seq1 = pF1KE6701.tfa, 1923 bp
seq2 = pF1KE6701/gi568815575r_111146580.tfa (gi568815575r:111146580_111363936), 217357 bp

>pF1KE6701 1923
>gi568815575r:111146580_111363936 (ChrX)

(complement)

1-165  (100001-100165)   100% ->
166-297  (109534-109665)   100% ->
298-506  (110721-110929)   100% ->
507-699  (111438-111630)   100% ->
700-893  (112195-112388)   100% ->
894-971  (112651-112728)   100% ->
972-1158  (112834-113020)   100% ->
1159-1281  (114880-115002)   100% ->
1282-1484  (115166-115368)   100% ->
1485-1606  (115945-116066)   100% ->
1607-1743  (116433-116569)   100% ->
1744-1923  (117178-117357)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTCCTCCTCTGAAGCTCTTCAAAAACCAGAAATACCAGGAACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTCCTCCTCTGAAGCTCTTCAAAAACCAGAAATACCAGGAACTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGGAATGCATCAAAGACAGCAGACTTTTCTGTGATCCAACATTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGGAATGCATCAAAGACAGCAGACTTTTCTGTGATCCAACATTTCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGAGAATGATTCTCTTTTCTACAACCGACTGCTTCCTGGAAAGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGAGAATGATTCTCTTTTCTACAACCGACTGCTTCCTGGAAAGGTGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGAAACGTCCCCAG         GACATCTGTGATGACCCCCATCTGAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGAAACGTCCCCAGGTA...TAGGACATCTGTGATGACCCCCATCTGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTGGGCAACATTAGCAACCACCAGCTGACCCAAGGGAGACTGGGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109560 TGTGGGCAACATTAGCAACCACCAGCTGACCCAAGGGAGACTGGGGCACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCCAATGGTTTCTGCATTTTCCTGTTTGGCTGTTCAGGAGTCTCATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109610 AGCCAATGGTTTCTGCATTTTCCTGTTTGGCTGTTCAGGAGTCTCATTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACAAAG         ACAATTCCCAACCATAAGGAACAGGAATGGGACCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109660 ACAAAGGTA...TAGACAATTCCCAACCATAAGGAACAGGAATGGGACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCAAAAAACAGAAAAATACGCTGGGATATTTCACTTTCGTTTCTGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110756 TCAAAAAACAGAAAAATACGCTGGGATATTTCACTTTCGTTTCTGGCATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGGAGAATGGACTGAAGTGGTGATTGATGACTTGTTGCCCACCATTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110806 TTGGAGAATGGACTGAAGTGGTGATTGATGACTTGTTGCCCACCATTAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGAGATCTGGTCTTCTCTTTCTCCACTTCCATGAATGAGTTTTGGAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110856 GGAGATCTGGTCTTCTCTTTCTCCACTTCCATGAATGAGTTTTGGAATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TCTGCTGGAAAAAGCTTATGCAAA         GCTGCTAGGCTGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 110906 TCTGCTGGAAAAAGCTTATGCAAAGTA...CAGGCTGCTAGGCTGTTATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGCCCTGGATGGTTTGACCATCACTGATATTATTGTGGACTTCACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111455 AGGCCCTGGATGGTTTGACCATCACTGATATTATTGTGGACTTCACGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACATTGGCTGAAACTGTTGACATGCAGAAAGGAAGATACACTGAGCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111505 ACATTGGCTGAAACTGTTGACATGCAGAAAGGAAGATACACTGAGCTTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGAGGAGAAGTACAAGCTATTCGGAGAACTGTACAAAACATTTACCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111555 TGAGGAGAAGTACAAGCTATTCGGAGAACTGTACAAAACATTTACCAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GTGGTCTGATCTGCTGTTCCATTGAG         TCTCCCAATCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 111605 GTGGTCTGATCTGCTGTTCCATTGAGGTT...CAGTCTCCCAATCAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAGCAAGAAGTTGAAACTGATTGGGGTCTGCTGAAGGGCCATACCTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112210 GAGCAAGAAGTTGAAACTGATTGGGGTCTGCTGAAGGGCCATACCTATAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CATGACTGATATTCGCAAAATTCGTCTTGGAGAGAGACTTGTGGAAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112260 CATGACTGATATTCGCAAAATTCGTCTTGGAGAGAGACTTGTGGAAGTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TCAGTGCTGAGAAGGTGTATATGGTTCGCCTGAGAAACCCCTTGGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112310 TCAGTGCTGAGAAGGTGTATATGGTTCGCCTGAGAAACCCCTTGGGAAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CAGGAATGGAGTGGCCCCTGGAGTGAAAT         TTCTGAAGAGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 112360 