seq1 = pF1KE6675.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE6675/gi568815575r_149391611.tfa (gi568815575r:149391611_149605137), 213527 bp

>pF1KE6675 936
>gi568815575r:149391611_149605137 (ChrX)

(complement)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-240  (100845-100981)   100% ->
241-418  (101649-101826)   100% ->
419-507  (104101-104189)   100% ->
508-708  (106831-107031)   100% ->
709-879  (108622-108792)   100% ->
880-936  (113471-113527)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCCACCCCGGACCGGCCGAGGCCTTCTCTGGCTGGGTCTGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCCACCCCGGACCGGCCGAGGCCTTCTCTGGCTGGGTCTGGTTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCTCCGTCTGCGTCGCCCTCGGATCCGAAACGCAGGCCAACTCGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCTCCGTCTGCGTCGCCCTCGGATCCGAAACGCAGGCCAACTCGACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAG         ATGCTCTGAACGTTCTTCTCATCATCGTGGATGACCTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGTG...TAGATGCTCTGAACGTTCTTCTCATCATCGTGGATGACCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGCCCCTCCCTGGGCTGTTATGGGGATAAGCTGGTGAGGTCCCCAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100883 CGCCCCTCCCTGGGCTGTTATGGGGATAAGCTGGTGAGGTCCCCAAATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGACCAACTGGCATCCCACAGCCTCCTCTTCCAGAATGCCTTTGCGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100933 TGACCAACTGGCATCCCACAGCCTCCTCTTCCAGAATGCCTTTGCGCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241         CAAGCAGTGTGCGCCCCGAGCCGCGTTTCTTTCCTCACTGGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100983 TA...CAGCAAGCAGTGTGCGCCCCGAGCCGCGTTTCTTTCCTCACTGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGGAGACCTGACACCACCCGCCTGTACGACTTCAACTCCTACTGGAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101691 AGGAGACCTGACACCACCCGCCTGTACGACTTCAACTCCTACTGGAGGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCACGCTGGAAACTTCTCCACCATCCCCCAGTACTTCAAGGAGAATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101741 GCACGCTGGAAACTTCTCCACCATCCCCCAGTACTTCAAGGAGAATGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGTGACCATGTCGGTGGGAAAAGTCTTTCACCCTG         GGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101791 ATGTGACCATGTCGGTGGGAAAAGTCTTTCACCCTGGTA...AAGGGATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCTTCTAACCATACCGATGATTCTCCGTATAGCTGGTCTTTTCCACCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104106 TCTTCTAACCATACCGATGATTCTCCGTATAGCTGGTCTTTTCCACCTTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCATCCTTCCTCTGAGAAGTATGAAAACACTAAG         ACATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 104156 TCATCCTTCCTCTGAGAAGTATGAAAACACTAAGGTA...AAGACATGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GAGGGCCAGATGGAGAACTCCATGCCAACCTGCTTTGCCCTGTGGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106838 GAGGGCCAGATGGAGAACTCCATGCCAACCTGCTTTGCCCTGTGGATGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGGATGTTCCCGAGGGCACCTTGCCTGACAAACAGAGCACTGAGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106888 CTGGATGTTCCCGAGGGCACCTTGCCTGACAAACAGAGCACTGAGCAAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CATACAGTTGTTGGAAAAGATGAAAACGTCAGCCAGTCCTTTCTTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106938 CATACAGTTGTTGGAAAAGATGAAAACGTCAGCCAGTCCTTTCTTCCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCGTTGGGTATCATAAGCCACACATCCCCTTCAGATACCCCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 106988 CCGTTGGGTATCATAAGCCACACATCCCCTTCAGATACCCCAAGGTG...

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    709    GAATTTCAGAAGTTGTATCCCTTGGAGAACATCACCCTGGCCCCCGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108619 AAGGAATTTCAGAAGTTGTATCCCTTGGAGAACATCACCCTGGCCCCCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCCCGAGGTCCCTGATGGCCTACCCCCTGTGGCCTACAACCCCTGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108669 TCCCGAGGTCCCTGATGGCCTACCCCCTGTGGCCTACAACCCCTGGATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACATCAGGCAACGGGAAGACGTCCAAGCCTTAAACATCAGTGTGCCGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108719 ACATCAGGCAACGGGAAGACGTCCAAGCCTTAAACATCAGTGTGCCGTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGTCCAATTCCTGTGGACTTTCAG         GAGGACCAAAGTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 108769 GGTCCAATTCCTGTGGACTTTCAGGTA...CAGGAGGACCAAAGTTCCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGGTTTCAGACTGAAGACTTCATCTACCAGAAAGTATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113488 AGGTTTCAGACTGAAGACTTCATCTACCAGAAAGTATAAG