seq1 = pF1KE6786.tfa, 1887 bp
seq2 = pF1KE6786/gi568815584f_54467920.tfa (gi568815584f:54467920_54884620), 416701 bp

>pF1KE6786 1887
>gi568815584f:54467920_54884620 (Chr14)

1-193  (100001-100193)   100% ->
194-712  (234143-234661)   99% ->
713-822  (280896-281005)   100% ->
823-909  (283532-283618)   100% ->
910-1243  (292242-292575)   100% ->
1244-1329  (296536-296621)   100% ->
1330-1448  (302185-302303)   100% ->
1449-1650  (307015-307216)   100% ->
1651-1777  (308495-308621)   100% ->
1778-1861  (316618-316701)   100% ->
1862-1887  (320997-321022)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGTGCGAGCAGACTGTTGCGCTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGTGCGAGCAGACTGTTGCGCTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGGCCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100151 TGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGTA...C

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    194   GAATCATTAACCAATGGCAACAGGAATCCAAGGATAAAGTGATTTCCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234141 AGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAATCCAAGGATAAAGTGATTTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGTTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 234191 TCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGCTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTAGAATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234241 GTAGAATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGCAGCTGCTGTCCTATGCTTTGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234291 CAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGCAGCTGCTGTCCTATGCTTTGATAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234341 ATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CACTTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234391 CACTTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CTCAGACTCTGTGGATTATGGACAGACACACTACTATCACCAAAGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234441 CTCAGACTCTGTGGATTATGGACAGACACACTACTATCACCAAAGACAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234491 ACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TGCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234541 TGCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCATGTGCCCCTCTACTCCTCCTCATCTGTCCCCACCACAATCAATACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234591 CCATGTGCCCCTCTACTCCTCCTCATCTGTCCCCACCACAATCAATACGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTGGAACCAGCACAAGTACAA         ATGTTCCAGCCTGGCTGAAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 234641 TTGGAACCAGCACAAGTACAAGTA...CAGATGTTCCAGCCTGGCTGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AGCCTCCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGATGACCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280916 AGCCTCCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGATGACCTATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGCTGGAGGCGCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 280966 GGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGCTGGAGGCGCAGGTA...CAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ATGTTACCAAAGGTGCAAGACACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283533 ATGTTACCAAAGGTGCAAGACACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AAAGAAAGACAAAATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGG         GACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 283583 AAAGAAAGACAAAATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGTA...CAGGACAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CATCGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292247 CATCGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCAGATGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCCCGAGCACCACCCCCGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292297 TCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCCCGAGCACCACCCCCGAGGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CGCCGCCGGGAGCCCCAGGCCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292347 CGCCGCCGGGAGCCCCAGGCCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GAGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGCGCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292397 GAGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGCGCCACGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292447 CCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 AGCTGCGATGGGGAGCTGGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292497 AGCTGCGATGGGGAGCTGGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAG         TGTGCACACAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 292547 CGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGGTA...CAGTGTGCACACAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGTTCCTATTTACAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296548 TCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGTTCCTATTTACAGCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 ATAGACAAGTGTCTAATTCATGAG         GCATTTACAGAGACACA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 296598 ATAGACAAGTGTCTAATTCATGAGGTG...CAGGCATTTACAGAGACACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GAAAAAAAGATTGTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 302202 GAAAAAAAGATTGTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 CTTTCCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGACAGCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 302252 CTTTCCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGACAGCAAAGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 AA         TCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCCCGACGGCTGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 302302 AAGTA...CAGTCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCCCGACGGCTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 307054 CTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 CCTCTCGGAACGTCCCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 307104 CCTCTCGGAACGTCCCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 TTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCCCACCATCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 307154 TTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCCCACCATCATGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 ACAAGGAAGACAG         AACCTGTGGTTTGCCAACCCCGGGGGCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 307204 ACAAGGAAGACAGGTT...CAGAACCTGTGGTTTGCCAACCCCGGGGGCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 GCAATAGCATGCCAAGCCGCACCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 308523 GCAATAGCATGCCAAGCCGCACCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 CTGCCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAGCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 308573 CTGCCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAGCCAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1778         AATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACAGGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 308623 TA...CAGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACAGGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 TGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGAACACGCCCTGGGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 316660 TGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGAACACGCCCTGGGAGGTG...CA

   1950     .    :    .    :    .
   1862  ACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC
        >||||||||||||||||||||||||||
 320996 GACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC