seq1 = pF1KE6640.tfa, 678 bp
seq2 = pF1KE6640/gi568815579f_41777305.tfa (gi568815579f:41777305_41980977), 203673 bp

>pF1KE6640 678
>gi568815579f:41777305_41980977 (Chr19)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-379  (101686-101985)   100% ->
380-498  (102231-102349)   100% ->
499-567  (103366-103434)   100% ->
568-678  (103563-103673)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGGGGGTCCAGGAGTCCTCCAAGCTCTGCCTGCCACCATCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGGGGGTCCAGGAGTCCTCCAAGCTCTGCCTGCCACCATCTTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCTTCCTGCTGTCTGCTGTCTACCTGG         GCCCTGGGTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 CCTCTTCCTGCTGTCTGCTGTCTACCTGGGTA...CAGGCCCTGGGTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGCCCTGTGGATGCACAAGGTCCCAGCATCATTGATGGTGAGCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101698 AGGCCCTGTGGATGCACAAGGTCCCAGCATCATTGATGGTGAGCCTGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGACGCCCACTTCCAATGCCCGCACAATAGCAGCAACAACGCCAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101748 GAAGACGCCCACTTCCAATGCCCGCACAATAGCAGCAACAACGCCAACGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACCTGGTGGCGCGTCCTCCATGGCAACTACACGTGGCCCCCTGAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101798 CACCTGGTGGCGCGTCCTCCATGGCAACTACACGTGGCCCCCTGAGTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGGCCCGGGCGAGGACCCCAATGGTACGCTGATCATCCAGAATGTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101848 TGGGCCCGGGCGAGGACCCCAATGGTACGCTGATCATCCAGAATGTGAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGAGCCATGGGGGCATATACGTGTGCCGGGTCCAGGAGGGCAACGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101898 AAGAGCCATGGGGGCATATACGTGTGCCGGGTCCAGGAGGGCAACGAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ATACCAGCAGTCCTGCGGCACCTACCTCCGCGTGCGCC         AGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101948 ATACCAGCAGTCCTGCGGCACCTACCTCCGCGTGCGCCGTG...CAGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CGCCCCCCAGGCCCTTCCTGGACATGGGGGAGGGCACCAAGAACCGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102234 CGCCCCCCAGGCCCTTCCTGGACATGGGGGAGGGCACCAAGAACCGAATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATCACAGCCGAGGGGATCATCCTCCTGTTCTGCGCGGTGGTGCCTGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102284 ATCACAGCCGAGGGGATCATCCTCCTGTTCTGCGCGGTGGTGCCTGGGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCTGCTGCTGTTCAGG         AAACGATGGCAGAACGAGAAGCTCG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102334 GCTGCTGCTGTTCAGGGTG...CAGAAACGATGGCAGAACGAGAAGCTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGTTGGATGCCGGGGATGAATATGAAGATGAAAACCTTTATGAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103391 GGTTGGATGCCGGGGATGAATATGAAGATGAAAACCTTTATGAAGTG...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    568    GGCCTGAACCTGGACGACTGCTCCATGTATGAGGACATCTCCCGGGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103560 CAGGGCCTGAACCTGGACGACTGCTCCATGTATGAGGACATCTCCCGGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCTCCAGGGCACCTACCAGGATGTGGGCAGCCTCAACATAGGAGATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103610 CCTCCAGGGCACCTACCAGGATGTGGGCAGCCTCAACATAGGAGATGTCC

    700     .    :
    665 AGCTGGAGAAGCCG
        ||||||||||||||
 103660 AGCTGGAGAAGCCG