seq1 = pF1KE6687.tfa, 696 bp
seq2 = pF1KE6687/gi568815581f_56494224.tfa (gi568815581f:56494224_56694919), 200696 bp

>pF1KE6687 696
>gi568815581f:56494224_56694919 (Chr17)

1-696  (100001-100696)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCGCTGCCCCAGCCTAGGGGTCACCCTCTACGCCCTGGTGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCGCTGCCCCAGCCTAGGGGTCACCCTCTACGCCCTGGTGGTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGGGCTGCGGGCGACACCGGCCGGCGGCCAGCACTATCTCCACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGGGCTGCGGGCGACACCGGCCGGCGGCCAGCACTATCTCCACATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCCGGCACCCAGCGACAACCTGCCCCTGGTGGACCTCATCGAACACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCCGGCACCCAGCGACAACCTGCCCCTGGTGGACCTCATCGAACACCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACCCTATCTTTGACCCCAAGGAAAAGGATCTGAACGAGACGCTGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACCCTATCTTTGACCCCAAGGAAAAGGATCTGAACGAGACGCTGCTGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCGCTGCTCGGGGGCCACTACGACCCAGGCTTCATGGCCACCTCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCGCTGCTCGGGGGCCACTACGACCCAGGCTTCATGGCCACCTCGCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGAGGACCGGCCCGGCGGGGGCGGGGGTGCAGCTGGGGGCGCGGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGAGGACCGGCCCGGCGGGGGCGGGGGTGCAGCTGGGGGCGCGGAGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGCGGAGCTGGACCAGCTGCTGCGGCAGCGGCCGTCGGGGGCCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGCGGAGCTGGACCAGCTGCTGCGGCAGCGGCCGTCGGGGGCCATGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGCGAGATCAAAGGGCTAGAGTTCTCCGAGGGCTTGGCCCAGGGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAGCGAGATCAAAGGGCTAGAGTTCTCCGAGGGCTTGGCCCAGGGCAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCAGCGCCTAAGCAAGAAGCTGCGGAGGAAGTTACAGATGTGGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCAGCGCCTAAGCAAGAAGCTGCGGAGGAAGTTACAGATGTGGCTGTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCGCAGACATTCTGCCCCGTGCTGTACGCGTGGAACGACCTGGGCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCGCAGACATTCTGCCCCGTGCTGTACGCGTGGAACGACCTGGGCAGCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTTTGGCCGCGCTACGTGAAGGTGGGCAGCTGCTTCAGTAAGCGCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTTTGGCCGCGCTACGTGAAGGTGGGCAGCTGCTTCAGTAAGCGCTCGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCTCCGTGCCCGAGGGCATGGTGTGCAAGCCGTCCAAGTCCGTGCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTCCGTGCCCGAGGGCATGGTGTGCAAGCCGTCCAAGTCCGTGCACCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACGGTGCTGCGGTGGCGCTGTCAGCGGCGCGGGGGCCAGCGCTGCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACGGTGCTGCGGTGGCGCTGTCAGCGGCGCGGGGGCCAGCGCTGCGGCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    651 GATTCCCATCCAGTACCCCATCATTTCCGAGTGCAAGTGCTCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GATTCCCATCCAGTACCCCATCATTTCCGAGTGCAAGTGCTCGTGC