Result of SIM4 for
pF1KE6704
seq1 = pF1KE6704.tfa, 3183 bp
seq2 = pF1KE6704/gi568815579r_53694052.tfa (gi568815579r:53694052_53924174), 230123 bp
>pF1KE6704 3183
>gi568815579r:53694052_53924174 (Chr19)
(complement)
1-289 (100001-100289) 100% ->
290-370 (109187-109267) 100% ->
371-2072 (112887-114588) 100% ->
2073-2243 (116510-116680) 100% ->
2244-2414 (118725-118895) 100% ->
2415-2585 (120053-120223) 100% ->
2586-2756 (122778-122948) 100% ->
2757-2927 (125762-125932) 100% ->
2928-3098 (128146-128316) 100% ->
3099-3183 (130039-130123) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCTACGAACCGCAGGCAGGGACGGCCTCTGTCGCCTGTCCACCTACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGCTACGAACCGCAGGCAGGGACGGCCTCTGTCGCCTGTCCACCTACTT
50 . : . : . : . : . :
51 GGAAGAACTCGAGGCTGTGGAACTGAAGAAGTTCAAGTTATACCTGGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GGAAGAACTCGAGGCTGTGGAACTGAAGAAGTTCAAGTTATACCTGGGGA
100 . : . : . : . : . :
101 CCGCGACAGAGCTGGGAGAAGGCAAGATCCCCTGGGGAAGCATGGAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 CCGCGACAGAGCTGGGAGAAGGCAAGATCCCCTGGGGAAGCATGGAGAAG
150 . : . : . : . : . :
151 GCCGGTCCCCTGGAAATGGCCCAGCTGCTCATCACCCACTTCGGGCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GCCGGTCCCCTGGAAATGGCCCAGCTGCTCATCACCCACTTCGGGCCAGA
200 . : . : . : . : . :
201 GGAGGCCTGGAGGTTGGCTCTCAGCACCTTTGAGCGGATAAACAGGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 GGAGGCCTGGAGGTTGGCTCTCAGCACCTTTGAGCGGATAAACAGGAAGG
250 . : . : . : . : . :
251 ACCTGTGGGAGAGAGGACAGAGAGAGGACCTGGTGAGGG AT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
100251 ACCTGTGGGAGAGAGGACAGAGAGAGGACCTGGTGAGGGGTA...CAGAT
300 . : . : . : . : . :
292 ACCCCACCTGGTGGCCCGTCCTCACTTGGGAACCAGTCAACATGCCTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109189 ACCCCACCTGGTGGCCCGTCCTCACTTGGGAACCAGTCAACATGCCTTCT
350 . : . : . : . : . :
342 GGAAGTCTCTCTTGTCACTCCAAGAAAAG ATCCCCAGGAAA
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
109239 GGAAGTCTCTCTTGTCACTCCAAGAAAAGGTG...TAGATCCCCAGGAAA
400 . : . : . : . : . :
383 CCTACAGGGACTATGTCCGCAGGAAATTCCGGCTCATGGAAGACCGCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112899 CCTACAGGGACTATGTCCGCAGGAAATTCCGGCTCATGGAAGACCGCAAT
450 . : . : . : . : . :
433 GCGCGCCTAGGGGAATGTGTCAACCTCAGCCACCGGTACACCCGGCTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112949 GCGCGCCTAGGGGAATGTGTCAACCTCAGCCACCGGTACACCCGGCTCCT
500 . : . : . : . : . :
483 GCTGGTGAAGGAGCACTCAAACCCCATGCAGGTCCAGCAGCAGCTTCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112999 GCTGGTGAAGGAGCACTCAAACCCCATGCAGGTCCAGCAGCAGCTTCTGG
550 . : . : . : . : . :
533 ACACAGGCCGGGGACACGCGAGGACCGTGGGACACCAGGCTAGCCCCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113049 ACACAGGCCGGGGACACGCGAGGACCGTGGGACACCAGGCTAGCCCCATC
600 . : . : . : . : . :
583 AAGATAGAGACCCTCTTTGAGCCAGACGAGGAGCGCCCCGAGCCACCGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113099 AAGATAGAGACCCTCTTTGAGCCAGACGAGGAGCGCCCCGAGCCACCGCG
650 . : . : . : . : . :
633 CACCGTGGTCATGCAAGGCGCGGCAGGGATAGGCAAGTCCATGCTGGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113149 CACCGTGGTCATGCAAGGCGCGGCAGGGATAGGCAAGTCCATGCTGGCAC
700 . : . : . : . : . :
