seq1 = pF1KE6760.tfa, 1596 bp
seq2 = pF1KE6760/gi568815575f_57186826.tfa (gi568815575f:57186826_57588929), 402104 bp

>pF1KE6760 1596
>gi568815575f:57186826_57588929 (ChrX)

1-192  (100001-100192)   100% ->
193-275  (105673-105755)   100% ->
276-412  (123768-123904)   100% ->
413-622  (144773-144982)   100% ->
623-742  (154446-154565)   100% ->
743-878  (191826-191961)   99% ->
879-996  (194087-194204)   100% ->
997-1116  (245093-245212)   100% ->
1117-1228  (260103-260214)   100% ->
1229-1423  (261699-261893)   99% ->
1424-1596  (301932-302104)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACCTTCATTTACCGCCCGCATTCAGTTGTTCCTCTTGCGGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCACCTTCATTTACCGCCCGCATTCAGTTGTTCCTCTTGCGGGCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGCTTTCTCATAGGCTTAGTAGGCCGAGCAGCTTTAGTCTTAGGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGCTTTCTCATAGGCTTAGTAGGCCGAGCAGCTTTAGTCTTAGGGGGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAAAGTTTGCCTCAAAGACCCCTCGGCCGGTGACTGAACCATTGCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAAAGTTTGCCTCAAAGACCCCTCGGCCGGTGACTGAACCATTGCTTCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTTTCGGGGATGCAGCTGGCCAAGCTGATCCGACAGAGAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100151 CTTTCGGGGATGCAGCTGGCCAAGCTGATCCGACAGAGAAAGGTG...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    193  GTGAAATGTATAGATGTTGTTCAGGCTTATATCAACAGAATCAAGGACG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105672 GGTGAAATGTATAGATGTTGTTCAGGCTTATATCAACAGAATCAAGGACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAACCCAATGATCAATGGAATTGTCAAGTACAG         GTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 105722 TGAACCCAATGATCAATGGAATTGTCAAGTACAGGTG...TAGGTTTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAGCGATGAAGGAGGCTCATGCTGTAGATCAAAAGCTTGCAGAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123775 GAAGCGATGAAGGAGGCTCATGCTGTAGATCAAAAGCTTGCAGAGAAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAAGATGAAGCCACCCTGGAAAATAAATGGCCCTTCCTTGGGGTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123825 GGAAGATGAAGCCACCCTGGAAAATAAATGGCCCTTCCTTGGGGTTCCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGACAGTCAAGGAAGCTTTCCAGCTACAAG         GAATGCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 123875 TGACAGTCAAGGAAGCTTTCCAGCTACAAGGTA...TAGGAATGCCCAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCTTCTGGACTCATGAACCGTCGTGATGCCATTGCCAAAACAGATGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144784 TCTTCTGGACTCATGAACCGTCGTGATGCCATTGCCAAAACAGATGCCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGTGGTGGCATTACTGAAGGGAGCTGGTGCCATTCCTCTTGGCATAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144834 TGTGGTGGCATTACTGAAGGGAGCTGGTGCCATTCCTCTTGGCATAACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACTGTAGTGAGTTGTGTATGTGGTATGAATCCAGTAACAAGATCTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144884 ACTGTAGTGAGTTGTGTATGTGGTATGAATCCAGTAACAAGATCTATGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGATCAAACAACCCATATGATTTACAGCATATTGTAGGTGGAAGTTCTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 144934 CGATCAAACAACCCATATGATTTACAGCATATTGTAGGTGGAAGTTCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    623         GTGGTGAGGGCTGCACACTGGCAGCTGCCTGCTCAGTTATTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144984 TG...TAGGTGGTGAGGGCTGCACACTGGCAGCTGCCTGCTCAGTTATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTGTGGGCTCTGATATTGGTGGTAGCATTCGAATGCCTGCTTTCTTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154488 GTGTGGGCTCTGATATTGGTGGTAGCATTCGAATGCCTGCTTTCTTCAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGTATATTTGGACACAAGCCTTCTCCAG         GTGTGGTTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 154538 