seq1 = pF1KE6682.tfa, 942 bp
seq2 = pF1KE6682/gi568815591f_91841100.tfa (gi568815591f:91841100_92095812), 254713 bp

>pF1KE6682 942
>gi568815591f:91841100_92095812 (Chr7)

1-48  (100001-100048)   100% ->
49-306  (132612-132869)   100% ->
307-351  (139190-139234)   100% ->
352-405  (151059-151112)   100% ->
406-576  (151786-151956)   100% ->
577-732  (153522-153677)   100% ->
733-942  (154504-154713)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGACGAGGAGAGACAGAAGAAGCTGGAGGCCGGCAAAGCCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100001 ATGGAGGACGAGGAGAGACAGAAGAAGCTGGAGGCCGGCAAAGCCAAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     49        CTTGCCCAGTTTCGACAAAGAAAAGCTCAGTCGGATGGGCAGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 A...TAGCTTGCCCAGTTTCGACAAAGAAAAGCTCAGTCGGATGGGCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTCCTTCCAAGAAGCAGAAAAAAAAGAGAAAAACGTCAAGCAGTAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132655 GTCCTTCCAAGAAGCAGAAAAAAAAGAGAAAAACGTCAAGCAGTAAACAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATGTGTCAGCACACCATGATTTGAATATTGATCAATCACAGTGTAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132705 GATGTGTCAGCACACCATGATTTGAATATTGATCAATCACAGTGTAATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATGTACATAAATAGTTCTCAGAGAGTAGAATCAACTGTGATTCCTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132755 AATGTACATAAATAGTTCTCAGAGAGTAGAATCAACTGTGATTCCTGAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTACAATAATGAGAACTCTACATAGTGGAGAAATAACCAGTCATGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132805 CTACAATAATGAGAACTCTACATAGTGGAGAAATAACCAGTCATGAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCTTCTCTGTGGAA         CTGGAAAGTGAAATTTCAACCACAGC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 132855 GGCTTCTCTGTGGAAGTA...TAGCTGGAAAGTGAAATTTCAACCACAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGATGACTGCAGTTCAGAG         GTAAATGGTTGCAGTTTTGTGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 139216 AGATGACTGCAGTTCAGAGGTA...CAGGTAAATGGTTGCAGTTTTGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGAGAACAGGAAAGCCTACAAATTTATTAAGG         GAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 151081 TGAGAACAGGAAAGCCTACAAATTTATTAAGGGTA...TAGGAAGAAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TTTGGTGTTGATGATTCTTATTCTGAACAAGGAGCACAAGACAGTCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151795 TTTGGTGTTGATGATTCTTATTCTGAACAAGGAGCACAAGACAGTCCGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCATCTAGAGATGATGGAAAGTGAGTTGGCTGGGAAGCAGCATGAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151845 TCATCTAGAGATGATGGAAAGTGAGTTGGCTGGGAAGCAGCATGAGATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGAGCTAAACAGAGAGCTGGAAGAAATGAGGGTTACCTATGGGACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151895 AAGAGCTAAACAGAGAGCTGGAAGAAATGAGGGTTACCTATGGGACTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGACTGCAGCAG         TTACAAGAATTTGAAGCTGCCATTAAACA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 151945 GGACTGCAGCAGGTA...CAGTTACAAGAATTTGAAGCTGCCATTAAACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AAGAGATGGCATTATAACCCAGCTCACTGCTAATTTACAACAAGCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153551 AAGAGATGGCATTATAACCCAGCTCACTGCTAATTTACAACAAGCAAGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GAGAAAAGGATGAGACAATGAGAGAATTTTTAGAGTTGACAGAACAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153601 GAGAAAAGGATGAGACAATGAGAGAATTTTTAGAGTTGACAGAACAGAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CAAAAATTACAGATTCAATTTCAGCAA         TTACAGGCTAGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 153651 CAAAAATTACAGATTCAATTTCAGCAAGTA...CAGTTACAGGCTAGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AACTCTGAGAAACAGCACTCATAGTAGCACAGCTGCAGACTTACTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154518 AACTCTGAGAAACAGCACTCATAGTAGCACAGCTGCAGACTTACTACAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCAAACAACAGATCCTCACTCATCAACAGCAGCTTGAAGAACAAGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154568 CCAAACAACAGATCCTCACTCATCAACAGCAGCTTGAAGAACAAGACCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTATTAGAAGATTATCAGAAAAAGAAAGAAGACTTCACAATGCAAATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154618 TTATTAGAAGATTATCAGAAAAAGAAAGAAGACTTCACAATGCAAATTAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    897 TTTCTTGCAAGAGAAAATTAAAGTATATGAAATGGTATGTTTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154668 TTTCTTGCAAGAGAAAATTAAAGTATATGAAATGGTATGTTTATTT