Result of SIM4 for
pF1KE6714
seq1 = pF1KE6714.tfa, 3552 bp
seq2 = pF1KE6714/gi568815583r_65096734.tfa (gi568815583r:65096734_65309755), 213022 bp
>pF1KE6714 3552
>gi568815583r:65096734_65309755 (Chr15)
(complement)
1-61 (100001-100061) 100% ->
62-154 (101992-102084) 100% ->
155-424 (102705-102974) 100% ->
425-604 (104290-104469) 100% ->
605-919 (105174-105488) 100% ->
920-1028 (106286-106394) 100% ->
1029-1186 (107727-107884) 100% ->
1187-3552 (110657-113022) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGTGGGGACCAAGGCCTGGGTGTTCTCCTTCCTGGTCCTGGAAGTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGTGGGGACCAAGGCCTGGGTGTTCTCCTTCCTGGTCCTGGAAGTCAC
50 . : . : . : . : . :
51 ATCTGTGTTGG GGAGACAGACGATGCTCACCCAGTCAGTAA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
100051 ATCTGTGTTGGGTA...CAGGGAGACAGACGATGCTCACCCAGTCAGTAA
100 . : . : . : . : . :
92 GAAGAGTCCAGCCTGGGAAGAAGAACCCCAGCATCTTTGCCAAGCCTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102022 GAAGAGTCCAGCCTGGGAAGAAGAACCCCAGCATCTTTGCCAAGCCTGCC
150 . : . : . : . : . :
142 GACACCCTGGAGA GCCCTGGTGAGTGGACAACATGGTTCAA
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
102072 GACACCCTGGAGAGTG...CAGGCCCTGGTGAGTGGACAACATGGTTCAA
200 . : . : . : . : . :
183 CATCGACTACCCAGGCGGGAAGGGCGACTATGAGCGGCTGGACGCCATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102733 CATCGACTACCCAGGCGGGAAGGGCGACTATGAGCGGCTGGACGCCATTC
250 . : . : . : . : . :
233 GCTTCTACTATGGGGACCGTGTATGTGCCCGTCCCCTGCGGCTAGAGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102783 GCTTCTACTATGGGGACCGTGTATGTGCCCGTCCCCTGCGGCTAGAGGCT
300 . : . : . : . : . :
283 CGGACCACTGACTGGACACCTGCGGGCAGCACTGGCCAGGTGGTCCATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102833 CGGACCACTGACTGGACACCTGCGGGCAGCACTGGCCAGGTGGTCCATGG
350 . : . : . : . : . :
333 TAGTCCCCGTGAGGGTTTCTGGTGCCTCAACAGGGAGCAGCGGCCTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102883 TAGTCCCCGTGAGGGTTTCTGGTGCCTCAACAGGGAGCAGCGGCCTGGCC
400 . : . : . : . : . :
383 AGAACTGCTCTAATTACACCGTACGCTTCCTCTGCCCACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
102933 AGAACTGCTCTAATTACACCGTACGCTTCCTCTGCCCACCAGGTA...CA
450 . : . : . : . : . :
425 GATCCCTGCGCCGAGACACAGAGCGCATCTGGAGCCCATGGTCTCCCTG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104289 GGATCCCTGCGCCGAGACACAGAGCGCATCTGGAGCCCATGGTCTCCCTG
500 . : . : . : . : . :
474 GAGCAAGTGCTCAGCTGCCTGTGGTCAGACTGGGGTCCAGACTCGCACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104339 GAGCAAGTGCTCAGCTGCCTGTGGTCAGACTGGGGTCCAGACTCGCACAC
550 . : . : . : . : . :
524 GCATTTGCTTGGCAGAGATGGTGTCGCTGTGCAGTGAGGCCAGCGAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104389 GCATTTGCTTGGCAGAGATGGTGTCGCTGTGCAGTGAGGCCAGCGAAGAG
600 . : . : . : . : . :
574 GGTCAGCACTGCATGGGCCAGGACTGTACAG CCTGTGACCT
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
