seq1 = pF1KE6665.tfa, 870 bp
seq2 = pF1KE6665/gi568815590f_74251361.tfa (gi568815590f:74251361_74464364), 213004 bp

>pF1KE6665 870
>gi568815590f:74251361_74464364 (Chr8)

1-106  (100001-100106)   100% ->
107-280  (108777-108950)   100% ->
281-375  (110524-110618)   100% ->
376-490  (111579-111693)   100% ->
491-870  (112625-113004)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTTTGAACTCAACTGGAGAAGTGCCTGTCCTTATCCACGGGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGTTTGAACTCAACTGGAGAAGTGCCTGTCCTTATCCACGGGGAAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATAATTTGTGAGGCCACTCAGATCATTGATTATCTTGAACAGACTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATAATTTGTGAGGCCACTCAGATCATTGATTATCTTGAACAGACTTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGATG         AAAGAACACCCAGGTTAATGCCTGATAAAGAAAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGATGGTA...TAGAAAGAACACCCAGGTTAATGCCTGATAAAGAAAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGTATTACCCACGGGTACAACATTACCGAGAGCTGCTTGACTCCTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108812 ATGTATTACCCACGGGTACAACATTACCGAGAGCTGCTTGACTCCTTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATGGATGCCTATACACATGGCTGCATTTTACATCCTGAGTTAACTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108862 AATGGATGCCTATACACATGGCTGCATTTTACATCCTGAGTTAACTGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTCCATGATCCCGGCTTATGCAACTACAAGGATTCGTA         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 108912 ACTCCATGATCCCGGCTTATGCAACTACAAGGATTCGTAGTA...CAGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAAATTGGAAACACAGAGTCTGAGCTGAAGAAACTTGCTGAAGAAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110526 CAAATTGGAAACACAGAGTCTGAGCTGAAGAAACTTGCTGAAGAAAACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGATTTACAAGAAGCATACATTGCAAAACAGAAACGACTTAAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110576 AGATTTACAAGAAGCATACATTGCAAAACAGAAACGACTTAAAGTA...T

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    376   TCAAAGCTGCTTGATCATGACAATGTCAAGTATTTGAAGAAAATTCTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111577 AGTCAAAGCTGCTTGATCATGACAATGTCAAGTATTTGAAGAAAATTCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GATGAGTTGGAGAAAGTCTTGGATCAGGTTGAAACTGAATTGCAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111627 GATGAGTTGGAGAAAGTCTTGGATCAGGTTGAAACTGAATTGCAAAGAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAATGAAGAAACCCCAG         AAGAGGGCCAGCAACCTTGGCTCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 111677 AAATGAAGAAACCCCAGGTA...TAGAAGAGGGCCAGCAACCTTGGCTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCGGTGAATCCTTCACCCTGGCAGACGTCTCACTCGCTGTCACATTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112649 GCGGTGAATCCTTCACCCTGGCAGACGTCTCACTCGCTGTCACATTGCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CGACTGAAGTTCCTGGGGTTTGCAAGGAGAAACTGGGGAAACGGAAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112699 CGACTGAAGTTCCTGGGGTTTGCAAGGAGAAACTGGGGAAACGGAAAGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACCAAACTTGGAAACCTATTACGAGCGTGTCTTGAAGAGAAAAACATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112749 ACCAAACTTGGAAACCTATTACGAGCGTGTCTTGAAGAGAAAAACATTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACAAGGTTTTAGGACATGTCAACAATATATTAATCTCTGCAGTGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112799 ACAAGGTTTTAGGACATGTCAACAATATATTAATCTCTGCAGTGCTGCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACAGCATTCCGGGTGGCCAAGAAAAGGGCCCCAAAAGTTCTTGGCACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112849 ACAGCATTCCGGGTGGCCAAGAAAAGGGCCCCAAAAGTTCTTGGCACGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCTTGTGGTTGGTTTGCTTGCAGGAGTGGGATATTTTGCTTTTATGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112899 CCTTGTGGTTGGTTTGCTTGCAGGAGTGGGATATTTTGCTTTTATGCTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TCAGAAAGAGGCTTGGCAGCATGATATTAGCATTTAGACCCAGACCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112949 TCAGAAAGAGGCTTGGCAGCATGATATTAGCATTTAGACCCAGACCAAAT

    900     .
    865 TATTTC
        ||||||
 112999 TATTTC