seq1 = pF1KE6637.tfa, 645 bp
seq2 = pF1KE6637/gi568815581f_29149141.tfa (gi568815581f:29149141_29354346), 205206 bp

>pF1KE6637 645
>gi568815581f:29149141_29354346 (Chr17)

1-31  (97724-97754)   100% ->
32-96  (100002-100066)   100% ->
97-215  (101042-101160)   100% ->
216-357  (102924-103065)   100% ->
358-500  (104500-104642)   100% ->
501-645  (105062-105206)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACCCAGGCTGAGCAGCAGGAGCTGG         AAACCCTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  97724 ATGGAGACCCAGGCTGAGCAGCAGGAGCTGGGTG...CAGAAACCCTTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AACCACCAAGATGGCTCAGACCAACCCTACGCCGGGGTCCCTGGGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 AACCACCAAGATGGCTCAGACCAACCCTACGCCGGGGTCCCTGGGGCCAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAAG         ATAACCATCTATGATCAGGAGAACTTTCAGGGCAAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 GGAAGGTA...CAGATAACCATCTATGATCAGGAGAACTTTCAGGGCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AGGATGGAGTTCACCAGCTCCTGTCCAAATGTCTCTGAGCGCAGTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101078 AGGATGGAGTTCACCAGCTCCTGTCCAAATGTCTCTGAGCGCAGTTTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TAATGTCCGGTCCCTGAAGGTGGAAAGTGGCGC         CTGGATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101128 TAATGTCCGGTCCCTGAAGGTGGAAAGTGGCGCGTG...CAGCTGGATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GTTATGAGCATACCAGCTTCTGTGGGCAACAGTTTATCCTGGAGAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102932 GTTATGAGCATACCAGCTTCTGTGGGCAACAGTTTATCCTGGAGAGAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAATACCCTCGCTGGGATGCCTGGAGTGGGAGTAATGCCTACCACATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102982 GAATACCCTCGCTGGGATGCCTGGAGTGGGAGTAATGCCTACCACATTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCGTCTCATGTCCTTCCGCCCCATCTGTTCAGCT         AATCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 103032 GCGTCTCATGTCCTTCCGCCCCATCTGTTCAGCTGTG...CAGAATCATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGGAGTCTAAGATGACCATCTTTGAGAAGGAAAACTTTATTGGACGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104507 AGGAGTCTAAGATGACCATCTTTGAGAAGGAAAACTTTATTGGACGCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGGGAGATCTCTGACGACTACCCCTCCTTGCAAGCCATGGGCTGGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104557 TGGGAGATCTCTGACGACTACCCCTCCTTGCAAGCCATGGGCTGGTTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAACGAAGTCGGCTCCATGAAGATACAAAGTGGGGC         CTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104607 CAACGAAGTCGGCTCCATGAAGATACAAAGTGGGGCGTA...TAGCTGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTTGCTACCAATATCCTGGATATCGTGGGTATCAGTATATCTTGGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105067 TTTGCTACCAATATCCTGGATATCGTGGGTATCAGTATATCTTGGAATGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GACCATCATGGAGGAGACTATAAACATTGGAGAGAGTGGGGCTCTCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105117 GACCATCATGGAGGAGACTATAAACATTGGAGAGAGTGGGGCTCTCATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCAGACTTCGCAGATCCAATCGATTCGCCGAATCCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105167 CCAGACTTCGCAGATCCAATCGATTCGCCGAATCCAACAG