seq1 = pF1KE6765.tfa, 3057 bp
seq2 = pF1KE6765/gi568815596r_74122867.tfa (gi568815596r:74122867_74415023), 292157 bp

>pF1KE6765 3057
>gi568815596r:74122867_74415023 (Chr2)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-209  (129122-129251)   100% ->
210-370  (149760-149920)   100% ->
371-523  (150725-150877)   100% ->
524-619  (152792-152887)   100% ->
620-675  (155381-155436)   100% ->
676-833  (159092-159249)   100% ->
834-921  (160318-160405)   100% ->
922-1076  (161896-162050)   100% ->
1077-1286  (162636-162845)   100% ->
1287-1461  (164507-164681)   100% ->
1462-1595  (166538-166671)   100% ->
1596-1867  (167717-167988)   100% ->
1868-1926  (172972-173030)   100% ->
1927-2127  (175489-175689)   100% ->
2128-2289  (181461-181622)   100% ->
2290-2468  (182377-182555)   100% ->
2469-2541  (183716-183788)   100% ->
2542-2610  (187146-187214)   100% ->
2611-2784  (187894-188067)   100% ->
2785-2940  (190029-190184)   100% ->
2941-3025  (192072-192156)   100% ->
3026-3057  (193523-193554)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGTGAAGGAGGAGAAGGCTGGGGTAGGAAAGCTGGACCACACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGTGAAGGAGGAGAAGGCTGGGGTAGGAAAGCTGGACCACACTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACAGGAGGAGATTTCCGGATCAGAAAG         GGTCCCCAGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 CCACAGGAGGAGATTTCCGGATCAGAAAGGTG...CAGGGTCCCCAGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGAGCAGCTCCAGGACATCCTGGGGGAGGAAGATGAGGCTCCCAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129134 CTGAGCAGCTCCAGGACATCCTGGGGGAGGAAGATGAGGCTCCCAACCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCCTCTTTACAGAGATGGATACTCTGCAGCATGACGGAGACCAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129184 ACCCTCTTTACAGAGATGGATACTCTGCAGCATGACGGAGACCAGATGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTGGAAGGAGTCAGCCAG         GTGGATAAAGTTTGAAGAAAAGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 129234 GTGGAAGGAGTCAGCCAGGTG...CAGGTGGATAAAGTTTGAAGAAAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TAGAGGAAGGCGGCGAACGCTGGAGCAAGCCCCACGTGTCCACACTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149783 TAGAGGAAGGCGGCGAACGCTGGAGCAAGCCCCACGTGTCCACACTATCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGCACAGCCTCTTCGAGCTCCGTACCTGCCTGCAGACGGGGACGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149833 CTGCACAGCCTCTTCGAGCTCCGTACCTGCCTGCAGACGGGGACGGTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTGGATTTGGACAGTGGCTCCTTACCACAGATCATAG         ATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 149883 GCTGGATTTGGACAGTGGCTCCTTACCACAGATCATAGGTG...CAGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGTCATTGAGAAGCAGATTGAGGATGGTCTCCTGCGGCCAGAGCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150728 ATGTCATTGAGAAGCAGATTGAGGATGGTCTCCTGCGGCCAGAGCTCCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGAGGGTCAGTTACGTCCTCCTGAGGAGGCACCGCCACCAAACCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150778 GAGAGGGTCAGTTACGTCCTCCTGAGGAGGCACCGCCACCAAACCAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCCCATCCACCGCTCCTTAGCTGACATTGGGAAGTCAGTCTCCACCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150828 GCCCATCCACCGCTCCTTAGCTGACATTGGGAAGTCAGTCTCCACCACAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524          ATCGCAGTCCTGCCCGGAGCCCTGGTGCTGGCCCGAGTCTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150878 GTG...CAGATCGCAGTCCTGCCCGGAGCCCTGGTGCTGGCCCGAGTCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CACCACTCCACGGAAGACCTGCGGATGCGGCAGAGTGCAAATTACGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152833 CACCACTCCACGGAAGACCTGCGGATGCGGCAGAGTGCAAATTACGGACG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCTGT         GTCATGCCCAGAGCAGAAGCATGAATGACATTTCTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152883 TCTGTGTG...TAGGTCATGCCCAGAGCAGAAGCATGAATGACATTTCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCACCCCAAACACAGACCAG         CGGAAAAACAAATTCATGAAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 