTTCACAGAACATGGGGAACTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCCCCGACATCTGCGCGTTTTCTCCTTCACAGAACATGGGGAACTGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGATCATCCTTACATACCAAAGGACTGCAACTACATGGGCTCCGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGATCATCCTTACATACCAAAGGACTGCAACTACATGGGCTCCGTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAGTCTCTGGACTCTAAAGCTACTATAAGCACATGCATGGGGGGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGAGTCTCTGGACTCTAAAGCTACTATAAGCACATGCATGGGGGGTCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAGGTGTATTTAACATTGATGCCAAACATTACCAAATTGAGCCCCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GAGGTGTATTTAACATTGATGCCAAACATTACCAAATTGAGCCCCTCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCTCTCCCAGTTTTGAACATGTCGTCTATCTCCTGAAGAAAGAGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCTCTCCCAGTTTTGAACATGTCGTCTATCTCCTGAAGAAAGAGCAGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGGAATCAGGTTTGTGGCTTAAGTGATGATGAAATAGAATGGCAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGGAATCAGGTTTGTGGCTTAAGTGATGATGAAATAGAATGGCAGATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCCTTATGAGAATAAGGCGAGGCTAAGGGACTTTCCTGGATCCTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCCTTATGAGAATAAGGCGAGGCTAAGGGACTTTCCTGGATCCTATAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CACCCAAAGTACTTGGAATTGATCCTACTCTTTGATCAAAGTAGGTATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CACCCAAAGTACTTGGAATTGATCCTACTCTTTGATCAAAGTAGGTATAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTTTGTGAACAACAATCTTTCTCAAGTCATACATGATGCCATTCTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTTTGTGAACAACAATCTTTCTCAAGTCATACATGATGCCATTCTTTTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGGGATTATGGACACCTACTTTCAAGATGTTCGTATGAGGATACACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTGGGATTATGGACACCTACTTTCAAGATGTTCGTATGAGGATACACTTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGGCTCTTGAAGTATGGACAGATTTTAACAAAATACGCGTTGGATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGGCTCTTGAAGTATGGACAGATTTTAACAAAATACGCGTTGGATATCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGAGTTAGCTGAAGTTTTAGGCAGATTTGTAATATATAAAAAAAGTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGAGTTAGCTGAAGTTTTAGGCAGATTTGTAATATATAAAAAAAGTGTAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TAAATGCTCGCCTGTCATCAGATTGGGCACATTTATATCTTCAAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TAAATGCTCGCCTGTCATCAGATTGGGCACATTTATATCTTCAAAGAAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TATAATGATGCTCTTGCATGGTCGTTTGGAAAAGTGTGTTCTCTAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TATAATGATGCTCTTGCATGGTCGTTTGGAAAAGTGTGTTCTCTAGAATA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGCTGGATCAGTGAGTACTTTACTAGATACAAATATCCTTGCCCCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGCTGGATCAGTGAGTACTTTACTAGATACAAATATCCTTGCCCCTGCTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCTGGTCTGCTCATGAGCTGGGTCATGCTGTAGGAATGTCACATGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCTGGTCTGCTCATGAGCTGGGTCATGCTGTAGGAATGTCACATGATGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAATACTGCCAATGTAGGGGTAGGCTTAATTGCATCATGGGCTCAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAATACTGCCAATGTAGGGGTAGGCTTAATTGCATCATGGGCTCAGGACG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CACTGGGTTTAGCAATTGCAGTTATATCTCTTTTTTTAAACATATCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CACTGGGTTTAGCAATTGCAGTTATATCTCTTTTTTTAAACATATCTCTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CGGGAGCAACATGTCTAAATAATATCCCAGGACTAGGTTATGTGCTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CGGGAGCAACATGTCTAAATAATATCCCAGGACTAGGTTATGTGCTTAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AGATGTGGAAACAAAATTGTGGAGGACAATGAGGAATGTGACTGTGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AGATGTGGAAACAAAATTGTGGAGGACAATGAGGAATGTGACTGTGGTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CACAGAGGAGTGTCAGAAAGATCGGTGTTGCCAATCAAATTGTAAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CACAGAGGAGTGTCAGAAAGATCGGTGTTGCCAATCAAATTGTAAGTTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AACCAGGTGCCAACTGTAGCATTGGACTTTGCTGTCATGATTGTCGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