seq1 = pF1KE6703.tfa, 2646 bp
seq2 = pF1KE6703/gi568815583r_65346887.tfa (gi568815583r:65346887_65612553), 265667 bp

>pF1KE6703 2646
>gi568815583r:65346887_65612553 (Chr15)

(complement)

1-259  (100001-100259)   100% ->
260-372  (105199-105311)   100% ->
373-546  (111775-111948)   99% ->
547-715  (114522-114690)   99% ->
716-826  (122255-122365)   100% ->
827-955  (124736-124864)   100% ->
956-1017  (127394-127455)   100% ->
1018-1118  (130939-131039)   100% ->
1119-1296  (132155-132332)   100% ->
1297-1456  (133515-133674)   100% ->
1457-1536  (138266-138345)   100% ->
1537-1689  (145331-145483)   100% ->
1690-1825  (145741-145876)   100% ->
1826-1971  (148648-148793)   100% ->
1972-2118  (156183-156329)   100% ->
2119-2271  (158139-158291)   100% ->
2272-2414  (160452-160594)   100% ->
2415-2526  (161444-161555)   100% ->
2527-2646  (165548-165667)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCAGCAATGGAAACAGAACAGCTGGGTGTTGAGATATTTGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCAGCAATGGAAACAGAACAGCTGGGTGTTGAGATATTTGAAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCGGACTGTGAGGAGAATATTGAATCACAGGATCGGCCTAAATTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCGGACTGTGAGGAGAATATTGAATCACAGGATCGGCCTAAATTGGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTTTTATGTTGAGCGGTATTCCTGGAGTCAGCTTAAAAAGCTGCTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTTTTATGTTGAGCGGTATTCCTGGAGTCAGCTTAAAAAGCTGCTTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATACCAGAAAATATCATGGCTACATGATGGCTAAGGCACCACATGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATACCAGAAAATATCATGGCTACATGATGGCTAAGGCACCACATGATTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGTTTGTGAAGAGGAATGATCCAGATGGACCTCATTCAGACAGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGTTTGTGAAGAGGAATGATCCAGATGGACCTCATTCAGACAGAATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTACCTTG         CCATGTCTGGTGAGAACAGAGAAAATACACTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTACCTTGGTG...TAGCCATGTCTGGTGAGAACAGAGAAAATACACTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTTTATTCTGAAATTCCCAAAACTATCAATAGAGCAGCAGTCTTAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105231 TTTTATTCTGAAATTCCCAAAACTATCAATAGAGCAGCAGTCTTAATGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTCTTGGAAGCCTCTTTTGGATCTTTTTCAG         GCAACACTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 105281 CTCTTGGAAGCCTCTTTTGGATCTTTTTCAGGTA...TAGGCAACACTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTATGGAATGTATTCTCGAGAAGAAGAACTATTAAGAGAAAGAAAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111785 ACTATGGAATGTATTCTCGAGAAGAAGAACTATTAAGAGAAAGAAAACGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATTGGAACAGTCGGAATTGCTTCTTACGATTATCACCAAGGAAGTGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 111835 ATTGGAACAGTCGGAATTGCTTCTTACGATTATCACCAAGGAAGTGGAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ATTTCTGTTTCAAGCCGGTAGTGGAATTTATCACGTAAAAGATGGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111885 ATTTCTGTTTCAAGCCGGTAGTGGAATTTATCACGTAAAAGATGGAGGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CACAAGGATTTACG         CAACAACCTTTAAGGCCCAATCTAGTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 111935 CACAAGGATTTACGGTA...TAGCAACAACCTTTAAGGCCCAATCTAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAAACTAGTTGTCCCAACATACGGATGGATCCAAAATTATGCCCTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114549 GAAACTAGTTGTCCCAACATACGGATGGATCCAAAATTATGCCCTGCTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCCAGACTGGATTGCTTTTATACATGGCAACGATATTTGGATATCTAACA
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 114599 TCCAGACTGGATTGCTTTTATACATAGCAACGATATTTGGATATCTAACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCGTAACCAGAGAAGAAAGGAGACTCACTTATGTGCACAATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 114649 TCGTAACCAGAGAAGAAAGGAGACTCACTTATGTGCACAATGGTA...TA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    716  AGCTAGCCAACATGGAAGAAGATGCCAGATCAGCTGGAGTCGCTACCTT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122254 GAGCTAGCCAACATGGAAGAAGATGCCAGATCAGCTGGAGTCGCTACCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGTTCTCCAAGAAGAATTTGATAGATATTCTGGCTATTGGTGGTGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122304 TGTTCTCCAAGAAGAATTTGATAGATATTCTGGCTATTGGTGGTGTCCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AAGCTGAAACAA         CTCCCAGTGGTGGTAAAATTCTTAGAATT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 122354 AAGCTGAAACAAGTA...AAGCTCCCAGTGGTGGTAAAATTCTTAGAATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTATATGAAGAAAATGATGAATCTGAGGTGGAAATTATTCATGTTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124765 CTATATGAAGAAAATGATGAATCTGAGGTGGAAATTATTCATGTTACATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCCTATGTTGGAAACAAGGAGGGCAGATTCATTCCGTTATCCTAAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124815 CCCTATGTTGGAAACAAGGAGGGCAGATTCATTCCGTTATCCTAAAACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956          GTACAGCAAATCCTAAAGTCACTTTTAAGATGTCAGAAATA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124865 