155417 TCACCCCAAACACAGACCAGGTA...CAGCGGAAAAACAAATTCATGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAGATCCCCAAGGACTCAGAAGCGTCCAACGTGCTCGTGGGCGAGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159113 AAGATCCCCAAGGACTCAGAAGCGTCCAACGTGCTCGTGGGCGAGGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTTCCTAGACCAGCCATTCATCGCGTTCGTGCGCCTCATCCAGTCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159163 CTTCCTAGACCAGCCATTCATCGCGTTCGTGCGCCTCATCCAGTCGGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGCTGGGAGGAGTGACCGAGGTGCCTGTCCCCACCAG         ATTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 159213 TGCTGGGAGGAGTGACCGAGGTGCCTGTCCCCACCAGGTG...CAGATTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTGTTTATACTACTGGGACCTTCTGGGAGAGCAAAATCCTACAATGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160322 CTGTTTATACTACTGGGACCTTCTGGGAGAGCAAAATCCTACAATGAAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGGCCGTGCCATTGCAACCCTCATGGTAGATGAT         CTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 160372 TGGCCGTGCCATTGCAACCCTCATGGTAGATGATGTA...CAGCTCTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GTGACGTGGCCTACAAAGCCCGCAATCGGGAAGATCTGATCGCAGGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161903 GTGACGTGGCCTACAAAGCCCGCAATCGGGAAGATCTGATCGCAGGAATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GATGAATTTCTGGATGAGGTCATCGTCCTTCCTCCTGGAGAATGGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161953 GATGAATTTCTGGATGAGGTCATCGTCCTTCCTCCTGGAGAATGGGACCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AAATATCCGGATTGAGCCCCCCAAGAAGGTGCCCTCTGCTGACAAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 162003 AAATATCCGGATTGAGCCCCCCAAGAAGGTGCCCTCTGCTGACAAGAGGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1077        GAAATCTGTGTTCTCCCTAGCAGAGCTGGGCCAGATGAATGGC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162053 G...CAGGAAATCTGTGTTCTCCCTAGCAGAGCTGGGCCAGATGAATGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TCTGTGGGAGGAGGCGGCGGAGCTCCTGGAGGAGGCAATGGAGGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162679 TCTGTGGGAGGAGGCGGCGGAGCTCCTGGAGGAGGCAATGGAGGTGGTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGGTGGTGGCAGTGGCGGCGGGGCTGGCAGTGGCGGGGCCGGCGGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162729 TGGTGGTGGCAGTGGCGGCGGGGCTGGCAGTGGCGGGGCCGGCGGAACAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCAGCGGGGATGATGGAGAGATGCCAGCCATGCATGAAATCGGGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162779 GCAGCGGGGATGATGGAGAGATGCCAGCCATGCATGAAATCGGGGAGGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CTTATCTGGACAGGAAG         GTTCTTCGGTGGCCTGTGTCTGGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 162829 CTTATCTGGACAGGAAGGTG...CAGGTTCTTCGGTGGCCTGTGTCTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TATCAAGAGGAAGTTGCCCTGGTTCCCAAGTGACTTCTATGATGGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164531 TATCAAGAGGAAGTTGCCCTGGTTCCCAAGTGACTTCTATGATGGCTTCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ACATTCAGTCCATCTCTGCCATCCTATTCATCTACCTCGGCTGTATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164581 ACATTCAGTCCATCTCTGCCATCCTATTCATCTACCTCGGCTGTATCACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AACGCGATCACCTTTGGTGGGCTTCTGGGGGATGCCACCGACAATTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164631 AACGCGATCACCTTTGGTGGGCTTCTGGGGGATGCCACCGACAATTATCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 G         GGAGTGATGGAGAGCTTCCTGGGCACTGCCATGGCTGGCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164681 GGTG...CAGGGAGTGATGGAGAGCTTCCTGGGCACTGCCATGGCTGGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CCTTGTTCTGCCTCTTCTCGGGACAGCCTCTCATCATTCTCAGCAGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166578 CCTTGTTCTGCCTCTTCTCGGGACAGCCTCTCATCATTCTCAGCAGCACG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GGGCCCATCCTCATCTTTGAGAAGCTCCTCTTCGACTTCAGCAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 166628 GGGCCCATCCTCATCTTTGAGAAGCTCCTCTTCGACTTCAGCAAGTA...