683 ACAAGGTGATGCTGGACTGGGCGGACGGGAAGCTCTTCCAAGGCAGATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113199 ACAAGGTGATGCTGGACTGGGCGGACGGGAAGCTCTTCCAAGGCAGATTT
750 . : . : . : . : . :
733 GATTATCTCTTCTACATCAACTGCAGGGAGATGAACCAGAGTGCCACGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113249 GATTATCTCTTCTACATCAACTGCAGGGAGATGAACCAGAGTGCCACGGA
800 . : . : . : . : . :
783 ATGCAGCATGCAAGACCTCATCTTCAGCTGCTGGCCTGAGCCCAGCGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113299 ATGCAGCATGCAAGACCTCATCTTCAGCTGCTGGCCTGAGCCCAGCGCGC
850 . : . : . : . : . :
833 CTCTCCAGGAGCTCATCCGAGTTCCCGAGCGCCTCCTTTTCATCATCGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113349 CTCTCCAGGAGCTCATCCGAGTTCCCGAGCGCCTCCTTTTCATCATCGAC
900 . : . : . : . : . :
883 GGCTTCGATGAGCTCAAGCCTTCTTTCCACGATCCTCAGGGACCCTGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113399 GGCTTCGATGAGCTCAAGCCTTCTTTCCACGATCCTCAGGGACCCTGGTG
950 . : . : . : . : . :
933 CCTCTGCTGGGAGGAGAAACGGCCCACGGAGCTGCTTCTTAACAGCTTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113449 CCTCTGCTGGGAGGAGAAACGGCCCACGGAGCTGCTTCTTAACAGCTTAA
1000 . : . : . : . : . :
983 TTCGGAAGAAGCTGCTCCCTGAGCTATCTTTGCTCATCACCACACGGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113499 TTCGGAAGAAGCTGCTCCCTGAGCTATCTTTGCTCATCACCACACGGCCC
1050 . : . : . : . : . :
1033 ACGGCTTTGGAGAAGCTCCACCGTCTGCTGGAGCACCCCAGGCATGTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113549 ACGGCTTTGGAGAAGCTCCACCGTCTGCTGGAGCACCCCAGGCATGTGGA
1100 . : . : . : . : . :
1083 GATCCTGGGCTTCTCTGAGGCAGAAAGGAAGGAATACTTCTACAAGTATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113599 GATCCTGGGCTTCTCTGAGGCAGAAAGGAAGGAATACTTCTACAAGTATT
1150 . : . : . : . : . :
1133 TCCACAATGCAGAGCAGGCGGGCCAAGTCTTCAATTACGTGAGGGACAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113649 TCCACAATGCAGAGCAGGCGGGCCAAGTCTTCAATTACGTGAGGGACAAC
1200 . : . : . : . : . :
1183 GAGCCTCTCTTCACCATGTGCTTCGTCCCCCTGGTGTGCTGGGTGGTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113699 GAGCCTCTCTTCACCATGTGCTTCGTCCCCCTGGTGTGCTGGGTGGTGTG
1250 . : . : . : . : . :
1233 TACCTGCCTCCAGCAGCAGCTGGAGGGTGGGGGGCTGTTGAGACAGACGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113749 TACCTGCCTCCAGCAGCAGCTGGAGGGTGGGGGGCTGTTGAGACAGACGT
1300 . : . : . : . : . :
1283 CCAGGACCACCACTGCAGTGTACATGCTCTACCTGCTGAGTCTGATGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113799 CCAGGACCACCACTGCAGTGTACATGCTCTACCTGCTGAGTCTGATGCAA
1350 . : . : . : . : . :
1333 CCCAAGCCGGGGGCCCCGCGCCTCCAGCCCCCACCCAACCAGAGAGGGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113849 CCCAAGCCGGGGGCCCCGCGCCTCCAGCCCCCACCCAACCAGAGAGGGTT
1400 . : . : . : . : . :
1383 GTGCTCCTTGGCGGCAGATGGGCTCTGGAATCAGAAAATCCTATTTGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113899 GTGCTCCTTGGCGGCAGATGGGCTCTGGAATCAGAAAATCCTATTTGAGG
1450 . : . : . : . : . :
1433 AGCAGGACCTCCGGAAGCACGGCCTAGACGGGGAAGACGTCTCTGCCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113949 AGCAGGACCTCCGGAAGCACGGCCTAGACGGGGAAGACGTCTCTGCCTTC
1500 . : . : . : . : . :
1483 CTCAACATGAACATCTTCCAGAAGGACATCAACTGTGAGAGGTACTACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113999 CTCAACATGAACATCTTCCAGAAGGACATCAACTGTGAGAGGTACTACAG
1550 . : . : . : . : . :