GTA...AAGGTACAGCAAATCCTAAAGTCACTTTTAAGATGTCAGAAATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ATGATTGATGCTGAAGGAAGG         ATCATAGATGTCATAGATAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 127435 ATGATTGATGCTGAAGGAAGGGTA...TAGATCATAGATGTCATAGATAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGAACTAATTCAACCTTTTGAGATTCTATTTGAAGGAGTTGAATATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130959 GGAACTAATTCAACCTTTTGAGATTCTATTTGAAGGAGTTGAATATATTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CCAGAGCTGGATGGACTCCTGAGGGAAAATA         TGCTTGGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 131009 CCAGAGCTGGATGGACTCCTGAGGGAAAATAGTG...TAGTGCTTGGTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ATCCTACTAGATCGCTCCCAGACTCGCCTACAGATAGTGTTGATCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132165 ATCCTACTAGATCGCTCCCAGACTCGCCTACAGATAGTGTTGATCTCACC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGAATTATTTATCCCAGTAGAAGATGATGTTATGGAAAGGCAGAGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132215 TGAATTATTTATCCCAGTAGAAGATGATGTTATGGAAAGGCAGAGACTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TTGAGTCAGTGCCTGATTCTGTGACGCCACTAATTATCTATGAAGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132265 TTGAGTCAGTGCCTGATTCTGTGACGCCACTAATTATCTATGAAGAAACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ACAGACATCTGGATAAAT         ATCCATGACATCTTTCATGTTTT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 132315 ACAGACATCTGGATAAATGTA...CAGATCCATGACATCTTTCATGTTTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TCCCCAAAGTCACGAAGAGGAAATTGAGTTTATTTTTGCCTCTGAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133538 TCCCCAAAGTCACGAAGAGGAAATTGAGTTTATTTTTGCCTCTGAATGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AAACAGGTTTCCGTCATTTATACAAAATTACATCTATTTTAAAGGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133588 AAACAGGTTTCCGTCATTTATACAAAATTACATCTATTTTAAAGGAAAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 AAATATAAACGATCCAGTGGTGGGCTGCCTGCTCCAA         GTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 133638 AAATATAAACGATCCAGTGGTGGGCTGCCTGCTCCAAGTA...CAGGTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TTTCAAGTGTCCTATCAAAGAGGAGATAGCAATTACCAGTGGTGAATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138270 TTTCAAGTGTCCTATCAAAGAGGAGATAGCAATTACCAGTGGTGAATGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AAGTTCTTGGCCGGCATGGATCTAAT         ATCCAAGTTGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 138320 AAGTTCTTGGCCGGCATGGATCTAATGTA...CAGATCCAAGTTGATGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GTCAGAAGGCTGGTATATTTTGAAGGCACCAAAGACTCCCCTTTAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145346 GTCAGAAGGCTGGTATATTTTGAAGGCACCAAAGACTCCCCTTTAGAGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TCACCTGTACGTAGTCAGTTACGTAAATCCTGGAGAGGTGACAAGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145396 TCACCTGTACGTAGTCAGTTACGTAAATCCTGGAGAGGTGACAAGGCTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CTGACCGTGGCTACTCACATTCTTGCTGCATCAGTCAG         CAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 145446 CTGACCGTGGCTACTCACATTCTTGCTGCATCAGTCAGGTA...TAGCAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 TGTGACTTCTTTATAAGTAAGTATAGTAACCAGAAGAATCCACACTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145744 TGTGACTTCTTTATAAGTAAGTATAGTAACCAGAAGAATCCACACTGTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GTCCCTTTACAAGCTATCAAGTCCTGAAGATGACCCAACTTGCAAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145794 GTCCCTTTACAAGCTATCAAGTCCTGAAGATGACCCAACTTGCAAAACAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AGGAATTTTGGGCCACCATTTTGGATTCAGCAG         GTCCTCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 145844 AGGAATTTTGGGCCACCATTTTGGATTCAGCAGGTA...CAGGTCCTCTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CCTGACTATACTCCTCCAGAAATTTTCTCTTTTGAAAGTACTACTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148656 CCTGACTATACTCCTCCAGAAATTTTCTCTTTTGAAAGTACTACTGGATT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TACATTGTATGGGATGCTCTACAAGCCTCATGATCTACAGCCTGGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148706 TACATTGTATGGGATGCTCTACAAGCCTCATGATCTACAGCCTGGAAAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 AATATCCTACTGTGCTGTTCATATATGGTGGTCCTCAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 148756 AATATCCTACTGTGCTGTTCATATATGGTGGTCCTCAGGTG...CAGGTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 CAGTTGGTGAATAATCGGTTTAAAGGAGTCAAGTATTTCCGCTTGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156186 CAGTTGGTGAATAATCGGTTTAAAGGAGTCAAGTATTTCCGCTTGAATAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CCTAGCCTCTCTAGGTTATGTGGTTGTAGTGATAGACAACAGGGGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156236 CCTAGCCTCTCTAGGTTATGTGGTTGTAGTGATAGACAACAGGGGATCCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 GTCACCGAGGGCTTAAATTTGAAGGCGCCTTTAAATATAAAATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 156286 GTCACCGAGGGCTTAAATTTGAAGGCGCCTTTAAATATAAAATGGTG...

