seq1 = pF1KE6680.tfa, 1014 bp
seq2 = pF1KE6680/gi568815589r_94503384.tfa (gi568815589r:94503384_94739310), 235927 bp

>pF1KE6680 1014
>gi568815589r:94503384_94739310 (Chr9)

(complement)

1-170  (100001-100170)   100% ->
171-333  (118820-118982)   100% ->
334-426  (121451-121543)   100% ->
427-567  (129250-129390)   100% ->
568-705  (132359-132496)   100% ->
706-825  (133735-133854)   100% ->
826-1014  (135739-135927)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGACCAGGCGCCCTTCGACACGGACGTCAACACCCTGACCCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGACCAGGCGCCCTTCGACACGGACGTCAACACCCTGACCCGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTCATGGAGGAGGGCAGGAAGGCCCGCGGCACGGGCGAGTTGACCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGTCATGGAGGAGGGCAGGAAGGCCCGCGGCACGGGCGAGTTGACCCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTCAACTCGCTCTGCACAGCAGTCAAAGCCATCTCTTCGGCGGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTCAACTCGCTCTGCACAGCAGTCAAAGCCATCTCTTCGGCGGTGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGGCGGGCATCGCGCACCT         CTATGGCATTGCTGGTTCTAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100151 AAGGCGGGCATCGCGCACCTGTG...TAGCTATGGCATTGCTGGTTCTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACGTGACAGGTGATCAAGTTAAGAAGCTGGACGTCCTCTCCAACGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118841 CAACGTGACAGGTGATCAAGTTAAGAAGCTGGACGTCCTCTCCAACGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGTTATGAACATGTTAAAGTCATCCTTTGCCACGTGTGTTCTCGTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118891 TGGTTATGAACATGTTAAAGTCATCCTTTGCCACGTGTGTTCTCGTGTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAAGAAGATAAACACGCCATCATAGTGGAACCGGAGAAAAGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 118941 GAAGAAGATAAACACGCCATCATAGTGGAACCGGAGAAAAGGGTG...CA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    334  GGTAAATATGTGGTCTGTTTTGATCCCCTTGATGGATCTTCCAACATCG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121450 GGGTAAATATGTGGTCTGTTTTGATCCCCTTGATGGATCTTCCAACATCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATTGCCTTGTGTCCGTTGGAACCATTTTTGGCATCTATAGAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 121500 ATTGCCTTGTGTCCGTTGGAACCATTTTTGGCATCTATAGAAAGGTA...

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    427    AAATCAACTGATGAGCCTTCTGAGAAGGATGCTCTGCAACCAGGCCG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129247 TAGAAATCAACTGATGAGCCTTCTGAGAAGGATGCTCTGCAACCAGGCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAACCTGGTGGCAGCCGGCTACGCACTGTATGGCAGTGCCACCATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129297 GAACCTGGTGGCAGCCGGCTACGCACTGTATGGCAGTGCCACCATGCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCTTGCCATGGACTGTGGGGTCAACTGCTTCATGCTGGACCCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 129347 TCCTTGCCATGGACTGTGGGGTCAACTGCTTCATGCTGGACCCGGTG...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    568    GCCATCGGGGAGTTCATTTTGGTGGACAAGGATGTGAAGATAAAAAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132356 AAGGCCATCGGGGAGTTCATTTTGGTGGACAAGGATGTGAAGATAAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAAAGGTAAAATCTACAGCCTTAACGAGGGCTACGCCAGGGACTTTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132406 GAAAGGTAAAATCTACAGCCTTAACGAGGGCTACGCCAGGGACTTTGACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTGCCGTCACTGAGTACATCCAGAGGAAGAAGTTCCCCCCA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 132456 CTGCCGTCACTGAGTACATCCAGAGGAAGAAGTTCCCCCCAGTA...CAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GATAATTCAGCTCCTTATGGGGCCCGGTATGTGGGCTCCATGGTGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133735 GATAATTCAGCTCCTTATGGGGCCCGGTATGTGGGCTCCATGGTGGCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGTTCATCGCACTCTGGTCTACGGAGGGATATTTCTGTACCCCGCTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133785 TGTTCATCGCACTCTGGTCTACGGAGGGATATTTCTGTACCCCGCTAACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGAAGAGCCCCAATGGAAAG         CTGAGACTGCTGTACGAATGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 133835 AGAAGAGCCCCAATGGAAAGGTA...CAGCTGAGACTGCTGTACGAATGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AACCCCATGGCCTACGTCATGGAGAAGGCTGGGGGAATGGCCACCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135760 AACCCCATGGCCTACGTCATGGAGAAGGCTGGGGGAATGGCCACCACTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GAAGGAGGCCGTGTTAGACGTCATTCCCACAGACATTCACCAGAGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135810 GAAGGAGGCCGTGTTAGACGTCATTCCCACAGACATTCACCAGAGGGCGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CGGTGATCTTGGGATCCCCCGACGACGTGCTCGAGTTCCTGAAGGTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135860 CGGTGATCTTGGGATCCCCCGACGACGTGCTCGAGTTCCTGAAGGTGTAT

   1050     .    :    .
    997 GAGAAGCACTCTGCCCAG
        ||||||||||||||||||
 135910 GAGAAGCACTCTGCCCAG