seq1 = pF1KE6737.tfa, 2598 bp
seq2 = pF1KE6737/gi568815593r_78898085.tfa (gi568815593r:78898085_79169620), 271536 bp

>pF1KE6737 2598
>gi568815593r:78898085_79169620 (Chr5)

(complement)

1-101  (100001-100101)   100% ->
102-276  (105834-106008)   100% ->
277-375  (113713-113811)   100% ->
376-540  (115273-115437)   100% ->
541-745  (118130-118334)   100% ->
746-994  (125069-125317)   100% ->
995-1193  (127140-127338)   100% ->
1194-1363  (136213-136382)   100% ->
1364-1517  (136781-136934)   100% ->
1518-1683  (138623-138788)   100% ->
1684-1814  (139587-139717)   100% ->
1815-2032  (140971-141188)   100% ->
2033-2190  (143040-143197)   100% ->
2191-2250  (145291-145350)   100% ->
2251-2385  (164214-164348)   100% ->
2386-2598  (171324-171536)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCCGTCCCGGCGCGCAGCTGCTGCGGGGCCTCCTGCTGCGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCCGTCCCGGCGCGCAGCTGCTGCGGGGCCTCCTGCTGCGGAGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCGCTGCAGGGCTCCCCCGGGCGCCCGCGCTCTGTCTGCGGCCGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCGCTGCAGGGCTCCCCCGGGCGCCCGCGCTCTGTCTGCGGCCGGGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 G         AGAGGAAAAACCACCCTTATCTGCAGAAACACAATGGAAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGTG...CAGAGAGGAAAAACCACCCTTATCTGCAGAAACACAATGGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACAGAGCAGAAACAGTGATAATTGGAGGTGGCTGTGTTGGTGTGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105874 GACAGAGCAGAAACAGTGATAATTGGAGGTGGCTGTGTTGGTGTGAGTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCTTATCACCTGGCCAAAGCAGGGATGAAAGATGTGGTCCTGCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105924 GGCTTATCACCTGGCCAAAGCAGGGATGAAAGATGTGGTCCTGCTGGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AATCAGAGCTCACGGCTGGATCTACCTGGCACGCA         GCAGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 105974 AATCAGAGCTCACGGCTGGATCTACCTGGCACGCAGTA...AAGGCAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTAACAACTTACTTTCATCCTGGAATAAACTTGAAGAAAATACATTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113719 TTAACAACTTACTTTCATCCTGGAATAAACTTGAAGAAAATACATTATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAGCATCAAACTTTATGAGAAACTGGAAGAAGAAACTGGTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 113769 TAGCATCAAACTTTATGAGAAACTGGAAGAAGAAACTGGTCAGGTA...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    376   GTGGTGGGATTCCATCAGCCAGGTAGTATCAGACTTGCTACCACCCCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115271 AGGTGGTGGGATTCCATCAGCCAGGTAGTATCAGACTTGCTACCACCCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTAAGGGTAGATGAATTTAAATATCAAATGACTCGGACTGGCTGGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115321 GTAAGGGTAGATGAATTTAAATATCAAATGACTCGGACTGGCTGGCATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AACAGAACAGTATCTCATTGAACCTGAAAAAATTCAAGAGATGTTCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115371 AACAGAACAGTATCTCATTGAACCTGAAAAAATTCAAGAGATGTTCCCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TACTCAACATGAATAAG         GTTTTAGCTGGATTGTATAATCCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 115421 TACTCAACATGAATAAGGTA...TAGGTTTTAGCTGGATTGTATAATCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGAGATGGTCACATTGATCCTTATTCTCTAACTATGGCACTGGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118154 GGAGATGGTCACATTGATCCTTATTCTCTAACTATGGCACTGGCTGCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGCTAGGAAATGTGGTGCCCTTTTAAAATATCCTGCACCAGTAACTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118204 GGCTAGGAAATGTGGTGCCCTTTTAAAATATCCTGCACCAGTAACTTCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGAAAGCCAGGTCAGATGGAACATGGGACGTTGAAACACCACAGGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118254 TGAAAGCCAGGTCAGATGGAACATGGGACGTTGAAACACCACAGGGGTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATGAGAGCAAATAGAATTGTGAATGCTGCAG         GATTTTGGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 118304 