104439 GGTCAGCACTGCATGGGCCAGGACTGTACAGGTA...CAGCCTGTGACCT
650 . : . : . : . : . :
615 GACCTGCCCAATGGGCCAGGTGAATGCTGACTGTGATGCCTGCATGTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105184 GACCTGCCCAATGGGCCAGGTGAATGCTGACTGTGATGCCTGCATGTGCC
700 . : . : . : . : . :
665 AGGACTTCATGCTTCATGGGGCTGTCTCCCTTCCCGGAGGTGCCCCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105234 AGGACTTCATGCTTCATGGGGCTGTCTCCCTTCCCGGAGGTGCCCCAGCC
750 . : . : . : . : . :
715 TCAGGGGCTGCTATCTACCTCCTGACCAAGACGCCGAAGCTGCTGACCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105284 TCAGGGGCTGCTATCTACCTCCTGACCAAGACGCCGAAGCTGCTGACCCA
800 . : . : . : . : . :
765 GACAGACAGTGATGGGAGATTCCGAATCCCTGGCTTGTGCCCTGATGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105334 GACAGACAGTGATGGGAGATTCCGAATCCCTGGCTTGTGCCCTGATGGCA
850 . : . : . : . : . :
815 AAAGCATCCTGAAGATCACAAAGGTCAAGTTTGCCCCCATTGTACTCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105384 AAAGCATCCTGAAGATCACAAAGGTCAAGTTTGCCCCCATTGTACTCACA
900 . : . : . : . : . :
865 ATGCCCAAGACTAGCCTGAAGGCAGCCACCATCAAGGCAGAGTTTGTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105434 ATGCCCAAGACTAGCCTGAAGGCAGCCACCATCAAGGCAGAGTTTGTGAG
950 . : . : . : . : . :
915 GGCAG AGACTCCATACATGGTGATGAACCCTGAGACAAAAG
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105484 GGCAGGTA...CAGAGACTCCATACATGGTGATGAACCCTGAGACAAAAG
1000 . : . : . : . : . :
956 CACGGAGAGCTGGGCAGAGCGTGTCTCTGTGCTGTAAGGCCACAGGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106322 CACGGAGAGCTGGGCAGAGCGTGTCTCTGTGCTGTAAGGCCACAGGGAAG
1050 . : . : . : . : . :
1006 CCCAGGCCAGACAAGTATTTTTG GTATCATAATGACACATT
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
106372 CCCAGGCCAGACAAGTATTTTTGGTG...CAGGTATCATAATGACACATT
1100 . : . : . : . : . :
1047 GCTGGATCCTTCCCTCTACAAGCATGAGAGCAAGCTGGTGCTGAGGAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107745 GCTGGATCCTTCCCTCTACAAGCATGAGAGCAAGCTGGTGCTGAGGAAAC
1150 . : . : . : . : . :
1097 TGCAGCAGCACCAGGCTGGGGAGTACTTTTGCAAGGCCCAGAGTGATGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107795 TGCAGCAGCACCAGGCTGGGGAGTACTTTTGCAAGGCCCAGAGTGATGCT
1200 . : . : . : . : . :
1147 GGGGCTGTGAAGTCCAAGGTTGCCCAGCTGATTGTCATAG C
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
107845 GGGGCTGTGAAGTCCAAGGTTGCCCAGCTGATTGTCATAGGTA...CAGC
1250 . : . : . : . : . :
1188 ATCTGATGAGACTCCTTGCAACCCAGTTCCTGAGAGCTATCTTATCCGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110658 ATCTGATGAGACTCCTTGCAACCCAGTTCCTGAGAGCTATCTTATCCGGC
1300 . : . : . : . : . :
1238 TGCCCCATGATTGCTTTCAGAATGCCACCAACTCCTTCTACTATGACGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110708 TGCCCCATGATTGCTTTCAGAATGCCACCAACTCCTTCTACTATGACGTG
1350 . : . : . : . : . :
1288 GGACGCTGCCCTGTTAAGACTTGTGCAGGGCAGCAGGATAATGGGATCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110758 GGACGCTGCCCTGTTAAGACTTGTGCAGGGCAGCAGGATAATGGGATCAG