GGTATATTTGGACACAAGCCTTCTCCAGGTA...CAGGTGTGGTTCCCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAAAGGTCAGTTTCCCTTGGCTGTGGGAGCCCAGGAGTTGTTTCTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191839 CAAAGGTCAGTTTCCCTTGGCTGTGGGAGCCCAGGAGTTGTTTCTGTGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CTGGTCCTATGTGCCGCTATGCTGAAGACCTGGCCCCCATGTTGAAGGTC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 191889 CTGGTCCTATGTGCCGTTATGCTGAAGACCTGGCCCCCATGTTGAAGGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ATGGCAGGACCTGGGATCAAAAG         GTTAAAACTAGACACAAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 191939 ATGGCAGGACCTGGGATCAAAAGGTA...CAGGTTAAAACTAGACACAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGTACATTTAAAAGACTTAAAATTTTACTGGATGGAACATGATGGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194105 GGTACATTTAAAAGACTTAAAATTTTACTGGATGGAACATGATGGAGGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CATTTTTAATGTCCAAAGTGGACCAAGATCTCATTATGACTCAGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194155 CATTTTTAATGTCCAAAGTGGACCAAGATCTCATTATGACTCAGAAAAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997          GTTGTGGTTCACCTTGAAACTATTCTAGGAGCCTCAGTTCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194205 GTA...AAGGTTGTGGTTCACCTTGAAACTATTCTAGGAGCCTCAGTTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ACATGTTAAACTGAAGAAAATGAAGTACTCTTTTCAGTTGTGGATCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245134 ACATGTTAAACTGAAGAAAATGAAGTACTCTTTTCAGTTGTGGATCGCAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGATGTCAGCAAAGGGACATGATGGGAAG         GAACCTGTGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 245184 TGATGTCAGCAAAGGGACATGATGGGAAGGTA...CAGGAACCTGTGAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TTTGTAGATTTGCTTGGTGACCATGGGAAACATGTCAGTCCTCTGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260115 TTTGTAGATTTGCTTGGTGACCATGGGAAACATGTCAGTCCTCTGTGGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GTTGATCAAATGGTGCCTGGGTCTGTCAGTGTACACCATCCCTTCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260165 GTTGATCAAATGGTGCCTGGGTCTGTCAGTGTACACCATCCCTTCCATTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229          GACTGGCTTTGTTGGAAGAAAAGCTCAGATATAGCAATGAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260215 GTA...TAGGACTGGCTTTGTTGGAAGAAAAGCTCAGATATAGCAATGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AAATACCAAAAGTTTAAGGCAGTGGAAGAAAGCCTGCGTAAAGAGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261740 AAATACCAAAAGTTTAAGGCAGTGGAAGAAAGCCTGCGTAAAGAGCTGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GGATATGCTAGGTGATGATGGTGTGTTCTTATATCCCTCACATCCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261790 GGATATGCTAGGTGATGATGGTGTGTTCTTATATCCCTCACATCCCACAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TGGCACCTAAGCATCATGTCCCTCTAACACGGCCCTTCAACTTTGCTTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 261840 TGGCACCTAAGCATCATGTCCCTCTAACACGGCCTTTCAACTTTGCTTAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 ACAG         GTGTCTTCAGTGCCCTGGGTTTGCCTGTGACCCAATG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261890 ACAGGTA...CAGGTGTCTTCAGTGCCCTGGGTTTGCCTGTGACCCAATG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CCCACTGGGACTGAATGCCAAAGGACTCCCTTTAGGCATCCAGGTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301969 CCCACTGGGACTGAATGCCAAAGGACTCCCTTTAGGCATCCAGGTTGTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CTGGACCCTTTAATGATCATCTGACCCTGGCTGTGGCCCAGTACTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 302019 CTGGACCCTTTAATGATCATCTGACCCTGGCTGTGGCCCAGTACTTGGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .
   1561 AAAACTTTTGGGGGCTGGGTCTGTCCAGGAAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 302069 AAAACTTTTGGGGGCTGGGTCTGTCCAGGAAAGTTT