seq1 = pF1KE6632.tfa, 741 bp
seq2 = pF1KE6632/gi568815581f_7483863.tfa (gi568815581f:7483863_7687548), 203686 bp

>pF1KE6632 741
>gi568815581f:7483863_7687548 (Chr17)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-169  (101870-101935)   100% ->
170-302  (102084-102216)   100% ->
303-388  (102830-102915)   100% ->
389-507  (103037-103155)   100% ->
508-618  (103299-103409)   100% ->
619-741  (103564-103686)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCGAGGCGGACGGACCGCTTAAACGGCTGCTCGTGCCGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCGAGGCGGACGGACCGCTTAAACGGCTGCTCGTGCCGATTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTACCTGAGAAATGCTACGACCAACTTTTCGTTCAGTGGGACTTGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTACCTGAGAAATGCTACGACCAACTTTTCGTTCAGTGGGACTTGCTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACG         TCCCCTGCCTCAAGATTCTCCTCAGCAAAGGCCTGGGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGGTG...CAGTCCCCTGCCTCAAGATTCTCCTCAGCAAAGGCCTGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGGCATTGTGGCTGGCTCACTTCTAG         TAAAGCTGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101908 CTGGGCATTGTGGCTGGCTCACTTCTAGGTA...TAGTAAAGCTGCCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGTGTTTAAAATCCTGGGAGCCAAGAGTGCTGAAGGGTTGAGTCTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102097 GGTGTTTAAAATCCTGGGAGCCAAGAGTGCTGAAGGGTTGAGTCTCCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGTAATGCTGGAGCTAGTGGCATTGACTGGGACCATGGTCTACAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102147 CTGTAATGCTGGAGCTAGTGGCATTGACTGGGACCATGGTCTACAGCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACTAACAACTTCCCATTCAG         CTCTTGGGGTGAAGCCTTATT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 102197 ACTAACAACTTCCCATTCAGGTG...CAGCTCTTGGGGTGAAGCCTTATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCTGATGCTCCAGACGATCACCATCTGCTTCCTGGTCATGCACTACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102851 CCTGATGCTCCAGACGATCACCATCTGCTTCCTGGTCATGCACTACAGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GACAGACTGTGAAAG         GTGTCGCTTTCCTCGCTTGCTACGGC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102901 GACAGACTGTGAAAGGTG...TAGGTGTCGCTTTCCTCGCTTGCTACGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGGTCCTGCTGGTGCTTCTCTCACCTCTGACGCCCTTGACTGTAGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103063 CTGGTCCTGCTGGTGCTTCTCTCACCTCTGACGCCCTTGACTGTAGTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCTGCTCCAGGCCTCCAATGTGCCTGCTGTGGTGGTGGGGAGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103113 CCTGCTCCAGGCCTCCAATGTGCCTGCTGTGGTGGTGGGGAGGGTG...T

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    508   CTTCTCCAGGCAGCCACCAACTACCACAACGGGCACACAGGCCAGCTC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103297 AGCTTCTCCAGGCAGCCACCAACTACCACAACGGGCACACAGGCCAGCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCAGCCATCACAGTCTTCCTGCTGTTTGGGGGCTCCCTGGCCCGAATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103347 TCAGCCATCACAGTCTTCCTGCTGTTTGGGGGCTCCCTGGCCCGAATCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CACTTCCATTCAG         GAAACCGGAGATCCCCTGATGGCTGGGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103397 CACTTCCATTCAGGTG...CAGGAAACCGGAGATCCCCTGATGGCTGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCTTTGTGGTCTCCTCTCTCTGCAACGGCCTCATCGCCACCCAGCTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 103592 CCTTTGTGGTCTCCTCTCTCTGCAACGGCCTCATCGCCGCCCAGCTGCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    697 TTCTACTGGAATGCAAAGCCTCCCCACAAGCAGAAAAAGGCGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103642 TTCTACTGGAATGCAAAGCCTCCCCACAAGCAGAAAAAGGCGCAG