AACCAGGTGCCAACTGTAGCATTGGACTTTGCTGTCATGATTGTCGGTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CGTCCATCTGGATACGTGTGTAGGCAGGAAGGAAATGAATGTGACCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CGTCCATCTGGATACGTGTGTAGGCAGGAAGGAAATGAATGTGACCTTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AGAGTACTGCGACGGGAATTCAAGTTCCTGCCCAAATGACGTTTATAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AGAGTACTGCGACGGGAATTCAAGTTCCTGCCCAAATGACGTTTATAAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGGATGGAACCCCTTGCAAGTATGAAGGCCGTTGTTTCAGGAAGGGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AGGATGGAACCCCTTGCAAGTATGAAGGCCGTTGTTTCAGGAAGGGGTGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AGATCCAGATATATGCAGTGCCAAAGCATTTTTGGACCTGATGCCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AGATCCAGATATATGCAGTGCCAAAGCATTTTTGGACCTGATGCCATGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GGCTCCTAGTGAGTGCTATGATGCAGTTAACTTAATAGGTGATCAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GGCTCCTAGTGAGTGCTATGATGCAGTTAACTTAATAGGTGATCAATTTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GTAACTGTGAGATTACAGGAATTCGAAATTTTAAAAAGTGTGAAAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 GTAACTGTGAGATTACAGGAATTCGAAATTTTAAAAAGTGTGAAAGTGCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 AATTCGATATGTGGCAGGCTACAGTGTATAAATGTTGAAACCATCCCTGA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 AATTCAATATGTGGCAGGCTACAGTGTATAAATGTTGAAACCATCCCTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 TTTGCCAGAGCATACGACTATAATTTCTACTCATTTACAGGCAGAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 TTTGCCAGAGCATACGACTATAATTTCTACTCATTTACAGGCAGAAAATC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 TCATGTGCTGGGGCACAGGCTATCATCTATCCATGAAACCCATGGGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 TCATGTGCTGGGGCACAGGCTATCATCTATCCATGAAACCCATGGGAATA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CCTGACCTAGGTATGATAAATGATGGCACCTCCTGTGGAGAAGGCCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 CCTGACCTAGGTATGATAAATGATGGCACCTCCTGTGGAGAAGGCCGGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 ATGTTTTAAAAAAAATTGCGTCAATAGCTCAGTCCTGCAGTTTGACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 ATGTTTTAAAAAAAATTGCGTCAATAGCTCAGTCCTGCAGTTTGACTGTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 TGCCTGAGAAATGCAATACCCGGGGTGTTTGCAACAACAGAAAAAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 TGCCTGAGAAATGCAATACCCGGGGTGTTTGCAACAACAGAAAAAACTGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 CACTGCATGTATGGGTGGGCACCTCCATTCTGTGAGGAAGTGGGGTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 CACTGCATGTATGGGTGGGCACCTCCATTCTGTGAGGAAGTGGGGTATGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 AGGAAGCATTGACAGTGGGCCTCCAGGACTGCTCAGAGGGGCGATTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 AGGAAGCATTGACAGTGGGCCTCCAGGACTGCTCAGAGGGGCGATTCCCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 CGTCAATTTGGGTTGTGTCCATCATAATGTTTCGCCTTATTTTATTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 CGTCAATTTGGGTTGTGTCCATCATAATGTTTCGCCTTATTTTATTAATC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 CTTTCAGTGGTTTTTGTGTTTTTCCGGCAAGTGATAGGAAACCACTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 CTTTCAGTGGTTTTTGTGTTTTTCCGGCAAGTGATAGGAAACCACTTAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 ACCCAAACAGGAAAAAATGCCACTATCCAAAGCAAAAACTGAACAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 ACCCAAACAGGAAAAAATGCCACTATCCAAAGCAAAAACTGAACAGGAAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 AATCTAAAACAAAAACTGTACAGGAAGAATCTAAAACAAAAACTGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 AATCTAAAACAAAAACTGTACAGGAAGAATCTAAAACAAAAACTGGACAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 GAAGAATCTGAAGCAAAAACTGGACAGGAAGAATCTAAAGCAAAAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 GAAGAATCTGAAGCAAAAACTGGACAGGAAGAATCTAAAGCAAAAACTGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 ACAGGAAGAATCTAAAGCAAACATTGAAAGTAAACGACCCAAAGCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 ACAGGAAGAATCTAAAGCAAACATTGAAAGTAAACGACCCAAAGCAAAGA

   2350     .    :    .    :
   2351 GTGTCAAGAAACAAAAAAAG
        ||||||||||||||||||||
 102351 GTGTCAAGAAACAAAAAAAG