CAGGAATGGAGTGGCCCCTGGAGTGAAATGTG...CAGTTCTGAAGAGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCAGCAACTGACTGCATCAGATCGCAAGAACCTGGGGCTTGTTATGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112663 GCAGCAACTGACTGCATCAGATCGCAAGAACCTGGGGCTTGTTATGTCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ATGATGGAGAGTTTTG         GATGAGCTTGGAGGACTTTTGCCGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 112713 ATGATGGAGAGTTTTGGTG...CAGGATGAGCTTGGAGGACTTTTGCCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AACTTTCACAAACTGAATGTCTGCCGCAATGTGAACAACCCTATTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112859 AACTTTCACAAACTGAATGTCTGCCGCAATGTGAACAACCCTATTTTTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCGAAAGGAGCTGGAATCGGTGTTGGGATGCTGGACTGTGGATGATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112909 CCGAAAGGAGCTGGAATCGGTGTTGGGATGCTGGACTGTGGATGATGATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCCTGATGAACCGCTCAGGAGGCTGCTATAACAACCGTGATACCTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112959 CCCTGATGAACCGCTCAGGAGGCTGCTATAACAACCGTGATACCTTCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CAGAATCCCCAG         TACATCTTCACTGTGCCTGAGGATGGGCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113009 CAGAATCCCCAGGTT...TAGTACATCTTCACTGTGCCTGAGGATGGGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CAAGGTCATTATGTCACTGCAGCAGAAGGACCTGCGCACTTACCGCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114909 CAAGGTCATTATGTCACTGCAGCAGAAGGACCTGCGCACTTACCGCCGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TGGGAAGACCTGACAATTACATCATTGGCTTTGAGCTCTTCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 114959 TGGGAAGACCTGACAATTACATCATTGGCTTTGAGCTCTTCAAGGTA...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1282    GTGGAGATGAACCGCAAATTCCGCCTCCACCACCTCTACATCCAGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115163 CAGGTGGAGATGAACCGCAAATTCCGCCTCCACCACCTCTACATCCAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GCGTGCTGGGACTTCCACCTATATTGACACCCGCACAGTGTTTCTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115213 GCGTGCTGGGACTTCCACCTATATTGACACCCGCACAGTGTTTCTGAGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AGTACCTGAAGAAGGGCAACTATGTGCTTGTCCCAACCATGTTCCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115263 AGTACCTGAAGAAGGGCAACTATGTGCTTGTCCCAACCATGTTCCAGCAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GGTCGCACCAGCGAGTTTCTCCTGAGAATCTTCTCTGAAGTGCCTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115313 GGTCGCACCAGCGAGTTTCTCCTGAGAATCTTCTCTGAAGTGCCTGTCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GCTCAG         GGAACTGACTCTGGACATGCCCAAAATGTCCTGCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115363 GCTCAGGTT...TAGGGAACTGACTCTGGACATGCCCAAAATGTCCTGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 GGAACCTGGCTCGTGGCTACCCGAAAGTAGTTACTCAGATCACTGTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115980 GGAACCTGGCTCGTGGCTACCCGAAAGTAGTTACTCAGATCACTGTTCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 AGTGCTGAGGACCTGGAGAAGAAGTATGCCAATGAAA         CTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 116030 AGTGCTGAGGACCTGGAGAAGAAGTATGCCAATGAAAGTA...CAGCTGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 AAACCCATATTTGGTCATCAAATGTGGAAAGGAGGAAGTCCGTTCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116437 AAACCCATATTTGGTCATCAAATGTGGAAAGGAGGAAGTCCGTTCTCCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TCCAGAAGAATACAGTTCATGCCATTTTTGACACCCAGGCCATTTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116487 TCCAGAAGAATACAGTTCATGCCATTTTTGACACCCAGGCCATTTTCTAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 AGAAGGACCACTGACATTCCTATTATAGTACAG         GTCTGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 116537 AGAAGGACCACTGACATTCCTATTATAGTACAGGTA...CAGGTCTGGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CAGCCGAAAATTCTGTGATCAGTTCTTGGGGCAGGTTACTCTGGATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117186 CAGCCGAAAATTCTGTGATCAGTTCTTGGGGCAGGTTACTCTGGATGCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 ACCCCAGCGACTGCCGTGATCTGAAGTCTCTGTACCTGCGTAAGAAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117236 ACCCCAGCGACTGCCGTGATCTGAAGTCTCTGTACCTGCGTAAGAAGGGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GGTCCAACTGCCAAAGTCAAGCAAGGCCACATCAGCTTCAAGGTTATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117286 GGTCCAACTGCCAAAGTCAAGCAAGGCCACATCAGCTTCAAGGTTATTTC

   2000     .    :    .    :
   1902 CAGCGATGATCTCACTGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||
 117336 CAGCGATGATCTCACTGAGCTC