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1596    AGGCAATGGCCTGGACTACATGGAGTTCCGCCTCTGGATTGGCCTAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167714 CAGAGGCAATGGCCTGGACTACATGGAGTTCCGCCTCTGGATTGGCCTAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 ACTCAGCTGTCCAGTGCCTTATCCTAGTGGCCACAGATGCCAGCTTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167764 ACTCAGCTGTCCAGTGCCTTATCCTAGTGGCCACAGATGCCAGCTTTATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 ATCAAATATATCACCCGCTTCACCGAGGAGGGCTTCTCCACCCTTATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167814 ATCAAATATATCACCCGCTTCACCGAGGAGGGCTTCTCCACCCTTATCAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CTTCATCTTCATCTACGATGCCATCAAGAAGATGATCGGTGCCTTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167864 CTTCATCTTCATCTACGATGCCATCAAGAAGATGATCGGTGCCTTCAAGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 ACTACCCTATCAATATGGACTTCAAGCCAAACTTCATCACTACCTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167914 ACTACCCTATCAATATGGACTTCAAGCCAAACTTCATCACTACCTACAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TGCGAGTGTGTCGCCCCTGACACAG         TGAATACAACCGTGTT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 167964 TGCGAGTGTGTCGCCCCTGACACAGGTG...CAGTGAATACAACCGTGTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CAATGCTTCAGCCCCATTGGCACCAGACACCAACGCTTCTCTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 172988 CAATGCTTCAGCCCCATTGGCACCAGACACCAACGCTTCTCTGGTA...A

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1927   TACAACCTCCTTAACCTCACAGCGTTGGACTGGTCCCTGCTGAGCAAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175487 AGTACAACCTCCTTAACCTCACAGCGTTGGACTGGTCCCTGCTGAGCAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 AAGGAGTGTCTGAGCTACGGCGGGCGCCTGCTTGGGAATTCCTGCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175537 AAGGAGTGTCTGAGCTACGGCGGGCGCCTGCTTGGGAATTCCTGCAAGTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TATCCCAGACCTGGCGCTCATGTCCTTCATCCTTTTCTTTGGGACATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175587 TATCCCAGACCTGGCGCTCATGTCCTTCATCCTTTTCTTTGGGACATACT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 CCATGACCCTGACCCTGAAGAAGTTCAAATTCAGCCGCTATTTTCCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175637 CCATGACCCTGACCCTGAAGAAGTTCAAATTCAGCCGCTATTTTCCTACC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 AAG         CCAACGCGGCCTGACCGAGGCTGGTTCGTGGCCCCCTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175687 AAGGTA...CAGCCAACGCGGCCTGACCGAGGCTGGTTCGTGGCCCCCTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 TGGGAAGAACCCGTGGTGGGTATACCCAGCAAGCATCCTGCCCGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181499 TGGGAAGAACCCGTGGTGGGTATACCCAGCAAGCATCCTGCCCGCCCTGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TGGTGACCATCCTGATCTTCATGGACCAGCAGATCACTGCCGTCATTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181549 TGGTGACCATCCTGATCTTCATGGACCAGCAGATCACTGCCGTCATTGTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 AACCGGAAGGAGAACAAACTGAAG         AAGGCTGCCGGCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 181599 AACCGGAAGGAGAACAAACTGAAGGTA...CAGAAGGCTGCCGGCTACCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 TCTGGACCTGTTCTGGGTGGGCATCCTCATGGCTTTGTGCTCCTTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182394 