ATGAGAGCAAATAGAATTGTGAATGCTGCAGGTA...AAGGATTTTGGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCGTGAAGTAGGTAAAATGATTGGACTAGAACATCCTCTCATTCCGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125079 TCGTGAAGTAGGTAAAATGATTGGACTAGAACATCCTCTCATTCCGGTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AACATCAATATGTTGTTACATCGACTATATCTGAAGTGAAAGCTTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125129 AACATCAATATGTTGTTACATCGACTATATCTGAAGTGAAAGCTTTGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CGAGAACTGCCTGTGCTCCGTGACCTGGAAGGATCATATTATCTCCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125179 CGAGAACTGCCTGTGCTCCGTGACCTGGAAGGATCATATTATCTCCGACA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGAAAGGGATGGGCTTTTGTTTGGTCCATATGAAAGTCAAGAGAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125229 GGAAAGGGATGGGCTTTTGTTTGGTCCATATGAAAGTCAAGAGAAAATGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AAGTTCAGGACTCCTGGGTCACCAATGGAGTTCCTCCAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 125279 AAGTTCAGGACTCCTGGGTCACCAATGGAGTTCCTCCAGGTG...TAGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTTGGAAAGGAACTCTTTGAGTCTGATCTAGATCGAATCATGGAACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127142 TTTGGAAAGGAACTCTTTGAGTCTGATCTAGATCGAATCATGGAACACAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CAAAGCTGCCATGGAAATGGTTCCTGTCTTGAAAAAGGCTGACATCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127192 CAAAGCTGCCATGGAAATGGTTCCTGTCTTGAAAAAGGCTGACATCATCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ATGTTGTCAATGGTCCTATCACGTATTCTCCTGACATTCTGCCTATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127242 ATGTTGTCAATGGTCCTATCACGTATTCTCCTGACATTCTGCCTATGGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GGGCCCCATCAGGGGGTCAGAAACTACTGGGTGGCTATAGGCTTTGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 127292 GGGCCCCATCAGGGGGTCAGAAACTACTGGGTGGCTATAGGCTTTGGGTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1194       ATATGGCATAATCCACGCTGGTGGGGTAGGGAAATATCTCAGTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127342 ...AAGATATGGCATAATCCACGCTGGTGGGGTAGGGAAATATCTCAGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ACTGGATCCTGCATGGAGAACCTCCTTTTGATCTGATAGAATTGGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136257 ACTGGATCCTGCATGGAGAACCTCCTTTTGATCTGATAGAATTGGATCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 AATCGCTATGGCAAATGGACAACAACCCAGTACACTGAGGCCAAAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136307 AATCGCTATGGCAAATGGACAACAACCCAGTACACTGAGGCCAAAGCAAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 AGAATCATATGGATTCAACAATATTG         TTGGTTATCCTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 136357 AGAATCATATGGATTCAACAATATTGGTA...CAGTTGGTTATCCTAAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AAGAACGGTTTGCTGGGAGGCCGACTCAACGAGTCAGTGGGCTCTATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136796 AAGAACGGTTTGCTGGGAGGCCGACTCAACGAGTCAGTGGGCTCTATCAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AGGCTGGAGTCTAAGTGTTCCATGGGGTTCCATGCTGGCTGGGAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136846 AGGCTGGAGTCTAAGTGTTCCATGGGGTTCCATGCTGGCTGGGAGCAGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GCACTGGTTCTACAAACCAGGCCAGGACACTCAGTACAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 136896 GCACTGGTTCTACAAACCAGGCCAGGACACTCAGTACAGGTG...CAGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CAAGTTTTCGCCGCACAAACTGGTTTGAGCCTGTGGGCTCGGAGTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138625 CAAGTTTTCGCCGCACAAACTGGTTTGAGCCTGTGGGCTCGGAGTATAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CAGGTTATGCAAAGAGTAGCGGTAACTGACCTATCACCATTTGGCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138675 CAGGTTATGCAAAGAGTAGCGGTAACTGACCTATCACCATTTGGCAAGTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 TAACATCAAAGGCCAAGATTCCATTAGACTACTGGACCATCTCTTTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138725 TAACATCAAAGGCCAAGATTCCATTAGACTACTGGACCATCTCTTTGCAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 ATGTCATTCCAAAG         GTGGGTTTTACAAATATAAGTCACATG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 