1533 CTTCATCCACTTGAGTTTCCAGGAATTCTTTGCAGCTATGTACTATATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114049 CTTCATCCACTTGAGTTTCCAGGAATTCTTTGCAGCTATGTACTATATCC
1600 . : . : . : . : . :
1583 TGGACGAGGGGGAGGGCGGGGCAGGCCCAGACCAGGACGTGACCAGGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114099 TGGACGAGGGGGAGGGCGGGGCAGGCCCAGACCAGGACGTGACCAGGCTG
1650 . : . : . : . : . :
1633 TTGACCGAGTACGCGTTTTCTGAAAGGAGCTTCCTGGCACTCACCAGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114149 TTGACCGAGTACGCGTTTTCTGAAAGGAGCTTCCTGGCACTCACCAGCCG
1700 . : . : . : . : . :
1683 CTTCCTGTTTGGACTCCTGAACGAGGAGACCAGGAGCCACCTGGAGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114199 CTTCCTGTTTGGACTCCTGAACGAGGAGACCAGGAGCCACCTGGAGAAGA
1750 . : . : . : . : . :
1733 GTCTCTGCTGGAAGGTCTCGCCGCACATCAAGATGGACCTGTTGCAGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114249 GTCTCTGCTGGAAGGTCTCGCCGCACATCAAGATGGACCTGTTGCAGTGG
1800 . : . : . : . : . :
1783 ATCCAAAGCAAAGCTCAGAGCGACGGCTCCACCCTGCAGCAGGGCTCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114299 ATCCAAAGCAAAGCTCAGAGCGACGGCTCCACCCTGCAGCAGGGCTCCTT
1850 . : . : . : . : . :
1833 GGAGTTCTTCAGCTGCTTGTACGAGATCCAGGAGGAGGAGTTTATCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114349 GGAGTTCTTCAGCTGCTTGTACGAGATCCAGGAGGAGGAGTTTATCCAGC
1900 . : . : . : . : . :
1883 AGGCCCTGAGCCACTTCCAGGTGATCGTGGTCAGCAACATTGCCTCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114399 AGGCCCTGAGCCACTTCCAGGTGATCGTGGTCAGCAACATTGCCTCCAAG
1950 . : . : . : . : . :
1933 ATGGAGCACATGGTCTCCTCGTTCTGTCTGAAGCGCTGCAGGAGCGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114449 ATGGAGCACATGGTCTCCTCGTTCTGTCTGAAGCGCTGCAGGAGCGCCCA
2000 . : . : . : . : . :
1983 GGTGCTGCACTTGTATGGCGCCACCTACAGCGCGGACGGGGAAGACCGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114499 GGTGCTGCACTTGTATGGCGCCACCTACAGCGCGGACGGGGAAGACCGCG
2050 . : . : . : . : . :
2033 CGAGGTGCTCCGCAGGAGCGCACACGCTGTTGGTGCAGCT A
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
114549 CGAGGTGCTCCGCAGGAGCGCACACGCTGTTGGTGCAGCTGTA...CAGA
2100 . : . : . : . : . :
2074 CCAGAGAGGACCGTTCTGCTGGACGCCTACAGTGAACATCTGGCAGCGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116511 CCAGAGAGGACCGTTCTGCTGGACGCCTACAGTGAACATCTGGCAGCGGC
2150 . : . : . : . : . :
2124 CCTGTGCACCAATCCAAACCTGATAGAGCTGTCTCTGTACCGAAATGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116561 CCTGTGCACCAATCCAAACCTGATAGAGCTGTCTCTGTACCGAAATGCCC
2200 . : . : . : . : . :
2174 TGGGCAGCCGGGGGGTGAAGCTGCTCTGTCAAGGACTCAGACACCCCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116611 TGGGCAGCCGGGGGGTGAAGCTGCTCTGTCAAGGACTCAGACACCCCAAC
2250 . : . : . : . : . :
2224 TGCAAACTTCAGAACCTGAG GCTGAAGAGGTGCCGCATCTC
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
116661 TGCAAACTTCAGAACCTGAGGTG...CAGGCTGAAGAGGTGCCGCATCTC
2300 . : . : . : . : . :
2265 CAGCTCAGCCTGCGAGGACCTCTCTGCAGCTCTCATAGCCAATAAGAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118746 CAGCTCAGCCTGCGAGGACCTCTCTGCAGCTCTCATAGCCAATAAGAATT
2350 . : . : . : . : . :
2315 TGACAAGGATGGATCTCAGTGGCAACGGCGTTGGATTCCCAGGCATGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118796 TGACAAGGATGGATCTCAGTGGCAACGGCGTTGGATTCCCAGGCATGATG
2400 . : . : . : . : . :