1400 . : . : . : . : . :
1338 GTGCCGTGATGCTGTGCAGAACTGCTGTGGCATCTCCAAGACAGAGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110808 GTGCCGTGATGCTGTGCAGAACTGCTGTGGCATCTCCAAGACAGAGGAAA
1450 . : . : . : . : . :
1388 GGGAGATCCAGTGCAGTGGCTACACGCTACCCACCAAGGTGGCCAAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110858 GGGAGATCCAGTGCAGTGGCTACACGCTACCCACCAAGGTGGCCAAGGAG
1500 . : . : . : . : . :
1438 TGCAGCTGCCAGCGGTGTACGGAAACTCGGAGCATCGTGCGGGGCCGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110908 TGCAGCTGCCAGCGGTGTACGGAAACTCGGAGCATCGTGCGGGGCCGTGT
1550 . : . : . : . : . :
1488 CAGTGCTGCTGACAATGGGGAGCCCATGCGCTTTGGCCATGTGTACATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110958 CAGTGCTGCTGACAATGGGGAGCCCATGCGCTTTGGCCATGTGTACATGG
1600 . : . : . : . : . :
1538 GGAACAGCCGTGTAAGCATGACTGGCTACAAGGGCACTTTCACCCTCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111008 GGAACAGCCGTGTAAGCATGACTGGCTACAAGGGCACTTTCACCCTCCAT
1650 . : . : . : . : . :
1588 GTCCCCCAGGACACTGAGAGGCTGGTGCTCACATTTGTGGACAGGCTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111058 GTCCCCCAGGACACTGAGAGGCTGGTGCTCACATTTGTGGACAGGCTGCA
1700 . : . : . : . : . :
1638 GAAGTTTGTCAACACCACCAAAGTGCTACCTTTCAACAAGAAGGGGAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111108 GAAGTTTGTCAACACCACCAAAGTGCTACCTTTCAACAAGAAGGGGAGTG
1750 . : . : . : . : . :
1688 CCGTGTTCCATGAAATCAAGATGCTTCGTCGGAAAGAGCCCATCACTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
111158 CCGTGTTCCATGAAATCAAGATGCTTCGTCGGAAAAAGCCCATCACTTTG
1800 . : . : . : . : . :
1738 GAAGCCATGGAGACCAACATCATCCCCCTGGGGGAAGTGGTTGGTGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111208 GAAGCCATGGAGACCAACATCATCCCCCTGGGGGAAGTGGTTGGTGAAGA
1850 . : . : . : . : . :
1788 CCCCATGGCTGAACTGGAGATTCCATCCAGGAGTTTCTACAGGCAGAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111258 CCCCATGGCTGAACTGGAGATTCCATCCAGGAGTTTCTACAGGCAGAATG
1900 . : . : . : . : . :
1838 GGGAGCCCTACATAGGAAAAGTGAAGGCCAGTGTGACCTTCCTGGATCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111308 GGGAGCCCTACATAGGAAAAGTGAAGGCCAGTGTGACCTTCCTGGATCCC
1950 . : . : . : . : . :
1888 CGGAATATTTCCACAGCCACAGCTGCCCAGACTGACCTGAACTTCATCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111358 CGGAATATTTCCACAGCCACAGCTGCCCAGACTGACCTGAACTTCATCAA
2000 . : . : . : . : . :
1938 TGACGAAGGAGACACTTTCCCCCTTCGGACGTATGGCATGTTCTCTGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111408 TGACGAAGGAGACACTTTCCCCCTTCGGACGTATGGCATGTTCTCTGTGG
2050 . : . : . : . : . :
1988 ACTTCAGAGATGAGGTCACCTCAGAGCCACTTAATGCTGGCAAAGTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111458 ACTTCAGAGATGAGGTCACCTCAGAGCCACTTAATGCTGGCAAAGTGAAG
2100 . : . : . : . : . :
2038 GTCCACCTTGACTCGACCCAGGTCAAGATGCCAGAGCACATATCCACAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111508 GTCCACCTTGACTCGACCCAGGTCAAGATGCCAGAGCACATATCCACAGT