138775 ATGTCATTCCAAAGGTA...TAGGTGGGTTTTACAAATATAAGTCACATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 TTAACACCCAAGGGTCGAGTGTATGCTGAGCTGACTGTTTCTCACCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139614 TTAACACCCAAGGGTCGAGTGTATGCTGAGCTGACTGTTTCTCACCAATC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 TCCTGGGGAGTTTCTTTTAATTACTGGCTCTGGATCAGAACTTCATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139664 TCCTGGGGAGTTTCTTTTAATTACTGGCTCTGGATCAGAACTTCATGATC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 TTAG         ATGGATTGAAGAAGAAGCAGTCAAAGGTGGATATGAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139714 TTAGGTA...CAGATGGATTGAAGAAGAAGCAGTCAAAGGTGGATATGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GTTGAAATTAAAAACATAACTGATGAGCTTGGAGTTCTTGGAGTTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141008 GTTGAAATTAAAAACATAACTGATGAGCTTGGAGTTCTTGGAGTTGCTGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 GCCACAGGCAAGAAAGGTCCTTCAGAAACTGACCTCTGAAGATCTTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141058 GCCACAGGCAAGAAAGGTCCTTCAGAAACTGACCTCTGAAGATCTTAGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 ATGATGTTTTCAAGTTTCTTCAAACCAAGTCCTTAAAGGTTTCCAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141108 ATGATGTTTTCAAGTTTCTTCAAACCAAGTCCTTAAAGGTTTCCAACATT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 CCTGTCACTGCTATTAGGATATCTTATACTG         GTGAGCTGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 141158 CCTGTCACTGCTATTAGGATATCTTATACTGGTA...CAGGTGAGCTGGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 TTGGGAGCTGTATCACAGAAGAGAAGATTCTGTGGCGCTGTATGACGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143050 TTGGGAGCTGTATCACAGAAGAGAAGATTCTGTGGCGCTGTATGACGCTA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 TCATGAATGCAGGCCAGGAGGAGGGAATCGACAATTTTGGAACCTATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143100 TCATGAATGCAGGCCAGGAGGAGGGAATCGACAATTTTGGAACCTATGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 ATGAATGCCTTACGCCTGGAGAAAGCCTTCAGAGCCTGGGGGTTAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 143150 ATGAATGCCTTACGCCTGGAGAAAGCCTTCAGAGCCTGGGGGTTAGAGGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2191        ATGAACTGTGATACAAATCCTTTGGAAGCTGGACTGGAATATT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143200 T...TAGATGAACTGTGATACAAATCCTTTGGAAGCTGGACTGGAATATT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 TTGTGAAGTTAAATAAG         CCAGCAGACTTCATAGGAAAGCAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 145334 TTGTGAAGTTAAATAAGGTA...CAGCCAGCAGACTTCATAGGAAAGCAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 GCACTGAAACAGATTAAAGCCAAGGGGCTGAAACGAAGACTGGTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164238 GCACTGAAACAGATTAAAGCCAAGGGGCTGAAACGAAGACTGGTCTGCCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 CACCTTGGCAACGGATGATGTTGATCCAGAGGGAAATGAAAGCATCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164288 CACCTTGGCAACGGATGATGTTGATCCAGAGGGAAATGAAAGCATCTGGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 ACAATGGCAAG         GTGGTTGGCAACACGACATCTGGAAGCTAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 164338 ACAATGGCAAGGTG...CAGGTGGTTGGCAACACGACATCTGGAAGCTAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 AGCTACAGCATCCAGAAGAGTCTGGCTTTCGCATATGTCCCTGTACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171354 AGCTACAGCATCCAGAAGAGTCTGGCTTTCGCATATGTCCCTGTACAACT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 AAGTGAAGTGGGACAGCAAGTGGAAGTTGAACTATTAGGCAAAAATTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171404 AAGTGAAGTGGGACAGCAAGTGGAAGTTGAACTATTAGGCAAAAATTACC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 CAGCAGTCATCATACAAGAACCTTTGGTATTGACCGAACCAACCAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171454 CAGCAGTCATCATACAAGAACCTTTGGTATTGACCGAACCAACCAGAAAC

   2700     .    :    .    :    .    :
   2566 CGGCTTCAGAAAAAAGGTGGAAAGGACAAAACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 171504 CGGCTTCAGAAAAAAGGTGGAAAGGACAAAACT