seq1 = pF1KE6685.tfa, 687 bp
seq2 = pF1KE6685/gi568815581r_63829229.tfa (gi568815581r:63829229_64032261), 203033 bp

>pF1KE6685 687
>gi568815581r:63829229_64032261 (Chr17)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-118  (100877-100927)   100% ->
119-430  (101877-102188)   99% ->
431-549  (102374-102492)   100% ->
550-591  (102787-102828)   100% ->
592-687  (102938-103033)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGGCTGGCGTTGTCTCCTGTGCCCAGCCACTGGATGGTGGCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGGCTGGCGTTGTCTCCTGTGCCCAGCCACTGGATGGTGGCGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGCTGCTCTCAG         CTGAGCCAGTACCAGCAGCCAGAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCTGCTGCTCTCAGGTA...CAGCTGAGCCAGTACCAGCAGCCAGAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGGAGGACCGGTACCGGAATCCCAAAG         GTAGTGCTTGTTCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100901 CGGAGGACCGGTACCGGAATCCCAAAGGTC...CAGGTAGTGCTTGTTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CGGATCTGGCAGAGCCCACGTTTCATAGCCAGGAAACGGGGCTTCACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101891 CGGATCTGGCAGAGCCCACGTTTCATAGCCAGGAAACGGGGCTTCACGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAAAATGCACTGCTACATGAACAGCGCCTCCGGCAATGTGAGCTGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101941 GAAAATGCACTGCTACATGAACAGCGCCTCCGGCAATGTGAGCTGGCTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGAAGCAGGAGATGGACGAGAATCCCCAGCAGCTGAAGCTGGAAAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101991 GGAAGCAGGAGATGGACGAGAATCCCCAGCAGCTGAAGCTGGAAAAGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGCATGGAAGAGTCCCAGAACGAATCTCTCGCCACCCTCACCATCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102041 CGCATGGAAGAGTCCCAGAACGAATCTCTCGCCACCCTCACCATCCAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATCCGGTTTGAGGACAATGGCATCTACTTCTGCCAGCAGAAGTGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 102091 CATCCGGTTTGAGGACAATGGCATCTACTTCTGTCAGCAGAAGTGCAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACACCTCGGAGGTCTACCAGGGCTGCGGCACAGAGCTGCGAGTCATGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 102141 ACACCTCGGAGGTCTACCAGGGCTGCGGCACAGAGCTGCGAGTCATGGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    431        GATTCAGCACCTTGGCACAGCTGAAGCAGAGGAACACGCTGAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102191 G...CAGGATTCAGCACCTTGGCACAGCTGAAGCAGAGGAACACGCTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGATGGTATCATCATGATCCAGACGCTGCTGATCATCCTCTTCATCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102417 GGATGGTATCATCATGATCCAGACGCTGCTGATCATCCTCTTCATCATCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGCCTATCTTCCTGCTGCTGGACAAG         GATGACAGCAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102467 TGCCTATCTTCCTGCTGCTGGACAAGGTG...CAGGATGACAGCAAGGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGCATGGAGGAAGATCACACCTACGAG         GGCCTGGACATTGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102802 GGCATGGAGGAAGATCACACCTACGAGGTA...CAGGGCCTGGACATTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCAGACAGCCACCTATGAGGACATAGTGACGCTGCGGACAGGGGAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102952 CCAGACAGCCACCTATGAGGACATAGTGACGCTGCGGACAGGGGAAGTGA

    700     .    :    .    :    .    :
    656 AGTGGTCTGTAGGTGAGCACCCAGGCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 103002 AGTGGTCTGTAGGTGAGCACCCAGGCCAGGAG