2150 . : . : . : . : . :
2088 GAAACTCTGGTCACTCAATCCAGACACAGGGCTGTGGGAGGAGGAAGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111558 GAAACTCTGGTCACTCAATCCAGACACAGGGCTGTGGGAGGAGGAAGGTG
2200 . : . : . : . : . :
2138 ATTTCAAATTTGAAAATCAAAGGAGGAACAAAAGAGAAGACAGAACCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111608 ATTTCAAATTTGAAAATCAAAGGAGGAACAAAAGAGAAGACAGAACCTTC
2250 . : . : . : . : . :
2188 CTGGTGGGCAACCTGGAGATTCGTGAGAGGAGGCTCTTTAACCTGGATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111658 CTGGTGGGCAACCTGGAGATTCGTGAGAGGAGGCTCTTTAACCTGGATGT
2300 . : . : . : . : . :
2238 TCCTGAAAGCAGGCGGTGCTTTGTTAAGGTGAGGGCCTACCGGAGTGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111708 TCCTGAAAGCAGGCGGTGCTTTGTTAAGGTGAGGGCCTACCGGAGTGAGA
2350 . : . : . : . : . :
2288 GGTTCTTGCCTAGTGAGCAGATCCAGGGGGTTGTGATCTCCGTGATTAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111758 GGTTCTTGCCTAGTGAGCAGATCCAGGGGGTTGTGATCTCCGTGATTAAC
2400 . : . : . : . : . :
2338 CTGGAGCCTAGAACTGGCTTCTTGTCCAACCCTAGGGCCTGGGGCCGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111808 CTGGAGCCTAGAACTGGCTTCTTGTCCAACCCTAGGGCCTGGGGCCGCTT
2450 . : . : . : . : . :
2388 TGACAGTGTCATCACAGGCCCCAACGGGGCCTGTGTGCCTGCCTTCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111858 TGACAGTGTCATCACAGGCCCCAACGGGGCCTGTGTGCCTGCCTTCTGTG
2500 . : . : . : . : . :
2438 ATGACCAGTCCCCTGATGCCTACTCTGCCTATGTCTTGGCAAGCCTGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111908 ATGACCAGTCCCCTGATGCCTACTCTGCCTATGTCTTGGCAAGCCTGGCT
2550 . : . : . : . : . :
2488 GGGGAGGAACTGCAAGCAGTGGAGTCTTCTCCTAAATTCAACCCAAATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111958 GGGGAGGAACTGCAAGCAGTGGAGTCTTCTCCTAAATTCAACCCAAATGC
2600 . : . : . : . : . :
2538 AATTGGCGTCCCTCAGCCCTATCTCAACAAGCTCAACTACCGTCGGACGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112008 AATTGGCGTCCCTCAGCCCTATCTCAACAAGCTCAACTACCGTCGGACGG
2650 . : . : . : . : . :
2588 ACCATGAGGATCCACGGGTTAAAAAGACAGCTTTCCAGATTAGCATGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112058 ACCATGAGGATCCACGGGTTAAAAAGACAGCTTTCCAGATTAGCATGGCC
2700 . : . : . : . : . :
2638 AAGCCAAGGCCCAACTCAGCTGAGGAGAGCAATGGGCCCATCTATGCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112108 AAGCCAAGGCCCAACTCAGCTGAGGAGAGCAATGGGCCCATCTATGCCTT
2750 . : . : . : . : . :
2688 TGAGAACCTCCGGGCATGTGAAGAGGCACCACCCAGTGCAGCCCACTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112158 TGAGAACCTCCGGGCATGTGAAGAGGCACCACCCAGTGCAGCCCACTTCC
2800 . : . : . : . : . :
2738 GGTTCTACCAGATTGAGGGGGATCGATATGACTACAACACAGTCCCCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112208 GGTTCTACCAGATTGAGGGGGATCGATATGACTACAACACAGTCCCCTTC
2850 . : . : . : . : . :
