seq1 = pF1KE6655.tfa, 759 bp
seq2 = pF1KE6655/gi568815591r_43962767.tfa (gi568815591r:43962767_44165529), 202763 bp

>pF1KE6655 759
>gi568815591r:43962767_44165529 (Chr7)

(complement)

1-414  (100001-100414)   100% ->
415-595  (100518-100698)   100% ->
596-759  (102600-102763)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACTCACCGCCTCGTGATGGTCCGGCACGGCGAGAGCACATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACTCACCGCCTCGTGATGGTCCGGCACGGCGAGAGCACATGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGGAGAACCGTTTCTGTGGCTGGTTCGATGCAGAGCTGAGTGAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGGAGAACCGTTTCTGTGGCTGGTTCGATGCAGAGCTGAGTGAAAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGACCGAGGAGGCCAAGCGGGGAGCCAAGGCCATCAAGGATGCCAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGACCGAGGAGGCCAAGCGGGGAGCCAAGGCCATCAAGGATGCCAAGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGTTTGACATCTGCTACACGTCAGTGCTGAAGCGGGCCATCCGCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGTTTGACATCTGCTACACGTCAGTGCTGAAGCGGGCCATCCGCACCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGGGCCATCCTGGACGGCACGGACCAGATGTGGCTGCCTGTGGTGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGGGCCATCCTGGACGGCACGGACCAGATGTGGCTGCCTGTGGTGCGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTGGCGCCTCAATGAGCGGCATTACGGGGGCCTCACAGGCCTCAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTGGCGCCTCAATGAGCGGCATTACGGGGGCCTCACAGGCCTCAACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCAGAAACGGCCGCCAAGCACGGGGAGGAGCAGGTGAAGATCTGGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCAGAAACGGCCGCCAAGCACGGGGAGGAGCAGGTGAAGATCTGGAGGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCCTTCGACATCCCGCCGCCCCCGATGGACGAGAAGCACCCCTACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCCTTCGACATCCCGCCGCCCCCGATGGACGAGAAGCACCCCTACTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACTCCATTAGCAAG         GAGCGTCGGTACGCAGGCCTGAAGCCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACTCCATTAGCAAGGTG...CAGGAGCGTCGGTACGCAGGCCTGAAGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GGGGAACTCCCCACCTGCGAGAGCCTCAAGGACACCATTGCCCGGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100545 GGGGAACTCCCCACCTGCGAGAGCCTCAAGGACACCATTGCCCGGGCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCCCTTCTGGAACGAGGAGATTGTTCCCCAGATCAAGGCCGGCAAGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100595 GCCCTTCTGGAACGAGGAGATTGTTCCCCAGATCAAGGCCGGCAAGCGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGCTCATTGCAGCCCACGGGAACAGCCTGCGGGGCATTGTCAAGCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100645 TGCTCATTGCAGCCCACGGGAACAGCCTGCGGGGCATTGTCAAGCACCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GAAG         GGATGTCAGACCAGGCGATCATGGAGCTGAACCTGCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100695 GAAGGTG...TAGGGATGTCAGACCAGGCGATCATGGAGCTGAACCTGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CACGGGGATCCCCATTGTGTATGAGCTGAACAAGGAGCTGAAGCCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102637 CACGGGGATCCCCATTGTGTATGAGCTGAACAAGGAGCTGAAGCCCACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGCCCATGCAGTTCCTGGGTGATGAGGAAACGGTGCGGAAGGCCATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102687 AGCCCATGCAGTTCCTGGGTGATGAGGAAACGGTGCGGAAGGCCATGGAG

    750     .    :    .    :    .
    733 GCTGTGGCTGCCCAGGGCAAGGCCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||
 102737 GCTGTGGCTGCCCAGGGCAAGGCCAAG