seq1 = pF1KE6730.tfa, 2427 bp
seq2 = pF1KE6730/gi568815582r_29772186.tfa (gi568815582r:29772186_29999019), 226834 bp

>pF1KE6730 2427
>gi568815582r:29772186_29999019 (Chr16)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-211  (101036-101167)   100% ->
212-511  (101899-102198)   99% ->
512-697  (110295-110480)   100% ->
698-866  (111203-111371)   100% ->
867-1030  (113271-113434)   100% ->
1031-1231  (118956-119156)   100% ->
1232-1370  (120595-120733)   100% ->
1371-1567  (121553-121749)   100% ->
1568-1762  (122070-122264)   100% ->
1763-1954  (125291-125482)   100% ->
1955-2146  (125589-125780)   100% ->
2147-2185  (126277-126315)   100% ->
2186-2303  (126494-126611)   100% ->
2304-2400  (126737-126833)   100% ->
2401-2427  (127292-127318)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGATCCAGG         GTCTGCCCCTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 AATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGATCCAGGGTA...TAGGTCTGCCCCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101048 AGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCTGAGGCCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101098 TCTGAGGCCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAGATGGGCTACCTGCCAG         GATCTGATCCGGACCCCACGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| |||||||||||
 101148 AGAGATGGGCTACCTGCCAGGTG...CAGGATCTGATCGGGACCCCACGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TAGCCACCCCTCCGGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101920 TAGCCACCCCTCCGGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCACTGAGCCGGGGACAGGGCCTCTGACAACAGCCGTCACCCCTAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101970 GCCACTGAGCCGGGGACAGGGCCTCTGACAACAGCCGTCACCCCTAACGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGACCCCGCCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102020 GGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGACCCCGCCCCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GAACCACAGCCCCACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102070 GAACCACAGCCCCACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGGCCTGAGGGAGGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102120 GGGCCTGAGGGAGGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AACTGTTACCACTACGGTGACCAGCCCAG         CCTACCTCCTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 102170 AACTGTTACCACTACGGTGACCAGCCCAGGTG...CAGCCTACCTCCTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCGGCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110307 GCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCGGCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGCACCCTGGGGGCACTGCCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110357 CTGCACCCTGGGGGCACTGCCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110407 GCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCCTGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACGGTGAAACCCCCAGCTGCATGG         CATCCTGTGGTGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 110457 ACGGTGAAACCCCCAGCTGCATGGGTG...CAGCATCCTGTGGTGGCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111220 ATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CGTAGGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111270 CGTAGGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGTCTCGCTGGATGAGGACAATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111320 GCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGTCTCGCTGGATGAGGACAATGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CG         GCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGCCCCCTATCCCCCGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111370 CGGTA...CAGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGCCCCCTATCCCCCGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GATCTATGATTCGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113310 GATCTATGATTCGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ACGCCCAGTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAGACACCTGCCAATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113360 ACGCCCAGTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAGACACCTGCCAATCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAG         CCTTTGAGGAGGATCG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 113410 CTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAGGTA...CAGCCTTTGAGGAGGATCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CTGCTTCGCCCCCTTCCTGGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118972 CTGCTTCGCCCCCTTCCTGGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 AGTATCGCCCAGGGGCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAGGATATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119022 AGTATCGCCCAGGGGCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAGGATATGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGATCCCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119072 CTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGATCCCACAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 ACCCCACTGGAACGACACAGAGCCGGCCTGCAAAG         CCATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 119122 ACCCCACTGGAACGACACAGAGCCGGCCTGCAAAGGTG...TAGCCATGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120601 GTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120651 CCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCCAAGTTGAGAT         ATTGAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 120701 GGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCCAAGTTGAGATGTA...CAGATTGAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGACGGGGACGGTCCCAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121561 TGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGACGGGGACGGTCCCAGCGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CGAGTCTTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121611 CGAGTCTTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CTCTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCAGGCACCGCCCGGGCCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121661 CTCTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCAGGCACCGCCCGGGCCCCCAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 ATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTGCACTTCAAAG         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 121711 ATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTGCACTTCAAAGGTA...CAGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GTCCCGAGGAACGACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122072 GTCCCGAGGAACGACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GAGAACGGCATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACGGTGCTCACCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122122 GAGAACGGCATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACGGTGCTCACCTACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 AGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACATTCTCACTTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122172 AGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACATTCTCACTTGCCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 TGGGACCTGTCTTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 122222 TGGGACCTGTCTTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGAGTG...C

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1763   TCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACCGCACCG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125289 AGTCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACCGCACCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 CCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCGCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125339 CCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCGCTGCCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 CCAGGGTACAGCCTCGAGGGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125389 CCAGGGTACAGCCTCGAGGGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 CACAGGCACACCCAAGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGCCT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 125439 CACAGGCACACCCAAGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGCCTGTG...

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1955    TGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125586 CAGTGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 CAGACGCTGTACAAGCACCACTACCAGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125636 CAGACGCTGTACAAGCACCACTACCAGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 CTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125686 CTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 CCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 125736 CCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGGTG..

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147     TTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCGAAAACTGGAAG       
        .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 125786 .CAGTTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCGAAAACTGGAAGGTC...T

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2186   TGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGGGGGAACCTGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126492 AGTGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGGGGGAACCTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 CCCTGGCCATCCTGCTGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126542 CCCTGGCCATCCTGCTGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 GTTTACATCTACTACACCAA         GCTTCAGGGAAAGTCCCTTTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 126592 GTTTACATCTACTACACCAAGTA...CAGGCTTCAGGGAAAGTCCCTTTT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 CGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126758 CGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGGACT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 TCAGCAACCCGCTGTATGAAGCTGGG         GATACGCGGGAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 126808 TCAGCAACCCGCTGTATGAAGCTGGGGTA...CAGGATACGCGGGAGTAT

   2550     .    :
   2416 GAAGTTTCCATC
        ||||||||||||
 127307 GAAGTTTCCATC