2788 AACGAAGATGACCCTATGAGCTGGACTGAAGACTATCTGGCATGGTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112258 AACGAAGATGACCCTATGAGCTGGACTGAAGACTATCTGGCATGGTGGCC
2900 . : . : . : . : . :
2838 AAAGCCGATGGAATTCAGGGCCTGCTATATCAAGGTGAAGATTGTGGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112308 AAAGCCGATGGAATTCAGGGCCTGCTATATCAAGGTGAAGATTGTGGGGC
2950 . : . : . : . : . :
2888 CACTGGAAGTGAATGTGCGATCCCGCAACATGGGGGGCACTCATCGGCGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
112358 CACTGGAAGTGAATGTGCGATCCCGCAACATGGGGGGCACTCATCGGCAG
3000 . : . : . : . : . :
2938 ACAGTGGGGAAGCTGTATGGAATCCGAGATGTGAGGAGCACTCGGGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112408 ACAGTGGGGAAGCTGTATGGAATCCGAGATGTGAGGAGCACTCGGGACAG
3050 . : . : . : . : . :
2988 GGACCAGCCCAATGTCTCAGCTGCCTGTCTGGAGTTCAAGTGCAGTGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112458 GGACCAGCCCAATGTCTCAGCTGCCTGTCTGGAGTTCAAGTGCAGTGGGA
3100 . : . : . : . : . :
3038 TGCTCTATGATCAGGACCGTGTGGACCGCACCCTGGTGAAGGTCATCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112508 TGCTCTATGATCAGGACCGTGTGGACCGCACCCTGGTGAAGGTCATCCCC
3150 . : . : . : . : . :
3088 CAGGGCAGCTGCCGTCGAGCCAGTGTGAACCCCATGCTGCATGAGTACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112558 CAGGGCAGCTGCCGTCGAGCCAGTGTGAACCCCATGCTGCATGAGTACCT
3200 . : . : . : . : . :
3138 GGTCAACCACTTGCCACTTGCAGTCAACAACGACACCAGTGAGTACACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112608 GGTCAACCACTTGCCACTTGCAGTCAACAACGACACCAGTGAGTACACCA
3250 . : . : . : . : . :
3188 TGCTGGCACCCTTGGACCCACTGGGCCACAACTATGGCATCTACACTGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112658 TGCTGGCACCCTTGGACCCACTGGGCCACAACTATGGCATCTACACTGTC
3300 . : . : . : . : . :
3238 ACTGACCAGGACCCTCGCACGGCCAAGGAGATCGCGCTCGGCCGGTGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112708 ACTGACCAGGACCCTCGCACGGCCAAGGAGATCGCGCTCGGCCGGTGCTT
3350 . : . : . : . : . :
3288 TGATGGCACATCCGATGGCTCCTCCAGAATCATGAAGAGCAATGTGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112758 TGATGGCACATCCGATGGCTCCTCCAGAATCATGAAGAGCAATGTGGGAG
3400 . : . : . : . : . :
3338 TAGCCCTCACCTTCAACTGTGTAGAGAGGCAAGTAGGCCGCCAGAGTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112808 TAGCCCTCACCTTCAACTGTGTAGAGAGGCAAGTAGGCCGCCAGAGTGCC
3450 . : . : . : . : . :
3388 TTCCAGTACCTCCAAAGCACCCCAGCCCAGTCCCCTGCTGCAGGCACTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112858 TTCCAGTACCTCCAAAGCACCCCAGCCCAGTCCCCTGCTGCAGGCACTGT
3500 . : . : . : . : . :
3438 CCAAGGAAGAGTGCCCTCGAGGAGGCAGCAGCGAGCGAGCAGGGGTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112908 CCAAGGAAGAGTGCCCTCGAGGAGGCAGCAGCGAGCGAGCAGGGGTGGCC
3550 . : . : . : . : . :
3488 AGCGCCAGAGTGGAGTGGTGGCCTCTCTGAGATTTCCTAGAGTTGCTCAA
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112958 AGCGCCAGGGTGGAGTGGTGGCCTCTCTGAGATTTCCTAGAGTTGCTCAA
3600 . : .
3538 CAGCCCCTGATCAAC
|||||||||||||||
113008 CAGCCCCTGATCAAC