seq1 = pF1KE6629.tfa, 870 bp
seq2 = pF1KE6629/gi568815590r_60108788.tfa (gi568815590r:60108788_60381147), 272360 bp

>pF1KE6629 870
>gi568815590r:60108788_60381147 (Chr8)

(complement)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-292  (101268-101459)   100% ->
293-417  (115099-115223)   99% ->
418-513  (148769-148864)   100% ->
514-576  (154213-154275)   100% ->
577-625  (156563-156611)   100% ->
626-738  (158387-158499)   100% ->
739-870  (172229-172360)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACCTGAGCTTCATCGAAGATACCGTCGCCTTCCCCGAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGACCTGAGCTTCATCGAAGATACCGTCGCCTTCCCCGAGAAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGATGAGGAGGAAGAAGAGGAGGGTGTGGAGTGGGGCTACGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGGATGAGGAGGAAGAAGAGGAGGGTGTGGAGTGGGGCTACGAGGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          GTGTTGAGTGGGGTCTGGTGTTTCCTGATGCTAATGGGGAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTA...TAGGTGTTGAGTGGGGTCTGGTGTTTCCTGATGCTAATGGGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACCAGTCTCCTATTAACCTAAACTCAAGAGAGGCTAGGTATGACCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101309 TACCAGTCTCCTATTAACCTAAACTCAAGAGAGGCTAGGTATGACCCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGTTGGATGTCCGCCTCTCCCCAAATTATGTGGTGTGCCGAGACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101359 GCTGTTGGATGTCCGCCTCTCCCCAAATTATGTGGTGTGCCGAGACTGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGTCACCAATGATGGACATACCATTCAGGTTATCCTGAAGTCAAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101409 AAGTCACCAATGATGGACATACCATTCAGGTTATCCTGAAGTCAAAATCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 G         TTCTTTCGGGAGGACCATTGCCTCAAGGGCATGAGTTTGA
        |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 101459 GGTA...CAGTTCTTTCGGGAGGACCATTGCCTCAAGGGCATGAATTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACTGTACGAAGTGAGATTTCACTGGGGAAGAGAAAACCAGCGTGGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115139 ACTGTACGAAGTGAGATTTCACTGGGGAAGAGAAAACCAGCGTGGTTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCACACGGTTAATTTCAAAGCTTTTCCCATGGAG         CTCCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 115189 AGCACACGGTTAATTTCAAAGCTTTTCCCATGGAGGTA...CAGCTCCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGATCCACTGGAACTCCACTCTGTTTGGCAGCATTGATGAGGCTGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148775 CTGATCCACTGGAACTCCACTCTGTTTGGCAGCATTGATGAGGCTGTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAAGCCGCACGGAATCGCCATCATTGCTCTGTTTGTTCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 148825 GAAGCCGCACGGAATCGCCATCATTGCTCTGTTTGTTCAGGTA...CAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TAGGAAAGGAACATGTTGGCTTGAAGGCTGTGACTGAAATCCTCCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154214 TAGGAAAGGAACATGTTGGCTTGAAGGCTGTGACTGAAATCCTCCAAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATTCAGTATAAG         GGGAAGTCCAAAACAATACCTTGCTTTAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 154264 ATTCAGTATAAGGTA...CAGGGGAAGTCCAAAACAATACCTTGCTTTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCCTAACACTTTATTACCAG         ACCCTCTGCTGCGGGATTACT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 156592 TCCTAACACTTTATTACCAGGTG...CAGACCCTCTGCTGCGGGATTACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GGGTGTATGAAGGCTCTCTCACCATCCCACCTTGCAGTGAAGGTGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158408 GGGTGTATGAAGGCTCTCTCACCATCCCACCTTGCAGTGAAGGTGTCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TGGATATTATTCCGATACCCTTTAACTATATCCCAGCTACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 158458 TGGATATTATTCCGATACCCTTTAACTATATCCCAGCTACAGGTG...CA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    739  ATAGAAGAATTTCGAAGGCTGAGGACACATGTTAAGGGGGCAGAACTTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172228 GATAGAAGAATTTCGAAGGCTGAGGACACATGTTAAGGGGGCAGAACTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGGAAGGCTGTGATGGGATTTTGGGAGACAACTTTCGGCCCACTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172278 TGGAAGGCTGTGATGGGATTTTGGGAGACAACTTTCGGCCCACTCAGCCT

    900     .    :    .    :    .    :
    838 CTTAGTGACAGAGTCATTAGAGCTGCATTTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 172328 CTTAGTGACAGAGTCATTAGAGCTGCATTTCAG