seq1 = pF1KE6663.tfa, 855 bp
seq2 = pF1KE6663/gi568815592r_31627240.tfa (gi568815592r:31627240_31829161), 201922 bp

>pF1KE6663 855
>gi568815592r:31627240_31829161 (Chr6)

(complement)

1-297  (100001-100297)   100% ->
298-397  (100417-100516)   100% ->
398-471  (100638-100711)   100% ->
472-591  (100870-100989)   100% ->
592-741  (101470-101619)   100% ->
742-855  (101809-101922)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGACGCCGGGGGAGGGGCTGGGCCGCTGCTCCCATGCCCTGATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGACGCCGGGGGAGGGGCTGGGCCGCTGCTCCCATGCCCTGATCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGAGTCCCAGAGAGCCTGGCGTCGGGGGAAGGTGCGGGGGCTGGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGAGTCCCAGAGAGCCTGGCGTCGGGGGAAGGTGCGGGGGCTGGCCTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGCTCTGGATCTGGCCAAAGCTCAAAGGGAGCACGGGGTGCTGGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGCTCTGGATCTGGCCAAAGCTCAAAGGGAGCACGGGGTGCTGGGAGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAACTGAGGCAACGACTGGGGCTACAGCTGCTAGAACTGCCACCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAACTGAGGCAACGACTGGGGCTACAGCTGCTAGAACTGCCACCTGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTCATTGCCGCTGGGACCGCTGCTTGGCGACACGGCCGTGATCCAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTCATTGCCGCTGGGACCGCTGCTTGGCGACACGGCCGTGATCCAAGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACACGGCCCTAATCACGCGGCCCTGGAGCCCCGCTCGTAGGCCAGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100251 ACACGGCCCTAATCACGCGGCCCTGGAGCCCCGCTCGTAGGCCAGAGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    298       GTCGATGGAGTCCGCAAAGCCCTGCAAGACCTGGGGCTCCGAAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ...AAGGTCGATGGAGTCCGCAAAGCCCTGCAAGACCTGGGGCTCCGAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGTGGAAATAGGAGACGAGAACGCGACGCTGGATGGCACTGACGTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100461 TGTGGAAATAGGAGACGAGAACGCGACGCTGGATGGCACTGACGTTCTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCACCG         GCCGGGAGTTTTTCGTAGGCCTCTCCAAATGGACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100511 TCACCGGTG...CAGGCCGGGAGTTTTTCGTAGGCCTCTCCAAATGGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AATCACCGAGGAGCTGAGATCGTGGCGGACACGTTCCGG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100673 AATCACCGAGGAGCTGAGATCGTGGCGGACACGTTCCGGGTG...TAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTCGCCGTCTCCACTGTGCCAGTCTCGGGTCCCTCCCACCTGCGCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100872 CTTCGCCGTCTCCACTGTGCCAGTCTCGGGTCCCTCCCACCTGCGCGGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCTGCGGCATGGGGGGACCTCGCACTGTTGTGGCAGGCAGCAGCGACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100922 TCTGCGGCATGGGGGGACCTCGCACTGTTGTGGCAGGCAGCAGCGACGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCCCAAAAGGCTGTCCGG         GCAATGGCAGTGCTGACAGATCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100972 GCCCAAAAGGCTGTCCGGGTG...TAGGCAATGGCAGTGCTGACAGATCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCATATGCCTCCCTGACCCTCCCAGATGACGCAGCTGCTGACTGTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101493 CCCATATGCCTCCCTGACCCTCCCAGATGACGCAGCTGCTGACTGTCTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTCTTCGTCCTGGGTTGCCTGGTGTGCCCCCTTTCCTCCTGCACCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101543 TTCTTCGTCCTGGGTTGCCTGGTGTGCCCCCTTTCCTCCTGCACCGTGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGTGGGGATCTGCCCAACAGCCAGGAG         GCACTGCAGAAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101593 GGTGGGGATCTGCCCAACAGCCAGGAGGTG...CAGGCACTGCAGAAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTCTGATGTCACCCTGGTACCTGTGTCCTGCTCAGAACTGGAGAAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101823 CTCTGATGTCACCCTGGTACCTGTGTCCTGCTCAGAACTGGAGAAGGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GCGCCGGGCTCAGCTCCCTCTGCTTGGTGCTCAGCACACGCCCCCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101873 GCGCCGGGCTCAGCTCCCTCTGCTTGGTGCTCAGCACACGCCCCCACAGC