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2119    GGTCAAATAGAAATTGACGATCAGGTGGAAGGACTCCAATATCTAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158136 CAGGGTCAAATAGAAATTGACGATCAGGTGGAAGGACTCCAATATCTAGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 TTCTCGATATGATTTCATTGACTTAGATCGTGTGGGCATCCACGGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158186 TTCTCGATATGATTTCATTGACTTAGATCGTGTGGGCATCCACGGCTGGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 CCTATGGAGGATACCTCTCCCTGATGGCATTAATGCAGAGGTCAGATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158236 CCTATGGAGGATACCTCTCCCTGATGGCATTAATGCAGAGGTCAGATATC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 TTCAGG         GTTGCTATTGCTGGGGCCCCAGTCACTCTGTGGAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158286 TTCAGGGTA...CAGGTTGCTATTGCTGGGGCCCCAGTCACTCTGTGGAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 CTTCTATGATACAGGATACACGGAACGTTATATGGGTCACCCTGACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160487 CTTCTATGATACAGGATACACGGAACGTTATATGGGTCACCCTGACCAGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 ATGAACAGGGCTATTACTTAGGATCTGTGGCCATGCAAGCAGAAAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160537 ATGAACAGGGCTATTACTTAGGATCTGTGGCCATGCAAGCAGAAAAGTTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 CCCTCTGA         ACCAAATCGTTTACTGCTCTTACATGGTTTCCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 160587 CCCTCTGAGTA...CAGACCAAATCGTTTACTGCTCTTACATGGTTTCCT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 GGATGAGAATGTCCATTTTGCACATACCAGTATATTACTGAGTTTTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161477 GGATGAGAATGTCCATTTTGCACATACCAGTATATTACTGAGTTTTTTAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 TGAGGGCTGGAAAGCCATATGATTTACAG         ATCTATCCTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 161527 TGAGGGCTGGAAAGCCATATGATTTACAGGTG...AAGATCTATCCTCAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 GAGAGACACAGCATAAGAGTTCCTGAATCGGGAGAACATTATGAACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165560 GAGAGACACAGCATAAGAGTTCCTGAATCGGGAGAACATTATGAACTGCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 TCTTTTGCACTACCTTCAAGAAAACCTTGGATCACGTATTGCTGCTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165610 TCTTTTGCACTACCTTCAAGAAAACCTTGGATCACGTATTGCTGCTCTAA

   2800     .
   2639 AAGTGATA
        ||||||||
 165660 AAGTGATA