seq1 = pF1KE6691.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KE6691/gi568815575r_120526213.tfa (gi568815575r:120526213_120727166), 200954 bp

>pF1KE6691 954
>gi568815575r:120526213_120727166 (ChrX)

(complement)

1-954  (100001-100954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTTCTGAAAGCAGCTCCTTTTTGAAGGGTGTGATGCTTGGAAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTTTCTGAAAGCAGCTCCTTTTTGAAGGGTGTGATGCTTGGAAGCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTCTGTGCTTTGATCACTATGCTAGGACACATTAGGATTGGTCATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTCTGTGCTTTGATCACTATGCTAGGACACATTAGGATTGGTCATGGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATAGAATGCACCACCATGAGCATCATCACCTACAAGCTCCTAACAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATAGAATGCACCACCATGAGCATCATCACCTACAAGCTCCTAACAAAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATATCTTGAAAATTTCAGAGGATGAGCGCATGGAGCTCAGTAAGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATATCTTGAAAATTTCAGAGGATGAGCGCATGGAGCTCAGTAAGAGCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCGAGTATACTGTATTATCCTTGTAAAACCCAAAGATGTGAGTCTTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCGAGTATACTGTATTATCCTTGTAAAACCCAAAGATGTGAGTCTTTGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGCAGTAAAGGAGACTTGGACCAAACACTGTGACAAAGCAGAGTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGCAGTAAAGGAGACTTGGACCAAACACTGTGACAAAGCAGAGTTCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGTTCTGAAAATGTTAAAGTGTTTGAGTCAATTAATATGGACACAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGTTCTGAAAATGTTAAAGTGTTTGAGTCAATTAATATGGACACAAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGTGGTTAATGATGAGAAAAGCTTACAAATACGCCTTTGATAAGTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGTGGTTAATGATGAGAAAAGCTTACAAATACGCCTTTGATAAGTATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAGACCAATACAACTGGTTCTTCCTTGCACGCCCCACTACGTTTGCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GAGACCAATACAACTGGTTCTTCCTTGCACGCCCCACTACGTTTGCTATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATTGAAAACCTAAAGTATTTTTTGTTAAAAAAGGATCCATCACAGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATTGAAAACCTAAAGTATTTTTTGTTAAAAAAGGATCCATCACAGCCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTATCTAGGCCACACTATAAAATCTGGAGACCTTGAATATGTGGGTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTATCTAGGCCACACTATAAAATCTGGAGACCTTGAATATGTGGGTATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGGAGGAATTGTCTTAAGTGTAGAATCAATGAAAAGACTTAACAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAGGAGGAATTGTCTTAAGTGTAGAATCAATGAAAAGACTTAACAGCCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCAATATCCCAGAAAAGTGTCCTGAACAGGGAGGGATGATTTGGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCAATATCCCAGAAAAGTGTCCTGAACAGGGAGGGATGATTTGGAAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATCTGAAGATAAACAGCTAGCAGTTTGCCTGAAATATGCTGGAGTATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ATCTGAAGATAAACAGCTAGCAGTTTGCCTGAAATATGCTGGAGTATTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAGAAAATGCAGAAGATGCTGATGGAAAAGATGTATTTAATACCAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CAGAAAATGCAGAAGATGCTGATGGAAAAGATGTATTTAATACCAAATCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTTGGGCTTTCTATTAAAGAGGCAATGACTTATCACCCCAACCAGGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTTGGGCTTTCTATTAAAGAGGCAATGACTTATCACCCCAACCAGGTAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGAAGGCTGTTGTTCAGATATGGCTGTTACTTTTAATGGACTGACTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGAAGGCTGTTGTTCAGATATGGCTGTTACTTTTAATGGACTGACTCCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATCAGATGCATGTGATGATGTATGGGGTATACCGCCTTAGGGCATTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATCAGATGCATGTGATGATGTATGGGGTATACCGCCTTAGGGCATTTGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CATATTTTCAATGATGCATTGGTTTTCTTACCTCCAAATGGTTCTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CATATTTTCAATGATGCATTGGTTTTCTTACCTCCAAATGGTTCTGACAA

    950 
    951 TGAC
        ||||
 100951 TGAC