2365 CTGCTTTGCGAGGGCCTGCGGCATCCCCAGTGCAGGCTGCAGATGATTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118846 CTGCTTTGCGAGGGCCTGCGGCATCCCCAGTGCAGGCTGCAGATGATTCA
2450 . : . : . : . : . :
2415 GTTGAGGAAGTGTCAGCTGGAGTCCGGGGCTTGTCAGGAGA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118896 GTG...AAGGTTGAGGAAGTGTCAGCTGGAGTCCGGGGCTTGTCAGGAGA
2500 . : . : . : . : . :
2456 TGGCTTCTGTGCTCGGCACCAACCCACATCTGGTTGAGTTGGACCTGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120094 TGGCTTCTGTGCTCGGCACCAACCCACATCTGGTTGAGTTGGACCTGACA
2550 . : . : . : . : . :
2506 GGAAATGCACTGGAGGATTTGGGCCTGAGGTTACTATGCCAGGGACTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120144 GGAAATGCACTGGAGGATTTGGGCCTGAGGTTACTATGCCAGGGACTGAG
2600 . : . : . : . : . :
2556 GCACCCAGTCTGCAGACTACGGACTTTGTG GCTGAAGATCT
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
120194 GCACCCAGTCTGCAGACTACGGACTTTGTGGTG...CAGGCTGAAGATCT
2650 . : . : . : . : . :
2597 GCCGCCTCACTGCTGCTGCCTGTGACGAGCTGGCCTCAACTCTCAGTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122789 GCCGCCTCACTGCTGCTGCCTGTGACGAGCTGGCCTCAACTCTCAGTGTG
2700 . : . : . : . : . :
2647 AACCAGAGCCTGAGAGAGCTGGACCTGAGCCTGAATGAGCTGGGGGACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122839 AACCAGAGCCTGAGAGAGCTGGACCTGAGCCTGAATGAGCTGGGGGACCT
2750 . : . : . : . : . :
2697 CGGGGTGCTGCTGCTGTGTGAGGGCCTCAGGCATCCCACGTGCAAGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122889 CGGGGTGCTGCTGCTGTGTGAGGGCCTCAGGCATCCCACGTGCAAGCTCC
2800 . : . : . : . : . :
2747 AGACCCTGCG GTTGGGCATCTGCCGGCTGGGCTCTGCCGCC
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
122939 AGACCCTGCGGTG...CAGGTTGGGCATCTGCCGGCTGGGCTCTGCCGCC
2850 . : . : . : . : . :
2788 TGTGAGGGTCTTTCTGTGGTGCTCCAGGCCAACCACAACCTCCGGGAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125793 TGTGAGGGTCTTTCTGTGGTGCTCCAGGCCAACCACAACCTCCGGGAGCT
2900 . : . : . : . : . :
2838 GGACTTGAGTTTCAACGACCTGGGAGACTGGGGCCTGTGGTTGCTGGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125843 GGACTTGAGTTTCAACGACCTGGGAGACTGGGGCCTGTGGTTGCTGGCTG
2950 . : . : . : . : . :
2888 AGGGGCTGCAACATCCCGCCTGCAGACTCCAGAAACTGTG G
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
125893 AGGGGCTGCAACATCCCGCCTGCAGACTCCAGAAACTGTGGTG...CAGG
3000 . : . : . : . : . :
2929 CTGGATAGCTGTGGCCTCACAGCCAAGGCTTGTGAGAATCTTTACTTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128147 CTGGATAGCTGTGGCCTCACAGCCAAGGCTTGTGAGAATCTTTACTTCAC
3050 . : . : . : . : . :
2979 CCTGGGGATCAACCAGACCTTGACCGACCTTTACCTGACCAACAACGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128197 CCTGGGGATCAACCAGACCTTGACCGACCTTTACCTGACCAACAACGCCC
3100 . : . : . : . : . :
3029 TAGGGGACACAGGTGTCCGACTGCTTTGCAAGCGGCTGAGCCATCCTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128247 TAGGGGACACAGGTGTCCGACTGCTTTGCAAGCGGCTGAGCCATCCTGGC
3150 . : . : . : . : . :
3079 TGCAAACTCCGAGTCCTCTG GTTATTTGGGATGGACCTGAA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
128297 TGCAAACTCCGAGTCCTCTGGTG...CAGGTTATTTGGGATGGACCTGAA
3200 . : . : . : . : . :
3120 TAAAATGACCCACAGTAGGTTGGCAGCGCTTCGAGTAACAAAACCTTATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130060 TAAAATGACCCACAGTAGGTTGGCAGCGCTTCGAGTAACAAAACCTTATT
3250 . :
3170 TGGACATTGGCTGC
||||||||||||||
130110 TGGACATTGGCTGC