TCTGGACCTGTTCTGGGTGGGCATCCTCATGGCTTTGTGCTCCTTTATGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 GGCTCCCCTGGTACGTGGCTGCCACGGTCATCTCCATCGCCCACATCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182444 GGCTCCCCTGGTACGTGGCTGCCACGGTCATCTCCATCGCCCACATCGAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 AGCCTCAAGATGGAGACAGAGACCAGTGCCCCTGGGGAGCAGCCCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182494 AGCCTCAAGATGGAGACAGAGACCAGTGCCCCTGGGGAGCAGCCCCAGTT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 TCTGGGAGTCAG         GGAACAGAGAGTAACCGGCATCATCGTCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 182544 TCTGGGAGTCAGGTA...CAGGGAACAGAGAGTAACCGGCATCATCGTCT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 TCATCCTGACGGGAATCTCTGTCTTCCTGGCTCCCATCCTAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 183745 TCATCCTGACGGGAATCTCTGTCTTCCTGGCTCCCATCCTAAAGGTG...

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2542    TGTATCCCCCTGCCGGTGCTGTACGGAGTCTTCCTCTACATGGGCGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187143 TAGTGTATCCCCCTGCCGGTGCTGTACGGAGTCTTCCTCTACATGGGCGT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 GGCCTCCCTGAATGGCATCCAG         TTCTGGGAACGCTGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 187193 GGCCTCCCTGAATGGCATCCAGGTA...TAGTTCTGGGAACGCTGCAAGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 TCTTCCTGATGCCAGCCAAGCACCAGCCGGACCATGCCTTCCTGCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187913 TCTTCCTGATGCCAGCCAAGCACCAGCCGGACCATGCCTTCCTGCGGCAC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 GTGCCGCTGCGCCGGATCCACCTCTTCACCCTGGTGCAGATCCTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187963 GTGCCGCTGCGCCGGATCCACCTCTTCACCCTGGTGCAGATCCTCTGCCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 GGCGGTGCTCTGGATCCTCAAATCCACGGTGGCTGCCATCATCTTCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188013 GGCGGTGCTCTGGATCCTCAAATCCACGGTGGCTGCCATCATCTTCCCGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 TCATG         ATCCTGGGCCTCATCATCGTTCGAAGGCTTCTGGAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188063 TCATGGTA...CAGATCCTGGGCCTCATCATCGTTCGAAGGCTTCTGGAT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2821 TTCATCTTTTCCCAGCACGACCTGGCCTGGATTGACAACATCCTCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190065 TTCATCTTTTCCCAGCACGACCTGGCCTGGATTGACAACATCCTCCCAGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 GAAGGAAAAAAAGGAGACAGACAAGAAGAGGAAGAGAAAAAAAGGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190115 GAAGGAAAAAAAGGAGACAGACAAGAAGAGGAAGAGAAAAAAAGGGGCCC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 ACGAGGACTGTGATGAGGAG         CCCCAGTTCCCTCCTCCCTCG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 190165 ACGAGGACTGTGATGAGGAGGTG...CAGCCCCAGTTCCCTCCTCCCTCG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2962 GTTATAAAGATTCCCATGGAAAGTGTCCAATCAGATCCCCAAAACGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192093 GTTATAAAGATTCCCATGGAAAGTGTCCAATCAGATCCCCAAAACGGTAT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3012 CCACTGCATTGCCA         GAAAAAGATCTTCCAGTTGGAGTTACT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 192143 CCACTGCATTGCCAGTA...CAGGAAAAAGATCTTCCAGTTGGAGTTACT

   3250     .
   3053 CACTC
        |||||
 193550 CACTC