seq1 = pF1KE6759.tfa, 1629 bp
seq2 = pF1KE6759/gi568815596r_37970725.tfa (gi568815596r:37970725_38175388), 204664 bp

>pF1KE6759 1629
>gi568815596r:37970725_38175388 (Chr2)

(complement)

1-1043  (100001-101043)   99% ->
1044-1629  (104079-104664)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGACCAGCCTCAGCCCGAACGACCCTTGGCCGCTAAACCCGCTGTC
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCACCAGCCTCAGCCCGAACGACCCTTGGCCGCTAAACCCGCTGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCCAGCAGACCACGCTCCTGCTACTCCTGTCGGTGCTGGCCACTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCCAGCAGACCACGCTCCTGCTACTCCTGTCGGTGCTGGCCACTGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGTGGGCCAGCGGCTGCTGAGGCAACGGAGGCGGCAGCTCCGGTCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGTGGGCCAGCGGCTGCTGAGGCAACGGAGGCGGCAGCTCCGGTCCGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCCCGGGCCCGTTTGCGTGGCCACTGATCGGAAACGCGGCGGCGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCCCGGGCCCGTTTGCGTGGCCACTGATCGGAAACGCGGCGGCGGTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGGCGGCTCACCTCTCGTTCGCTCGCCTGGCGCGGCGCTACGGCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGGCGGCTCACCTCTCGTTCGCTCGCCTGGCGCGGCGCTACGGCGACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTTTCCAGATCCGCCTGGGCAGCTGCCCCATAGTGGTGCTGAATGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTTTCCAGATCCGCCTGGGCAGCTGCCCCATAGTGGTGCTGAATGGCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGCGCCATCCACCAGGCCCTGGTGCAGCAGGGCTCGGCCTTCGCCGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGCGCCATCCACCAGGCCCTGGTGCAGCAGGGCTCGGCCTTCGCCGACCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCGGCCTTCGCCTCCTTCCGTGTGGTGTCCGGCGGCCGCAGCATGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCGGCCTTCGCCTCCTTCCGTGTGGTGTCCGGCGGCCGCAGCATGGCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCGGCCACTACTCGGAGCACTGGAAGGTGCAGCGGCGCGCAGCCCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCGGCCACTACTCGGAGCACTGGAAGGTGCAGCGGCGCGCAGCCCACAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGATGCGCAACTTCTTCACGCGCCAGCCGCGCAGCCGCCAAGTCCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGATGCGCAACTTCTTCACGCGCCAGCCGCGCAGCCGCCAAGTCCTCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGCCACGTGCTGAGCGAGGCGCGCGAGCTGGTGGCGCTGCTGGTGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGCCACGTGCTGAGCGAGGCGCGCGAGCTGGTGGCGCTGCTGGTGCGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAGCGCGGACGGCGCCTTCCTCGACCCGAGGCCGCTGACCGTCGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCAGCGCGGACGGCGCCTTCCTCGACCCGAGGCCGCTGACCGTCGTGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGGCCAACGTCATGAGTGCCGTGTGTTTCGGCTGCCGCTACAGCCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGGCCAACGTCATGAGTGCCGTGTGTTTCGGCTGCCGCTACAGCCACGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGACCCCGAGTTCCGTGAGCTGCTCAGCCACAACGAAGAGTTCGGGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGACCCCGAGTTCCGTGAGCTGCTCAGCCACAACGAAGAGTTCGGGCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CGGTGGGCGCGGGCAGCCTGGTGGACGTGATGCCCTGGCTGCAGTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CGGTGGGCGCGGGCAGCCTGGTGGACGTGATGCCCTGGCTGCAGTACTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCCAACCCGGTGCGCACCGTTTTCCGCGAATTCGAGCAGCTCAACCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCCAACCCGGTGCGCACCGTTTTCCGCGAATTCGAGCAGCTCAACCGCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTTCAGCAACTTCATCCTGGACAAGTTCTTGAGGCACTGCGAAAGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTTCAGCAACTTCATCCTGGACAAGTTCTTGAGGCACTGCGAAAGCCTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGCCCGGGGCCGCCCCCCGCGACATGATGGACGCCTTTATCCTCTCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGCCCGGGGCCGCCCCCCGCGACATGATGGACGCCTTTATCCTCTCTGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAAAAGAAGGCGGCCGGGGACTCGCACGGTGGTGGCGCGCGGCTGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAAAAGAAGGCGGCCGGGGACTCGCACGGTGGTGGCGCGCGGCTGGATTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGAGAACGTACCGGCCACTATCACTGACATCTTCGGCGCCAGCCAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGAGAACGTACCGGCCACTATCACTGACATCTTCGGCGCCAGCCAGGACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCCTGTCCACCGCGCTGCAGTGGCTGCTCCTCCTCTTCACCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101001 CCCTGTCCACCGCGCTGCAGTGGCTGCTCCTCCTCTTCACCAGGTA...C

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1044   GTATCCTGATGTGCAGACTCGAGTGCAGGCAGAATTGGATCAGGTCGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104077 AGGTATCCTGATGTGCAGACTCGAGTGCAGGCAGAATTGGATCAGGTCGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGGGAGGGACCGTCTGCCTTGTATGGGTGACCAGCCCAACCTGCCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104127 GGGGAGGGACCGTCTGCCTTGTATGGGTGACCAGCCCAACCTGCCCTATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TCCTGGCCTTCCTTTATGAAGCCATGCGCTTCTCCAGCTTTGTGCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104177 TCCTGGCCTTCCTTTATGAAGCCATGCGCTTCTCCAGCTTTGTGCCTGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ACTATTCCTCATGCCACCACTGCCAACACCTCTGTCTTGGGCTACCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104227 ACTATTCCTCATGCCACCACTGCCAACACCTCTGTCTTGGGCTACCACAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TCCCAAGGACACTGTGGTTTTTGTCAACCAGTGGTCTGTGAATCATGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104277 TCCCAAGGACACTGTGGTTTTTGTCAACCAGTGGTCTGTGAATCATGACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 CAGTGAAGTGGCCTAACCCGGAGAACTTTGATCCAGCTCGATTCTTGGAC
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104327 CACTGAAGTGGCCTAACCCGGAGAACTTTGATCCAGCTCGATTCTTGGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 AAGGATGGCCTCATCAACAAGGACCTGACCAGCAGAGTGATGATTTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104377 AAGGATGGCCTCATCAACAAGGACCTGACCAGCAGAGTGATGATTTTTTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 AGTGGGCAAAAGGCGGTGCATTGGCGAAGAACTTTCTAAGATGCAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104427 AGTGGGCAAAAGGCGGTGCATTGGCGAAGAACTTTCTAAGATGCAGCTTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 TTCTCTTCATCTCCATCCTGGCTCACCAGTGCGATTTCAGGGCCAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104477 TTCTCTTCATCTCCATCCTGGCTCACCAGTGCGATTTCAGGGCCAACCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 AATGAGCCTGCGAAAATGAATTTCAGTTATGGTCTAACCATTAAACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104527 AATGAGCCTGCGAAAATGAATTTCAGTTATGGTCTAACCATTAAACCCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 GTCATTTAAAGTCAATGTCACTCTCAGAGAGTCCATGGAGCTCCTTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104577 GTCATTTAAAGTCAATGTCACTCTCAGAGAGTCCATGGAGCTCCTTGATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .
   1592 GTGCTGTCCAAAATTTACAAGCCAAGGAAACTTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104627 GTGCTGTCCAAAATTTACAAGCCAAGGAAACTTGCCAA