seq1 = pF1KE6693.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KE6693/gi568815575r_64124338.tfa (gi568815575r:64124338_64325650), 201313 bp

>pF1KE6693 954
>gi568815575r:64124338_64325650 (ChrX)

(complement)

1-823  (100001-100823)   100% ->
824-954  (101183-101313)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGAATAGTTCTCCAATTAGCCAAGATGAACCTCATGGACATCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGAATAGTTCTCCAATTAGCCAAGATGAACCTCATGGACATCACCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATCTTCTCCCTCCTGCAGCCCGACAAGGAGGAGGAGGACACTGACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATCTTCTCCCTCCTGCAGCCCGACAAGGAGGAGGAGGACACTGACACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAGAAGCAGGCTCTCAATCAAGCAGTGTATGACAACGACTCCTATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAGAAGCAGGCTCTCAATCAAGCAGTGTATGACAACGACTCCTATACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGACCAGCTTTTGCGCCAGGAGCGTTACAAACGTTTCATCAACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGACCAGCTTTTGCGCCAGGAGCGTTACAAACGTTTCATCAACAGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGTGGCTGGGGTGTTCCTGGGACACCCTTGCGCTTGGCTGCTTCTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAGTGGCTGGGGTGTTCCTGGGACACCCTTGCGCTTGGCTGCTTCTTATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCACTTGAGCTGTTTGCAAGTCCTCTTAGCCCATGGTGCTGATGTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCACTTGAGCTGTTTGCAAGTCCTCTTAGCCCATGGTGCTGATGTTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCTTGGATGTCAAGGCACAGACGCCACTTTTCACTGCTGTCAGTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCTTGGATGTCAAGGCACAGACGCCACTTTTCACTGCTGTCAGTCATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCATCTGGACTGTGTACGTGTGCTTTTGGAAGCTGGTGCCTCTCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCATCTGGACTGTGTACGTGTGCTTTTGGAAGCTGGTGCCTCTCCTGGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTAGCATCTACAACAACTGTTCTCCCGTGCTCACAGCTGCCCGTGATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTAGCATCTACAACAACTGTTCTCCCGTGCTCACAGCTGCCCGTGATGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGTTGCTATCCTGCAGGAGCTCCTAGACCATGGTGCAGAGGCCAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTGTTGCTATCCTGCAGGAGCTCCTAGACCATGGTGCAGAGGCCAACGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAAAGCTAAACTACCAGTCTGGGCATCAAACATAGCTTCATGTTCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAAAGCTAAACTACCAGTCTGGGCATCAAACATAGCTTCATGTTCTGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCTCTATTTGGCCGCAGTCTACGGGCACCTGGACTGTTTCCGCCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCTCTATTTGGCCGCAGTCTACGGGCACCTGGACTGTTTCCGCCTGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTGCTCCACGGGGCAGACCCTGACTACAACTGCACTGACCAGGGCCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTGCTCCACGGGGCAGACCCTGACTACAACTGCACTGACCAGGGCCTATT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCTCGTGTCCCAAGACCCCGCACCCTCCTTGAAATCTGCCTCCATCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCTCGTGTCCCAAGACCCCGCACCCTCCTTGAAATCTGCCTCCATCATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATTGTGAGCCAGAGTATATCCAGCTGTTAATCGATTTTGGTGCTAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATTGTGAGCCAGAGTATATCCAGCTGTTAATCGATTTTGGTGCTAATATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TACCTTCCATCTCTCTCCCTTGACCTGACCTCACAAGATGATAAAGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TACCTTCCATCTCTCTCCCTTGACCTGACCTCACAAGATGATAAAGGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGCATTGCTGCTACAGGCCCGAG         CCACTCCACGGTCACTTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100801 TGCATTGCTGCTACAGGCCCGAGGTG...TAGCCACTCCACGGTCACTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TATCACAGGTCCGTTTAGTCGTCCGCAGAGCCTTGTGCCAGGCTGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TATCACAGGTCCGTTTAGTCGTCCGCAGAGCCTTGTGCCAGGCTGGCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CCACAAGCCATCAACCAGCTGGATATTCCTCCCATGTTGATTAGCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CCACAAGCCATCAACCAGCTGGATATTCCTCCCATGTTGATTAGCTACCT

    950     .    :
    942 AAAACACCAACTG
        |||||||||||||
 101301 AAAACACCAACTG